aprataksin - Aprataxin

APTX
Mevcut yapılar
PDB	Ortologtur arama: PDBe RCSB
PDB kimlik kodlarının listesi
	3KT9 , 4NDF , 4NDG , 4NDH , 4NDI
tanımlayıcılar
takma adlar	APTX , AOA, AOA1, AXA1, EAOH, EOAHA, FHA-HIT, aprataksin
Harici kimlikler	OMIM : 606350 MGI : 1913658 HomoloGene : 41634 GeneCards : APTX
Gen konumu ( İnsan )
Chr.	Kromozom 9 (insan)
Son	33.025.168 baz puan
Gen konumu ( Fare )
Chr.	Kromozom 4 (fare)
Son	40.703.194 baz puan
RNA ifade modeli
	Daha fazla referans ifade verisi
Gen ontolojisi
moleküler fonksiyon	• DNA bağlanması ; • protein N-ucu bağlanması ; • polinükleotid 3'-fosfataz aktivitesi ; • kromatin bağlanması ; • metal iyon bağlanması ; • hasarlı DNA bağlanması ; • fosfoprotein bağlanması ; • GO:0001948 protein bağlanması ; • fosfoglikolat fosfataz aktivitesi ; • katalitik aktivite ; • çift sarmallı RNA bağlanması ; • çift sarmallı DNA bağlanması ; • hidrolaz etkinliği ; • DNA 5'-adenosin monofosfat hidrolaz etkinliği ; • nükleik asit bağlanması ; • DNA-3'-difosfo-5'-guanozin difosfataz ; • tek sarmallı DNA bağlanması ; • uyumsuz DNA bağlanması ; • tek sarmal kopması DNA bağlanmasını içeren;
Hücresel bileşen	• sitoplazma ; • kromatin ; • çekirdekçik ; • çekirdek ; • nükleoplazma;
biyolojik süreç	• protein stabilitesinin düzenlenmesi ; • DNA hasar uyarısına hücresel yanıt ; • DNA ligasyonu ; • çift sarmal kopma onarımı ; • hidrojen peroksite yanıt ; • DNA onarımı ; • polinükleotit 3' defosforilasyon ; • nükleik asit fosfodiester bağ hidrolizi ; • tek zincir kopma onarımı ; • fosforilasyon;
	Kaynaklar: Amigo / QuickGO
ortologlar
	54840
	66408
	ENSG00000137074
	ENSMUSG00000028411
	Q7Z2E3
	Q7TQC5
NM_001195248 ; NM_001195249 ; NM_001195250 ; NM_001195251 ; NM_001195252;
	NM_001195254 ; NM_017692 ; NM_175069 ; NM_175072 ; NM_175073
	NM_001025444 ; NM_001025445 ; NM_025545
NP_001182177 ; NP_001182178 ; NP_001182179 ; NP_001182180 ; NP_001182181;
	NP_001182183 ; NP_778239 ; NP_778243 ; NP_001355924 ; NP_001355925 ; NP_001355926 ; NP_001355927 ; NP_001355928 ; NP_001355929 ; NP_001355930 ; NP_001355931 ; NP_001355932 ; NP_001355933 ; NP_001355934 ; NP_001355935 ; NP_001357598 ; NP_001357599 ; NP_001357602
	NP_001020615 ; NP_001020616 ; NP_079821
	Vikiveri
İnsan Görüntüle/Düzenle	Fareyi Görüntüle/Düzenle

Aprataxin a, proteinin insanlarda tarafından kodlandığını APTX geni .

Bu gen, bazıları nükleotid bağlama ve diadenozin polifosfat hidrolaz aktivitelerine sahip olan histidin triad (HIT) süper ailesinin bir üyesini kodlar. Kodlanmış protein, tek sarmallı DNA onarımında rol oynayabilir . Bu gendeki mutasyonlar, ataksi-oküler apraksi ile ilişkilendirilmiştir . Bu gen için farklı izoformları kodlayan çoklu transkript varyantları tanımlanmıştır, ancak bazı varyantların tam uzunluktaki doğası belirlenmemiştir.

