Haplogrup R (mtDNA) - Haplogroup R (mtDNA)

*haplogrup R*
haplogrup R
Olası menşe zamanı	66,8 ± 14,2 kya
Olası menşe yeri	Güney Asya Güneydoğu Asya
Ata	n
Torunları	R0 , R1, R1b , R2'JT , R3, R5, R6'7, R8, R9, R11' B , R12'21, R14, R22, R23, R30, R31, P , U
Mutasyonları tanımlama	12705, 16223

Haplogroup R , yaygın olarak dağıtılmış bir insan mitokondriyal DNA'sı (mtDNA) haplogrouptur. Haplogroup R, yaklaşık 70.000 yıl önce Avrasya halkıyla ilişkilidir ve Sahra altı Afrika'nın dışında dünya çapında modern popülasyonlara dağılmıştır .

Haplogroup R, makro- haplogroup N'nin bir soyundan gelir . R klavuzunun soyundan gelen haplogrupları arasında B , U (ve dolayısıyla K ), F , R0 (ve dolayısıyla HV , H ve V ) ve JT ( J ve T'nin atasal haplogrupları ) bulunur.

Menşei

Soares ve ark. (2009) haplogroup R'nin yaşını tahmin ediyor66.8 ± 14.2 kya ( % 95 CI ), yani yaklaşık 80.000 ila 50.000 yıl önce, büyük olasılıkla yaklaşık 65.000 yıl civarında.

Bu, Doğu Afrika'dan Batı, Güney ve Güneydoğu Asya'ya Kıyı Göçü sırasında ortaya çıkan bir durumla tutarlıdır . Yaklaşık 70.000 ila 60.000 yıl önce kıyı yolu boyunca M, N ve R haplogruplarının erken soyunun olduğu öne sürülmüştür.

Haplogroup R, Güney Asya'nın yerli nüfusunda geniş bir çeşitliliğe ve antik çağa sahiptir. Batı ve Güney Hindistan'ın kabileleri ve kastları, diğer bölgelerden daha fazla çeşitlilik gösteriyor ve muhtemelen otokton statülerini gösteriyor. Larruga et al. (2017), mtDNA R'nin Güneydoğu Asya kıyılarındaki bir çekirdek bölgeden Avrasya ve Avustralya'ya yayıldığını buldu. Ust'-Ishim adam Sibirya'da fosil tarihli yaklaşık 45.000 yaşında, haplogroup R*'a (önceden U* olarak sınıflandırılıyordu) ait.

Dağıtım

Haplogroup R ve onun soyundan gelenler tüm Avustralasya , Amerika , Güneydoğu Asya , Güney Asya , Orta Asya , Batı Asya , Doğu Asya , Avrupa , Kuzey Afrika ve Afrika Boynuzu'na dağılmıştır .

Bazal R* dizisi , Soqotri'de (%1.2), ayrıca Kuzeydoğu Afrika'da (%1.5), Orta Doğu'da (%0.8), Yakın Doğu'da (%0.8) ve Arap yarımadasında (%0.3) bulunur. .

Haplogrup R, Kuzey Mısır'daki Abusir el-Meleq arkeolojik alanında kazılan Mısır mumyaları arasında da gözlemlendi ve bunlar Ptolemaik Öncesi/Geç Yeni Krallık , Ptolemaios ve Roma dönemlerine ait.

Subclade R2, Batı İran'dan Tepe Abdul Hosein'de Neolitik bir insanın kalıntılarında gözlendi.

alt kladlar

haplogrup R
- R0 veya HV öncesi
  - R0a veya (preHV)1: Arap yarımadasında yaygın olarak görülür, en yüksek sıklığı Soqotri'de gözlenir. Kuzey Afrika , Afrika Boynuzu ve Orta Asya'da orta frekanslarda bulunur .
  - HV:
    İran da dahil olmak üzere,esas olarak Orta Doğu'da bulunan bir Batı Avrasya haplogrubu. Aynı zamanda bulunur Kuzey Afrika , Orta Asya ve Güney Asya
    .
    
    V : Avrupa çapında orta derecede düşük frekanslarda bulunur; en yüksek sıklık %40 Sami halkındadır .
    
    HV1: Ağırlıklı olarak Orta Doğu'da .
    
    HV2: Ağırlıklı olarak Güney Asya'da .
    
