Haplogrup A-L1085 - Haplogroup A-L1085

Haplogroup A0-T olarak da bilinen Haplogroup A-L1085 , bir insan Y-DNA haplogrubudur . Bugün yaşayan hemen hemen tüm insanların baba soyunun bir parçasıdır. SNP L1085 iki rol oynamıştır popülasyon genetiği : ilk olarak, en Y-DNA haplogroups sahip ayrışmış o ve arasından; ikinci olarak, ayrılmamış bazal kanadı A-L1085* tanımlar.

A0-T'nin iki ana dalı vardır: A-V148 (haplogroup A0 olarak da bilinir) ve haplogroup A-P305 (haplogroup A1).

Menşei

Haplogrup A, Khoisan halkı arasında yaygındır .

Haplogrup A-L1085'in kökenine ilişkin birçok öneri, onun Güney Afrika'nın avcı-toplayıcılarının atalarının nüfusuyla ilişkili olduğunu öne sürüyor. Bunun nedeni, San halkı arasında haplogrup A-L1085 soylarının sık olmasıdır .

Ancak, Güney Afrika'nın A-L1085 soyları, Afrika'nın diğer bölgelerinde bulunan A soyunun alt dallarıdır . Bu, A-L1085 soylarının Güney Afrika'ya başka yerlerden geldiğini gösteriyor. Haplogroup A-L1085, A-V148 ve A-P305'in en temel iki soyu Batı Afrika, Kuzeybatı Afrika ve Orta Afrika'da tespit edilmiştir. Cruciani ve ark. 2011, bu soyların Orta ve Kuzeybatı Afrika arasında bir yerde ortaya çıkmış olabileceğini öne sürüyor, ancak böyle bir yorum, Afrika y-kromozomlarının eksik coğrafi kapsamı nedeniyle hala ön hazırlık niteliğinde.

İlk çalışmalar, Haplogroup A-L1085 soylarının yaklaşık 60.000 yıl önce ortaya çıktığını ve 150-200kya arasında birleşen mitokondriyal DNA soyları için TMRCA'dan önemli ölçüde daha yeni olduğunu bildirdi. Cruciani ve ark. 2011 yılı, dalların büyük ölçüde yeniden yapılandırılmasıyla Y kromozom ağacının kökünü 142.000 yıl öncesine geri itti.

Kasım 2012'de Scozzari ve ark. A1b haplogroup için Afrika kıtasının kuzey-batı çeyreğinde bir köken hipotezini güçlendirdi ve orta-batı Afrika'daki eski Y-Kromozom soylarının son bulgularıyla birlikte, insan MSY'sinin coğrafi kökenine ilişkin yeni kanıtlar sağladı. çeşitlilik".

Coğrafi dağılım

Orta Afrika

Haplogroup A-M13 kuzey Kamerun (2/9 = %22 Tupuri , 4/28 = %14 Mandara , 2/17 = %12 Fulbe ) ve doğu DRC (2/9 = %22 Alur , 1 ) popülasyonlarında gözlemlenmiştir. /18 = %6 Hema , 1/47 = %2 Mbuti ).

Haplogroup A-M91(xA-M31,A-M6,A-M32), Güney Kamerun'daki Bakola halkında (3/33 = %9) gözlemlendi .

Herhangi bir subclade için test olmadan haplogrouptarafından A-L1085 çeşitli popülasyonların örnekleri gözlenmiştir Gabon bir örnek 9 (% 3/33) de dahil olmak üzere, Baka bir numunenin,% 3 (1/36) Ndumu ,% 2 (1/46) bir örneğinin Dumanın , bir örnek% 2 (1/57) Nzebi ve bir numune% 2 (1/60) tsogo .

Doğu Afrika

Haplogrup A-M13, Güney Sudanlılar (%53), özellikle Dinkalar (%61,5 ) arasında yaygındır . Haplogroup A-M13 , 1/40 A-M171 dahil olmak üzere %45 (18/40) sıklıkta bir Güney Sudan popülasyonunun başka bir örneğinde de gözlemlenmiştir . Haplogrup A ayrıca bir Amhara örneğinin %14,6'sında (7/48), Oromo örneğinin %10,3'ünde (8/78), Etiyopya'dan başka bir örneğin %13,6'sında (12/88) ve bir örneğin %41'inde rapor edilmiştir. arasında Beta İsrail (ve ark. 2002 Cruciani) ve önemli yüzdelere de (. 2004 14%, Luis vd) Kenya'da Bantus tarafından paylaşılır ve Iraqw Luis (Tanzanya (3/43 =% 7.0 ve ark. 2004) 1/6 = %17 (Knight ve diğerleri 2003)).

