IRF5 - IRF5

IRF5
Mevcut yapılar
PDB	Ortologtur arama: PDBe RCSB
PDB kimlik kodlarının listesi
	3DSH
tanımlayıcılar
takma adlar	IRF5 , SLEB10, interferon düzenleyici faktör 5
Harici kimlikler	OMIM : 607218 MGI : 1350924 HomoloGene : 8088 GeneCards : IRF5
Gen konumu ( İnsan )
Chr.	Kromozom 7 (insan)
Son	128.950.038 baz puan
Gen konumu ( Fare )
Chr.	Kromozom 6 (fare)
Son	29.541.871 baz puan
RNA ifade modeli
	; ;
	Daha fazla referans ifade verisi
Gen ontolojisi
moleküler fonksiyon	• DNA bağlama ; • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA bağlama transkripsiyon faktörü aktivitesi ; • GO:0001948 protein bağlama ; • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO: 0001205 DNA bağlayıcı transkripsiyon aktivatör aktivitesi, RNA polimeraz II'ye özgü ; • diziye özgü DNA bağlanması ; • özdeş protein bağlanması ; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA bağlayıcı transkripsiyon faktörü aktivitesi, RNA polimeraz II'ye özgü;
Hücresel bileşen	• sitoplazma ; • sitozol ; • çekirdek;
biyolojik süreç	• transkripsiyon regülasyonu, DNA-temelli ; • interlökin-12 üretiminin pozitif regülasyonu ; • interferon-gama aracılı sinyal yolu ; • bağışıklık sistemi süreci ; • RNA polimeraz II tarafından transkripsiyonun regülasyonu ; • interferon-alfa üretiminin pozitif regülasyonu ; • muramil dipeptide yanıt ; • transkripsiyon, DNA-şablonlu ; • virüse karşı savunma yanıtı ; • tip I interferon sinyal yolu ; • peptidoglikana yanıt ; • apoptotik sürecin pozitif regülasyonu ; • doğuştan gelen immün yanıt ; • RNA polimeraz II tarafından transkripsiyonun pozitif regülasyonu ; • interferon-beta üretiminin pozitif regülasyonu ; • sitokin- aracılı sinyal yolu ; • RNA polimeraz II tarafından transkripsiyon;
	Kaynaklar: Amigo / QuickGO
ortologlar
	3663
	27056
	ENSG00000128604
	ENSMUSG00000029771
	Q13568
	P56477
NM_001098627 ; NM_001098629 ; NM_001098630 ; NM_001242452 ; NM_032643;
	NM_001347928 ; NM_001364314
	NM_001252382 ; NM_012057 ; NM_001311083
NP_001092097 ; NP_001092099 ; NP_001092100 ; NP_001229381 ; NP_116032;
	NP_001334857 ; NP_001351243 ; NP_001092099,1
	NP_001239311 ; NP_001298012 ; NP_036187
	Vikiveri
İnsan Görüntüle/Düzenle	Fareyi Görüntüle/Düzenle

Düzenleyici faktör 5 İnterferon bir olan protein insanlarda tarafından kodlandığını IRF5 geni . IRF ailesi, memelilerde belirli hücresel fonksiyonların düzenlenmesi ile birlikte virüs yanıtları için sinyal vermede yer alan bir grup transkripsiyon faktörüdür.

İşlev

IRF5 interferon düzenleyici faktör (IRF) ailesinin bir üyesidir, interferonun virüs aracılı aktivasyonu ve hücre büyümesi, farklılaşması, apoptoz ve bağışıklık sistemi aktivitesinin modülasyonu dahil olmak üzere çeşitli rollere sahip bir transkripsiyon faktörleri grubudur . IRF ailesinin üyeleri, triptofan (W) tekrarları içeren korunmuş bir N-terminal DNA-bağlanma alanı ile karakterize edilir . Farklı izoformları kodlayan alternatif ek varyantları mevcuttur. IRF ailesinin düzenleyici ve baskılama bölgeleri esas olarak IRF'nin C-terminalinde bulunur.

Bir 2020 çalışması, TASL adlı bir adaptör proteinin, pLxIS motifinde fosforile edilerek IRF5 aktivasyonunda önemli bir düzenleyici rol oynadığını ve adaptör proteinleri MAVS, STING ve TRIF yoluyla IRF3 aktivasyon yoluna benzer bir analoji çizdiğini gösterdi.