    HV3: Ağırlıklı olarak Doğu Avrupa'da .
    
    H: In Batı Avrasya . Avrupa'daki en yaygın mtDNA haplogrubudur.
- R1
  - - R1A * (3337): Bulundu Brahmins dan Uttar Pradesh (Hindistan).
    - R1a1: Kabardeyler ve Adıgeler gibi Kuzeybatı Kafkas halkında bulunur . Kuzeybatı Ruslar ve Polonyalılar gibi doğu Avrupa popülasyonlarında gözlendi .
    - R1b: MÖ 5500'e tarihlenen Karelya, Rusya'dan bir Doğulu avcı toplayıcıda gözlemlendi .
      - R1b1: Bulgaristan, Ermenistan (eski bir örnek dahil) ve Hindistan'da gözlemlendi
        
        R1b1a: Uygurlarda gözlendi
        
        R1b1b: Finlandiya'da gözlemlendi ( Finlandiya İsveçliler dahil )
      - R1b2
        
        R1b2a: Yakutlarda gözlendi
        
        R1b2b: Uygurlarda gözlendi
- JT öncesi veya R2'JT
  - R2 : Esas olarak Belucistan'da (Pakistan) bulunur .
    - (13500): Rajasthan ve Uttar Pradesh'te (Hindistan) bulundu.
    - (150, 303+1C): İran , Gürcistan ve Türkiye'de .
  - JT
    - J: En yüksek frekans Yakın Doğu'da (%12), Suudi Arabistan'da %21. J Avrupa'ya %11, Kafkasya %8, Kuzey Afrika'ya %6 oranındageriliyorve Doğu Asya'da pratikte kayboluyor.
    - T: En yüksek frekans Hazar bölgesindedir ( Kafkasya , Kuzey İran , Türkmenistan ). Avrupa (neredeyse %10), Orta Doğu , Orta Asya , Pakistan ve Kuzey Afrika'da önemlidir. Afrika Boynuzu ve Hindistan'da küçük bir frekans.
- R3 : Ermenistan'da bulundu. 7000 yıl öncesine tarihlenen Macaristan'dan eski bir bireyde de gözlemlendi
- R5 : Hindistan alt kıtasında yaygın olarak yayılmıştır . Özellikle Madhya Pradesh'te ( Hindistan ) %17'de.
  - R5a
    - R5a1: Hindistan'ın Hint-Avrupa konuşan topluluklarında bulundu .
    - R5a2: Özellikle Hindistan ve Sri Lanka'daki Dravid grupları arasında .
- R6'7 (16362) En önemli varlık Hindistan'dan gelen Avustralasya dili konuşanlar arasındadır (%10).
  - R6 : Küçük frekansları Hindistan ve Pakistan hem belirgin bulundu Tamilce ve Keşmir popülasyonları.
  - R7 : Hindistan alt kıtasında .
    - R7a: Ağırlıklı olarak içinde Doğu Hindistan , özellikle de Santals gelen Bihar ve Jharkhand .
    - -R7b: Özel olarak Dravidian kabileler arasında Doğu Hindistan .
- R8 : En yüksek frekans doğru meydana Doğu Hindistan özellikle içinde, Orissa (% 12) ve bulunmuş olmasına Avustralasyatik kabileler ( Munda ve Khasi hoparlörler). Ayrıca Dravid, Hint-Avrupa ve Tibet-Burman ( örneğin Nyishi , Changpa , Sherpa ) konuşanlar arasında da düşük frekansta bulunur .
  - R8a: Esas olarak Orissa ve Andhra Pradesh'te (Hindistan) bulunur.
  - R8b: Orissa'da , Gujarat , Andhra Pradesh (Hindistan).
- R9 (16304)
  - R9b: Çoğunlukla Güneydoğu Asya'da görülür . Endonezya'nın her yerinde , Çinhindi , Malezya'da , Semelai gibi Aborijin Malaylarda %28 ve Temuan %21'de bulundu.
  - (249d)
    - R9c: Malay Takımadaları ve Tayvan'ın her yerinde . Ağırlıklı olarak Batak'ta ( Palawan ) %58 , Tayvan'ın Tsou'su (%22,9) ve Alor'da (Endonezya) %11'dir.
    - F: Doğu Asya ve Güneydoğu Asya'da oldukça yaygın. Nicobar gibi bazı bölgelerde%50 ve Arunaçal Pradeş %31 ( Hindistan ) veSibirya'dan Shors halkı %44 ile dahayüksek frekanslar meydana gelir. Tayvan yerlileri , Guangdong (Çin), Maluku (Endonezya), Tayland ve Vietnam'da da önemli bir sıklık var.
- R11'B (16189)
  - R11 : Bulunan Çin esas olarak, lahular gelen Yunnan % 12,5. Ayrıca Japonya , Kore , Çamlar ve Rajasthan'da (Hindistan).
  - B
    - B4: Doğu Asya , Güneydoğu Asya , Polinezya , Melanezya , Mikronezya , Madagaskar ve Amerika'nın Yerli halklarında sıklıkla bulunur .
    - B5: Doğu Asya ve Güneydoğu Asya'da yayıldı .
  - R24 : Filipinler'de bulundu .
- R12'21
  - R12 : Avustralya'da bulundu .
  - R21 : yerli halkları olarak Malezya gibi Jahai Negritos % 63 ve Senoi % 37 yanı sıra Maniq arasında Güney Tayland'da ve diğer birkaç içinde Tay ve Malezyalı bireyler.
- R14 : Papua Yeni Gine'de ve Doğu Timor ve Lembata'nın Avustronezyaca konuşanlarında bulunur .
- R22 veya R12: Shompen'de çok sık (10/29 = %34,5). Başka yerlerde esas olarak güney-orta Endonezya'da (%11,4 Mataram , %8,0 Waingapu , %7,3 Bali , %1,9 Borneo ) ve Bình Thuận , Vietnam'ın Cham bölgesinde (7/168 = %4,2), Tayland'da tekil veya sporadik olaylarla bulunur , Sumatra , Java , Sulawesi ve Alor .
- R23 : Bali ve Sumba'da (Endonezya) bulunan küçük dal .
- R30
  - Ki burada R30a: Bulundu Andra Pradeş , Uttar Pradesh bölgesindeki (Hindistan) Tharu insanlar den Nepal ve Sinhalesece insanlar arasından Sri Lanka .
  - R30b: Pencap'ta bulundu .
  - R30* (1598, 16189): Pencap , Nepal ve Japonya'da bulundu .
- R31
  - R31a: In Brahmin'ler gelen Uttar Pradesh ve Rajputs gelen Rajasthan (Hindistan).
  - R31b: In Reddys dan Andra Pradeş (Hindistan).
- R32