Kuzey Afrika

A1 alt bölümü Libya Berberilerinde gözlenirken, A-M13 alt bölümü Mısırlı erkeklerin yaklaşık %3'ünde gözlenmiştir .

Güney Afrika

Bir çalışma, %10 ile %70 arasında değişen sıklıkta Khoisanca konuşan çeşitli kabilelerin örneklerinde A haplogrup A buldu . Şaşırtıcı bir şekilde, bu özel haplogrouptarafından bir numunede bulunmamıştır Hadzabe almasından dolayı Tanzanya dan, geleneksel olarak Khoisans eski bir kalıntı olarak kabul nüfusu tıklama ünsüzler kendi dillerinde.

Avrupa

Haplogrup A, İngiltere'de Avrupalı ​​erkeklerde A1 olarak gözlemlenmiştir. AY kromozomu ayrıca Küçük Asya'da, Orta Doğu'da ve bazı Akdeniz adalarında, Ege Yunanlılar, Sicilyalılar (Capo d'Orlando'da A1a'nın %0.2'si ve tüm adada A1b'nin %0.5'i ), Filistinliler arasında düşük sıklıkta gözlenmiştir. , Ürdünlüler ve Yemenliler. Herhangi bir alt dal için test yapılmadan , Ege adası Midilli'deki Mitilini'den bir Yunanlı örneğinde haplogrup A1b gözlemlendi ve A1b ayrıca İberyalı Yahudilerin %0.1'inde gözlendi . Bir araştırmanın yazarları, bir Kıbrıslı örneğinin %3,1'inde (2/65) A haplogrup A gibi görünen bir şey bulduklarını bildirdiler , ancak bu bireylerden herhangi birinin haplogrup B'ye ait olma olasılığını kesin olarak dışlamadılar.

alt sınıf dağılımı

Haplogrup A (Y-DNA) ve onun soyundan gelenlerin saptırılması.

A-V148* (A0)*)

A-V148, A0-T'deki iki ana daldan biridir.

A-P305* (A1*)

Haplogroup A-P305*, Avrupa ve Batı Asya'da bir avuç vaka bildirilmiş olsa da , büyük ölçüde Afrika'nın bazı bölgeleriyle sınırlıdır .

A-P305 en yüksek oranlarda bulunur Bakola Pigmeler (Güney Kamerun 8.3 ve% at) Berberiler gelen Cezayir % 1.5 ve Gana . Klad aynı zamanda Güney Afrika'daki Buşman avcı-toplayıcı popülasyonlarında yüksek frekanslara ulaşır ve Doğu Afrika'daki birçok Nilotik grup tarafından yakından takip edilir . Bununla birlikte, haplogrup A'nın en eski alt dalları yalnızca Orta - Kuzeybatı Afrika'da bulunur ve burada onun ve dolayısıyla Y kromozomu Adem'in yaklaşık 140.000 yıl önce ortaya çıktığına inanılır. Klad ayrıca Etiyopya'daki belirli popülasyonlarda ve ayrıca Orta Afrika'daki bazı Pigme gruplarında dikkate değer sıklıkta gözlemlenmiştir .

Haplogroup A-L1085, büyük ölçüde E1b1a sınıfına ait olan Nijer-Kongo konuşmacıları arasında daha az yaygındır . Haplogroup E'nin genel olarak Kuzeydoğu Afrika'da ortaya çıktığına inanılıyor ve daha sonra Bantu genişlemesi ile yaklaşık 5.000 yıl önce Orta, Güney ve Güneydoğu Afrika'ya yayıldığı Batı Afrika'ya tanıtıldı . Wood et al. (2005) ve Rosa ve ark. (2007), Batı Afrika'daki bu tür nispeten yeni nüfus hareketleri, Orta, Güney ve Güneydoğu Afrika'da önceden var olan Y popülasyonu kromozom çeşitliliğini değiştirmiş ve bu bölgelerdeki önceki haplogrupları şimdi baskın E1b1a soylarıyla değiştirmiştir. Bununla birlikte, bugün bu bölgelerde , Mbuti Pigmeleri ve Khoisan gibi belirli kalıntı popülasyonlarında yaygın olan Y DNA haplogrupları A-M91 ve B- M60'ın mevcudiyeti yoluyla, atalarının sakinlerinin izleri gözlemlenebilir .