İşlev

Aprataxin , homolog olmayan uç birleştirme sırasında DNA Ligaz IV tarafından yapılan başarısız ligasyon girişimlerinin ardından AMP'yi DNA uçlarından uzaklaştırır , böylece sonraki ligasyon girişimlerine izin verir.

DNA zinciri kopmaları

Ataksi okülomotor apraksi-1, aprataksini kodlayan APTX genindeki mutasyonların neden olduğu nörolojik bir hastalıktır . Nörolojik bozukluğa, abortif DNA ligasyonu olaylarından kaynaklanan onarılmamış DNA zincir kırıklarının kademeli olarak birikmesi neden oluyor gibi görünüyor.

Erken yaşlanma

Aptx ^−/− mutant fareler üretildi, ancak bariz bir fenotipten yoksunlar . Süperoksit dismutaz I (SOD1) mutasyonunun bir Aptx ^-/- farede ifade edildiği başka bir fare modeli üretildi . SOD1 mutasyonu, oksidatif stresin ardından transkripsiyon geri kazanımında bir azalmaya neden olur . Bu fareler, hızlandırılmış hücresel yaşlanma gösterdi . Bu çalışma aynı zamanda in vivo olarak Aptx'in koruyucu bir rolü olduğunu göstermiştir ve Aptx işlevinin kaybının, sinir sisteminde aşamalı DNA kırılmaları birikmesiyle sonuçlandığını ve sistemik erken yaşlanmanın ayırt edici özelliklerini tetiklediğini öne sürmüştür (bkz . yaşlanmanın DNA hasarı teorisi ).

Etkileşimler

Aprataxin'in aşağıdakilerle etkileşime girdiği gösterilmiştir :

PARP1 ,
P53 ,
XRCC1 ve
XRCC4 .