Mauritius'ta bulundu

- P: Sahul'un özelliğidir. Filipinler ve Doğu Endonezya'da bulundu.
  - (16176)
    - P1: Melanezya'da yaygın . Papua Yeni Gine'de daha yüksek frekanslar görülür . Ayrıca bulundu Maluku'da , Nusa Tenggara ve Polinezya .
    - P2'10
      - P2: Melanezya'da , özellikle Yeni Gine ve Yeni Kaledonya'da .
      - P10: Filipinler'de bulundu .
    - P9 (veya AuE): Orta bölgeden Aborjin Avustralyalılarda .
  - P3: Avustralya ve Melanezya'da .
  - P4: Avustralya ve Melanezya'da .
- sen
  - U1: Daha çok Orta Doğu ve Kafkasya'da görülür . Hindistan'dan Akdeniz'e ve Avrupa'nın geri kalanına kadar bulunur.
  - U5: Toplam Avrupalıların yaklaşık %11'i ve Avrupalı-Amerikalıların %10'u. En yüksek frekans Sami halkındadır .
  - U6: Kuzey Afrika ve Afrika Boynuzu'nda , özellikle Mağrip'te yaygındır . Alt dalın en yüksek frekansları Cezayirli Berberiler (%29) ve Mısırlı Kıptiler (%27.6 ) arasında görülür . U6, Taforalt prehistorik bölgesindeki Epipaleolitik dönemden kalma Iberomaurus örnekleri arasında da bulunmuştur .
  - U2'3'4'7'8'9 (1811): Batı Avrasya'da ve Hindistan alt kıtasında yaygın olarak yayılmıştır .
    - U8
      - K

Ağaç

Haplogrouptarafından R subclades Bu filogenetik ağaç Mannis van Fırın ve Manfred Kayser tarafından kağıda dayalı küresel insan mitokondriyal DNA varyasyon Güncelleme kapsamlı filogenetik ağaç ve sonraki yayınlanmış araştırma.