3551 Afrikalı erkekten oluşan birleşik bir örnekte, Haplogrup A'nın sıklığı %5,4'tür. Haplogrup A'nın en yüksek frekansları Güney Afrika'daki Khoisan , Beta İsrail ve Nilo-Sahralılar arasında rapor edilmiştir .

A-M31

A-M31 alt bölümü, Gine-Bissau'da , özellikle Papel-Manjaco-Mancanha (5/64 = %7.8) arasında çeşitli etnik grupların yedi örneğinden oluşan bir havuzun yaklaşık %2.8'inde (8/282) bulunmuştur . Daha önceki bir çalışma, Gonçalves ve ark. 2003, Gine-Bissau'dan alınan numunenin %5,1'inde (14/276) ve Cabo Verde'den alınan bir çift numunenin %0,5'inde (1/201) A-M31 bulduğunu bildirdi . Başka bir çalışmada yazarlar bir örneğinin% 5 (2/39) A-M31 haplogrouptarafından bulma bildirmiştir Mandinka gelen Senegambia ve bir numune% 2 (1/55) Dogon gelen Mali . Haplogroup A-M31, aynı zamanda, bir numunede% 3 (2/64) 'de bulunmuştur Berberîler gelen Fas ve gelen belirtilmemiş etnik köken bir örneği% 2.3 (1/44) Mali .

Yorkshire , İngiltere'de atasal kökenleri olan ve ayırt edici soyadı Revis'i paylaşan en az yedi erkeğin, A-M31 alt sınıfına ait olduğu tespit edildi. Haber raporları, erkeklerin fenotipik olarak "Avrupalı" olduklarını ve herhangi bir Afrika soyundan habersiz olduklarını ileri sürdü. Daha sonraki araştırmalar, 18. yüzyılda ortak bir babasoylu ata paylaştıklarını ileri sürdü.

A-M6

A-M6 (eski adıyla A2) tipik olarak Khoisan halkları arasında bulunur. Bir çalışmanın yazarları, Tsumkwe San örneğinin %28'inde (8/29) ve !Kung /Sekele örneğinin %16'sında (5/32) haplogrup A-M6(xA-P28) ve haplogrup bulduğunu bildirmiştir. A-P28, Tsumkwe San örneğinin %17'si (5/29), !Kung /Sekele örneğinin %9'u (3/32) , Nama örneğinin %9'u (1/11) ve %6'sı (1/18) bir Dama örneğinin . Başka bir çalışmanın yazarları, 5/39 A-M6(xA-M114) ve 1/39 A-M114 dahil olmak üzere bir Khoisan erkek örneğinin %15,4'ünde (6/39) A-M6 haplogrup A-M6 bulduğunu bildirmiştir.

A-M32

A-M32 (eski adıyla A3) klan, A-L1085 haplogroup'un en kalabalık dallarını içerir ve esas olarak Doğu Afrika ve Güney Afrika'da bulunur .

A-M28

A-M28 (eski adıyla A3a) alt kanadı , Afrika Boynuzu'nda yalnızca nadiren gözlenmiştir . Etiyopya'dan Güney Sami dillerini konuşanların karışık bir örneğinin %5'inde (1/20), Etiyopyalıların %1.1'i (1/88) ve Somalililerin %0.5'inde (1/201).

A-M51

A-M51 (önceden A3b1) alt bölümü en sık Khoisan halkları arasında görülür (6/11 = %55 Nama , 11/39 = %28 Khoisan, 7/32 = %22 !Kung /Sekele, 6/29 = %21 Tsumkwe San, 1/18 = %6 Dama). Bununla birlikte, aynı zamanda, daha düşük seviyelerde frekans ile bulunmuştur bantular arasında Güney Afrika'da 2/28 =% 7 de dahil olmak üzere, Sotho-Setsvana , 3/53 =% 6 olmayan Khoisan Güney Afrikalı, 4/80 =% 5 Xhosa ve 1 /29 = %3 Zulu .