Klinik önemi

IRF5, makrofajların inflamasyonu teşvik edip etmeyeceğini kontrol eden moleküler bir anahtar görevi görür . Makrofajlarda IRF5 üretiminin bloke edilmesi, çok çeşitli otoimmün hastalıkların tedavisine yardımcı olabilir ve IRF5 seviyelerinin artırılması, bağışıklık sistemleri zayıf, tehlikede veya hasar görmüş kişilerin tedavisine yardımcı olabilir. IRF5, "ya doğrudan DNA ile etkileşerek ya da hangi genlerin açık olduğunu kendileri kontrol eden diğer proteinlerle etkileşerek" çalışıyor gibi görünüyor.

sinyalizasyon

IRF ailesi , viral enfeksiyonlara interferon (IFN) yanıtı için gen ekspresyonunu düzenler . IRF5, interferon sinyalleşmesine doğrudan bir dönüştürücüdür ve fosforilasyon yoluyla aktive edilir. IRF ailesi ayrıca JAK'ı aktive eden transmembran reseptörlere bağlanarak JAK/STAT sinyal yolunu başlatabilir . IRF'ler, IFN'ler ve JAK/STAT sinyal yolu, memelilerde belirli sinyaller yoluyla viral enfeksiyonlarla savaşmak için birlikte çalışır.