r
- R0 (önceden HV öncesi)
  - R0a
    - R0a1
    - R0a2
  - YG
    - HV0 (önceden V öncesi)
      - HV0a
        V
    - H
- R1
  - R1a
    - R1a1
      - R1a1a
- R2'JT
  - R2
  - JT
    - J
    - T
- R5
  - R5a
    - R5a1
      - R5a1a
    - R5a2
      - R5a2a
      - R5a2b
        
        R5a2b1
        
        R5a2b2
        
        R5a2b3
        
        R5a2b4
- R6'7
  - R6
    - R6a
      - R6a1
        R6a1a
  - R7
    - R7a
      - R7a1
        
        R7a1a
        
        R7a1b
        
        R7a1b1
        
        R7a1b2
    - R7b
      - R7b1
        R7b1a
- R8 - Hindistan
  - R8a - Sri Lanka
    - R8a1
      - R8a1a
        
        R8a1a1
        
        R8a1a2
        
        R8a1a3 - Güney Afrika, Norveç
      - R8a1b
    - R8a2
  - R8b
    - K8b1
    - R8b2
- (16304)
  - R9
    - R9b - Kamboçya, Tayland ( Lao turan içinde Ubon Ratchathani İl ve Roi Et Eyaleti , Gine)
      - R9b1 - Çin, Uygur, Tayland ( Mon içinde Merkez Tayland'da , Tay içinde Batı Tayland , Laos) ( Lao içinde Vientiane ), Vietnam ( La HU ), Danimarka
        
        R9b1a
        
        R9b1a1 - Filipinler ( Mamanwa )
        R9b1a1a - Çin, Tayland ( Karen ve Tay Lue içinde Kuzey Tayland , Laos turan içinde Roi Et Eyaleti , Tay içinde Merkez Tayland ve Doğu Tayland ), Kamboçya ( Banteay Meanchey ), Malezya ( Semelai , yerli Malayca ), Singapur, Endonezya ( Tengger , Palembang , Padang , Manado ), Vietnam ( Giarai )
        
        R9b1a2 - Tayvan ( Tsou (), Tayland Lao turan içinde Loei Eyaleti , Tay içinde Batı Tayland )
        
        R9b1a2a - Çin (Han Tai'an , vb , Vietnam () Tay , vb ), Rusya ( tubalar )
        
        R9b1a2b - Çin, Tayvan (Minnan, Hakka), Vietnam ( Tay ), Tayland ( Khon Mueang dan Chiang Rai , Tai Khuen Kuzey Tayland)
        
        R9b1a3 - Tayland, Çin ( Han , Dai ), Vietnam ( Dao , Nùng , vb ), Kazakistan
        
        R9b1b - Çin, Vietnam, Kamboçya ( Siem Reap ), Tayland ( Khon Mueang gelen Chiang Mai , Tai Yuan gelen Merkez Tayland , Mon gelen Kuzey Tayland )
      - R9b2 - Tayland, Kamboçya, Vietnam
    - R9c - Çin ( Hulun Buir'den Barghut ), Tayvan
      - R9c1
        
        R9c1a - Filipinler, Endonezya, Tayvan ( Makatao ), Tayland ( Khon Mueang dan Chiang Rai )
        
        R9c1a1 - Tayvan ( Makatao , Rukai , Puyuma , vb ), Guam
        
        R9c1a2 - Tayvan ( Tsou , Bunun )
        
        R9c1a3 - Filipinler ( Batak ait Palawan )
        
        R9c1b
        
        R9c1b1 - Çin ( Han ), Vietnam ( Kinh , Dao ), Tayland ( Tai Barajı içinde Kanchanaburi , Khon Mueang içinde Mae Hong Son Province , Tai Yuan içinde Kuzey Tayland , Tay Lue içinde Kuzey Tayland , Myanmar)
        
        R9c1b2 - Tayland ( Khon Mueang içinde Chiang Rai ), Tayvan ( Makatao , vb ), Filipinler ( Ifugao , Bugkalot ), Doğu Timor
    - F
    - R22
- R11'B (16189)
  - R11
    - R11a
  - B
  - R24
- R12'21
  - R12
  - R21
- R22
- R14
- R23
- R30
  - R30a
  - R30b
    - R30b1
- R31
  - R31a
    - R31a1
  - R31b
- R32
- P
- sen