Paragrup - Paragroup

Paragroup , popülasyon genetiğinde , herhangi bir ek benzersiz belirteç tarafından tanımlanmayan bir haplogroup içindeki soyları tanımlamak için kullanılan bir terimdir .

Olarak insan Y kromozomu DNA haplogroups , paragroups tipik olarak bir ile temsil edilir , yıldız işareti ( * ana haplotiplere sonra yerleştirilir).

"Paragrup" terimi, parafiletik haplogrup terimlerinin , paragrupların parafiletik alt kladlar oluşturduğunu gösteren bir portmantosudur . Ana haplogrubu tanımlayan mutasyonlar dışında, paragruplar herhangi bir ek benzersiz işarete sahip olmayabilir. Alternatif olarak, paragruplar keşfedilmemiş benzersiz işaretlere sahip olabilir. Bir paragrup içinde benzersiz bir işaretleyici keşfedilirse, belirli soy benzersiz bir ad verilir ve bağımsız bir alt grup oluşturmak için paragrubu dışına taşınır.

Örneğin, insan Y-DNA Haplogroup DE'nin paragrubu DE*'dir. DE*'nin bir üyesi, DE'yi tanımlayan işarete sahiptir, ancak DE'nin yalnızca bilinen doğrudan alt sınıflarını, haplogrupları D ve E'yi tanımlayan işaretlere sahip değildir . Benzer şekilde, haplogroup E1b1b1g (E-M293 olarak da bilinir), önceden belirlenmiş bir paragrup içinde keşfedilen ve yeni bir isim atanan nispeten yeni bir alt klad örneğidir. SNP/UEP markörü M293 2008'de keşfedilene kadar, alt klad üyeleri, E1b1b1* paragrubunun (E3b* ve E-M35* olarak da bilinir) diğer bileşenlerinden ayırt edilemezdi.

Başka bir örnek, Y-DNA haplogrup R'nin bir üyesidir (marka M207 ile tanımlanır). Bu mutasyonların hiçbirine sahip olmayan bireyler, haplogrup R*'a ait olarak kategorize edilecektir.

Referanslar

  1. ^ a b Y Kromozom Konsorsiyumu, TYC (2002). "İnsan Y-Kromozomal İkili Haplogroups Ağacı için Bir Adlandırma Sistemi" (PDF) . Genom Araştırması . Cold Spring Harbor Laboratuvar Basın. 12 (2): 339–48. doi : 10.1101/gr.217602 . PMC  155271 . PMID  11827954 .
  2. ^ Weale, Michael E.; et al. (2003). "İnsanlarda Nadir Derin Köklü Y Kromozom Soyları: Filocoğrafya Dersleri" . Genetik . 165 (1): 229–34. doi : 10.1093/genetics/165.1.229 . PMC  1462739 . PMID  14504230 .
  3. ^ Henn, BM; et al. (2008). "Tanzanya üzerinden Güney Afrika'ya bir pastoralist göçün Y-kromozomal kanıtı" . Amerika Birleşik Devletleri Ulusal Bilimler Akademisi Bildirileri . PNAS. 105 (31): 10693-8. Bibcode : 2008PNAS..10510693H . doi : 10.1073/pnas.0801184105 . PMC  2504844 . PMID  18678889 .


İnsan mitokondriyal DNA'sının (mtDNA) haplogruplarının filogenetik ağacı

  Mitokondriyal Havva ( L )    
L0 L1-6  
L1 L2   L3     L4 L5 L6
m n  
CZ NS E G Q   Ö A S r   ben W x Y
C Z B F R0   JT öncesi   P   sen
YG JT K
H V J T


İnsan Y kromozomu DNA haplogruplarının filogenetik ağacı
" Y kromozomlu Adam "
A00 A0-T 
A0 A1 
A1a A1b
A1b1 BT
B BT
DE CF
NS E C F
F1  F2  F3  GHIJK
G HİJK
IJK H
IJ K
ben   J     LT        K2 
L     T    K2a         K2b      K2c     K2d K2e   
K-M2313      K2b1  P 
NUMARA   S   m     P1     P2
n Ö Q r