A-M13

Doğu Afrika ve Kuzey Kamerun'da yaygın olarak bulunan A-M13 (eski adıyla A3b2) alt bölümü, Khoisan örneklerinde bulunanlardan farklıdır ve bunlarla yalnızca uzaktan ilişkilidir. Bu bulgu, eski bir farklılığa işaret ediyor.

İçinde Sudan , haplogrouptarafından A-M13 28/53 =% 52.8 bulunmuştur Güney Sudan ait 13/28 =% 46,4 Nuba merkezi Sudan ait 25/90 =% 27.8 Batı Sudan , 4/32 =% 12.5 yerel Hausa halkının ve 5/216 = Kuzey Sudanlıların %2,3'ü.

Gelen Etiyopya , bir çalışma örneğinin% 14.6 (7/48), A-M13 haplogrouptarafından bulma bildirdi Amhara ve bir numunenin% 10.3 (8/78) Oromo . Başka bir çalışma, Etiyopyalılardan oluşan karışık bir örneğin %6,8'inde (6/88) haplogrup A-M118 ve haplogrup A-M13(xA-M171, A-M118)'in %5,7'sinde (5/88) bulunduğunu bildirmiştir. %12,5 (11/88) A-M13.

Haplogrup A-M13 , Türkiye'nin Ege Bölgesi'nde (2/30 = %6,7), Yemen Yahudilerinde (1/20 = %5), Mısır'da (4/147 = 2,7 ) olduğu gibi Orta ve Doğu Afrika dışında da zaman zaman gözlemlenmiştir. % 3/92 =% 3.3), Filistin Arapları (2/143 =% 1.4), Sardinya (1/77 =% 1.3, 1/22 =% 4.5), sermaye Jordan , Amman (1/101 = 1 %) ve Umman (1/121 = %0.8).

filogenetik

filogenetik tarih

2002'den önce, akademik literatürde Y-Kromozom Filogenetik ağacı için en az yedi adlandırma sistemi vardı. Bu önemli bir kafa karışıklığına neden oldu. 2002 yılında, büyük araştırma grupları bir araya geldi ve Y-Chromosome Consortium'u (YCC) kurdu. Hepsinin kullanmayı kabul ettiği yeni bir ağaç oluşturan ortak bir makale yayınladılar. Daha sonra, popülasyon genetiği ve genetik şecere ile ilgilenen bir grup vatandaş bilim adamı, her şeyin üzerinde olmayı hedefleyen amatör bir ağaç oluşturmak için bir çalışma grubu oluşturdu. Aşağıdaki tablo, tüm bu çalışmaları 2002 YCC Ağacı'nın dönüm noktası noktasında bir araya getiriyor. Bu, daha eski yayınlanmış literatürü inceleyen bir araştırmacının terminolojiler arasında hızlı bir şekilde hareket etmesine olanak tanır.

Orijinal araştırma yayınları

Aşağıdaki araştırma ekipleri, yayınlarına göre YCC Ağacının oluşturulmasında temsil edildi.

cruciani 2011

Cruciani ve diğerleri tarafından revize edilmiş y-kromozom aile ağacı. 2011, Karafet ve ark. 2008. A1b artık ISOGG'ye göre A0 olarak biliniyor.

Haplogroup A ağacının anlaşılmasında büyük bir değişim ( Cruciani 2011 )' in yayınlanmasıyla geldi . İnsan y-kromozomunun Başlangıç dizilemesi Y kromozom aile ağacındaki birinci bölme ile ilgili haplogroup A ayrılmış M91 mutasyonu ile meydana önerilen Haplogrup BT . Bununla birlikte, Y-kromozom ağacındaki en derin bölünmenin, Haplogroup A ve Haplogroup BT arasında değil, daha önce rapor edilen Haplogroup A'nın iki alt grubu arasında bulunduğu bilinmektedir. A1b ve A1a-T alt grupları artık doğrudan ağacın kökünden iner. Y-kromozom aile ağacının yeniden düzenlenmesi, Haplogrup A olarak sınıflandırılan soyların mutlaka bir monofiletik dal oluşturmadığı anlamına gelir . Haplogrup A bu nedenle Haplogroup BT'yi tanımlayan belirteçlere sahip olmayan bir soy koleksiyonunu ifade eder, ancak haplogroup A içindeki birçok soy sadece çok uzaktan ilişkilidir. harv hatası: hedef yok: CITEREFCruciani2011 ( yardım )