Ayrıca bakınız

İnterferon düzenleyici faktörler

Referanslar

daha fazla okuma

Pitha PM, Au WC, Lowther W, et al. (1999). "Virüs aracılı sinyalleşme ve hücre büyümesinin düzenlenmesinde interferon düzenleyici faktörlerin (IRF'ler) rolü". Biyokimya . 80 (8-9): 651-8. doi : 10.1016/S0300-9084(99)80018-2 . PMID 9865487 .
Barnes B, Lubyova B, Pitha PM (2002). "Ev sahibi savunmasında IRF'nin rolü üzerine". J. İnterferon Sitokin Res . 22 (1): 59–71. doi : 10.1089/107999002753452665 . PMID 11846976 .
Barnes BJ, Moore PA, Pitha PM (2001). "Yeni bir interferon düzenleyici faktör olan IRF-5'in virüse özgü aktivasyonu, farklı interferon alfa genlerinin indüklenmesiyle sonuçlanır" . J. Biol. Chem . 276 (26): 23382-90. doi : 10.1074/jbc.M101216200 . PMID 11303025 .
Nehyba J, Hrdlickova R, Burnside J, Bose HR (2002). "Yeni bir interferon düzenleyici faktör (IRF), IRF-10, bağışıklık savunmasında benzersiz bir role sahiptir ve v-Rel onkoproteini tarafından indüklenir" . Mol. Hücre. Biol . 22 (11): 3942-57. doi : 10.1128/MCB.22.11.3942-3957.2002 . PMC 133824 . PMID 11997525 .
Barnes BJ, Kellum MJ, Field AE, Pitha PM (2002). "IRF-5 kontrol aktivasyonunun çoklu düzenleyici alanları, hücresel lokalizasyon ve T lenfositlerin alımına aracılık eden kemokinlerin indüksiyonu" . Mol. Hücre. Biol . 22 (16): 5721–40. doi : 10.1128/MCB.22.16.5721-5740.202 . PMC 133975 . PMID 12138184 .
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). "15.000'den fazla tam uzunlukta insan ve fare cDNA dizisinin oluşturulması ve ilk analizi" . Proc. Natl. Acad. bilim ABD . 99 (26): 16899–903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M . doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932 .
Barnes BJ, Field AE, Pitha-Rowe PM (2003). "IRF-5 ve IRF-7 arasında virüs kaynaklı heterodimer oluşumu, IFNA geliştiriciozomunun in vivo montajını ve IFNA genlerinin transkripsiyonel aktivitesini modüle eder" . J. Biol. Chem . 278 (19): 16630–41. doi : 10.1074/jbc.M212609200 . PMID 1260985 .
Scherer SW, Cheung J, MacDonald JR, et al. (2003). "İnsan kromozom 7: DNA dizisi ve biyolojisi" . Bilim . 300 (5620): 767-72. Bibcode : 2003Sci...300..767S . doi : 10.1126/science.1083423 . PMC 2882961 . PMID 12690205 .
Barnes BJ, Kellum MJ, Pinder KE, et al. (2003). "İnterferon düzenleyici faktör 5, hücre döngüsü durdurma ve hücre ölümünün yeni bir aracısı". Kanser Araş . 63 (19): 6424–31. PMID 14559832 .
Barnes BJ, Richards J, Mancl M, et al. (2004). "Viral enfeksiyona doğuştan gelen tepki sırasında IRF-5 ve IRF-7'nin küresel ve farklı hedefleri" . J. Biol. Chem . 279 (43): 45194-207. doi : 10.1074/jbc.M400726200 . PMID 15308637 .
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004). "NIH tam uzunluktaki cDNA projesinin durumu, kalitesi ve genişlemesi: Memeli Gen Koleksiyonu (MGC)" . Genom Res . 14 (10B): 2121–7. doi : 10.1101/gr.2596504 . PMC 528928 . PMID 15489334 .
Lin R, Yang L, Arguello M, et al. (2005). "Bir CRM1 bağımlı nükleer ihracat yolu, IRF-5 hücre altı lokalizasyonunun düzenlenmesinde yer alır" . J. Biol. Chem . 280 (4): 3088–95. doi : 10.1074/jbc.M408452200 . PMID 15556946 .
Sigurdsson S, Nordmark G, Göring HH, et al. (2005). "Tirozin kinaz 2 ve interferon düzenleyici faktör 5 genlerindeki polimorfizmler, sistemik lupus eritematozus ile ilişkilidir" . NS. J. Hım. Genet . 76 (3): 528–37. doi : 10.1086/428480 . PMC 1196404 . PMID 15657875 .
Takaoka A, Yanai H, Kondo S, et al. (2005). "Toll benzeri reseptörler tarafından aktive gen indüksiyon programında IRF-5'in bütünleyici rolü". Doğa . 434 (7030): 243–9. Bibcode : 2005Natur.434..243T . doi : 10.1038/nature03308 . PMID 15665823 . S2CID 667829 .
Schoenemeyer A, Barnes BJ, Mancl ME, et al. (2005). "İnterferon düzenleyici faktör, IRF5, ücretli benzeri reseptör 7 sinyalleşmesinin merkezi bir aracısıdır" . J. Biol. Chem . 280 (17): 17005–12. doi : 10.1074/jbc.M412584200 . PMID 15695821 .
Mancl ME, Hu G, Sangster-Guity N, Olshalsky SL, Hoops K, Fitzgerald-Bocarsly P, Pitha PM, Pinder K, Barnes BJ (Haziran 2005). "İki ayrı promotör, alternatif olarak eklenmiş insan interferon düzenleyici faktör-5 izoformlarını düzenler. Farklı hücre tipine özgü ekspresyon, lokalizasyon, düzenleme ve fonksiyona sahip çoklu izoformlar" . J. Biol. Chem . 280 (22): 21078-90. doi : 10.1074/jbc.M500543200 . PMID 15805103 .
Rual JF, Venkatesan K, Hao T, et al. (2005). "İnsan protein-protein etkileşim ağının proteom ölçekli haritasına doğru". Doğa . 437 (7062): 1173-8. Bibcode : 2005Natur.437.1173R . doi : 10.1038/nature04209 . PMID 16189514 . S2CID 4427026 .
Graham RR, Kozyrev SV, Baechler EC, et al. (2006). "Ortak bir interferon düzenleyici faktör 5 (IRF5) haplotipi, ekleme ve ifadeyi düzenler ve sistemik lupus eritematozus riskinin artmasıyla ilişkilidir". Nat. Genet . 38 (5): 550–5. doi : 10.1038/ng1782 . PMID 16642019 . S2CID 21426281 .

Dış bağlantılar

IRF5+protein,+insan ABD Ulusal Tıp Kütüphanesinde Tıbbi Konu Başlıkları (MeSH)
Bulunan tüm yapısal bilgilerin Bakış PDB için UniProt : Q13568 (İnterferon düzenleyici faktör 5) de PDBe-KB .

Bu makale , kamuya açık olan Amerika Birleşik Devletleri Ulusal Tıp Kütüphanesi'nden alınan metinleri içermektedir .

İnsan kromozom 7 üzerindeki bir gen ile ilgili bu madde bir taslaktır . Vikipedi'yi genişleterek yardımcı olabilirsiniz .

Languages

In other projects