M91 ve P97 mutasyonları gelen Haplogroup A ayırt Haplogroup BT . Haplogroup A kromozomları içinde, M91 markörü, 8 T nükleobaz biriminden oluşan bir uzantıdan oluşur . Haplogroup BT ve şempanze kromozomlarında bu markör 9 T nükleobaz biriminden oluşur . Bu model, Haplogroup BT'nin 9T uzantısının atadan kalma versiyon olduğunu ve Haplogroup A'nın bir nükleobazın silinmesiyle oluştuğunu ileri sürdü .

Ancak Cruciani ve ark. 2011, M91 işaretçisini çevreleyen bölge, tekrarlayan mutasyonlara eğilimli bir mutasyonel etkin noktadır. Bu nedenle Haplogroup A'nın 8T uzantısının M91'in atadan kalma durumu olması ve Haplogroup BT'nin 9T'sinin 1T'nin eklenmesiyle ortaya çıkan türetilmiş durum olması mümkündür . Bu, Haplogroup A'nın en derin dalları olan A1b ve A1a-T alt bölümlerinin neden her ikisinin de 8T gerilmesine sahip olduğunu açıklar. Ayrıca, Cruciani ve ark. 2011, aynı zamanda haplogrup A'yı tanımlamak için kullanılan P97 işaretçisinin, haplogrup A'da atasal duruma, ancak Haplogrup BT'de türetilmiş duruma sahip olduğunu belirledi .

filogenetik ağaçlar

Haplogroup alt dallarının bu filogenetik ağacı, Y-Kromozom Konsorsiyumu (YCC) Ağacına, ISOGG Y-DNA Haplogroup Ağacına ve daha sonra yayınlanan araştırmalara dayanmaktadır.

Y kromozomu Adem

• A0 (önceden A1b) (P305, V148, V149, V154, V164, V166, V172, V173, V177, V190, V196, V223, V225, V229, V233, V239)
• A1 (Cruciani 2011'e göre A1a-T) (L985, L989, L990, L1002, L1003, L1004, L1009, L1013, L1053, V161, V168, V171, V174, V203, V238, V241, V250, V238, V241, V250 )
  • A1a (M31, P82, V4, V14, V15, V25, V26, V28, V30, V40, V48, V53, V57, V58, V63, V76, V191, V201, V204, V214, V215, V236)
  • A1b (Cruciani 2011'e göre A2-T) (P108, V221)
    • A1b1 (L419)
      • A1b1a (V50, V82, V198, V224)
        • A1b1a1 eski adıyla A2 (M14, M23, L968/M29/P3/PN3, M71, M135, M141, M206, M276/P247, M277/P248, MEH1, P4, P5, P36.1, Sayfa71, Sayfa87, Sayfa95)
          • A1b1a1a (M6, M196)
            • A1b1a1a1 (M212)
              • A1b1a1a1a eskiden A2a (M114)
              • A1b1a1a1b eskiden A2b (P28)
              • A1b1a1a1c eskiden A2c (P262)
      • A1b1b eskiden A3 (M32)
        • A1b1b1 eskiden A3a (M28, M59)
        • A1b1b2 eski adıyla A3b (M144, M190, M220, P289)
          • A1b1b2a eskiden A3b1 (M51, P100, P291)
            • A1b1b2a1 eskiden A3b1a (P71, P102)
          • A1b1b2b eski adıyla A3b2 (M13, M127, M202, M219, M305):
            • A1b1b2b1 (M118)
    • BT (M42, M94, M139, M299, M60, M181/Page32, P85, P90, P97, Page65.1/SRY1532.1/SRY10831.1, V21, V29, V31, V59, V64, V102, V187, V202, V216, V235)

Ayrıca bakınız

Genetik

Y-DNA A alt grupları

Y-DNA omurga ağacı

Referanslar