Referanslar

daha fazla okuma

Aicardi J, Barbosa C, Andermann E, et al. (1989). "Ataksi-oküler motor apraksi: ataksi-telanjiektaziyi taklit eden bir sendrom". Anne. Nörol . 24 (4): 497-502. doi : 10.1002/ana.410240404 . PMID 3239952 . S2CID 45836910 .
Gascon GG, Abdo N, Sigut D, et al. (1995). "Ataksi-okülomotor apraksi sendromu". J. Çocuk Nörol . 10 (2): 118–22. doi : 10.1177/088307389501000210 . PMID 7782601 . S2CID 26080242 .
Hannan MA, Sigut D, Waghray M, Gascon GG (1995). "Ataksi-oküler motor apraksi sendromu: hastaların ve ailelerinin hücresel radyosensitivitesinin araştırılması" . J. Med. Genet . 31 (12): 953–6. doi : 10.1136/jmg.31.12.953 . PMC 1016697 . PMID 7891378 .
Moreira MC, Barbot C, Tachi N, et al. (2001). "Portekizce ve Japon ataksi-okülomotor apraksi biçimlerinin 9p13'e homozigotluk haritalaması ve genetik heterojenite için kanıt" . NS. J. Hım. Genet . 68 (2): 501–8. doi : 10.1086/318191 . PMC 1235299 . PMID 11170899 .
Brenner C (2002). "İpucu, Fhit ve GalT: nükleotid hidrolazlar ve transferazların histidin üçlü süper ailesinin üç dalının işlevi, yapısı, evrimi ve mekanizması" . Biyokimya . 41 (29): 9003–14. doi : 10.1021/bi025942q . PMC 2571077 . PMID 12119013 .
Shimazaki H, Takiyama Y, Sakoe K, et al. (2002). "Oküler motor apraksi ve hipoalbüminemi ile erken başlangıçlı ataksi: aprataksin gen mutasyonları". Nöroloji . 59 (4): 590–5. doi : 10.1212/wnl.59.4.590 . PMID 12196655 . S2CID 19576330 .
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). "15.000'den fazla tam uzunlukta insan ve fare cDNA dizisinin oluşturulması ve ilk analizi" . Proc. Natl. Acad. bilim ABD . 99 (26): 16899–903. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932 .
Tranchant C, Fleury M, Moreira MC, et al. (2004). "Aprataksin gen mutasyonlarının fenotipik değişkenliği". Nöroloji . 60 (5): 868–70. doi : 10.1212/01.wnl.0000048562.88536.a4 . PMID 12629250 . S2CID 29358633 .
Le Ber I, Moreira MC, Rivaud-Péchoux S, et al. (2003). "Okülomotor apraksi tip 1: klinik ve genetik çalışmalar ile serebellar ataksi" . Beyin . 126 (Bölüm 12): 2761–72. doi : 10.1093/brain/awg283 . PMID 14506070 .
Sekijima Y, Hashimoto T, Onodera O, et al. (2004). "Aprataksin gen mutasyonu olan bir hastanın sunumu olarak şiddetli jeneralize distoni". Hareket Disord . 18 (10): 1198–200. doi : 10.1002/mds.10526 . PMID 14534929 . S2CID 28225863 .
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T, et al. (2004). "21,243 tam uzunluktaki insan cDNA'larının tam dizilimi ve karakterizasyonu" . Nat. Genet . 36 (1): 40–5. doi : 10.1038/ng1285 . PMID 14702039 .
Sano Y, Date H, Igarashi S, et al. (2004). "Aprataksin, EAOH için nedensel protein, DNA onarım proteini olarak potansiyel rolü olan bir nükleer proteindir". Anne. Nörol . 55 (2): 241–9. doi : 10.1002/ana.10808 . PMID 14755728 . S2CID 25338143 .
Gueven N, Becherel OJ, Kijas AW, et al. (2004). "Aprataksin, genotoksik strese karşı koruyan yeni bir protein" . Hımm. Mol. Genet . 13 (10): 1081–93. doi : 10.1093/hmg/ddh122 . PMID 15044383 .
Humphray SJ, Oliver K, Hunt AR, et al. (2004). "DNA dizisi ve insan kromozomu 9'un analizi" . Doğa . 429 (6990): 369-74. Bibcode : 2004Natur.429..369H . doi : 10.1038/nature02465 . PMC 2734081 . PMID 15164053 .
Habeck M, Zühlke C, Bentele KH, et al. (2004). "Aprataksin mutasyonları, Almanya'da erken başlangıçlı ataksinin nadir bir nedenidir". J. Neurol . 251 (5): 591–4. doi : 10.1007/s00415-004-0374-7 . PMID 15164193 . S2CID 20280677 .
Hirano M, Nishiwaki T, Kariya S, et al. (2004). "Yeni ek varyantları, oküler motor apraksi ve hipoalbüminemi ile erken başlangıçlı ataksiden sorumlu gen olan aprataksinin moleküler çeşitliliğini arttırır". Nörobilim. Let . 366 (2): 120–5. doi : 10.1016/j.neulet.2004.05.034 . PMID 15276230 . S2CID 37647769 .
Amouri R, Moreira MC, Zouari M, et al. (2005). "Tunuslu ailelerde Aprataxin gen mutasyonları". Nöroloji . 63 (5): 928–9. doi : 10.1212/01.wnl.0000137044.06573.46 . PMID 15365154 . S2CID 41637052 .
Clements PM, Breslin C, Deeks ED, et al. (2005). "Ataksi-okülomotor apraksi 1 gen ürünü, ATM'den farklı bir role sahiptir ve DNA zinciri kırılması onarım proteinleri XRCC1 ve XRCC4 ile etkileşime girer". DNA Onarımı (Amst.) . 3 (11): 1493-502. doi : 10.1016/j.dnarep.2004.06.017 . PMID 15380105 .

Dış bağlantılar

Okülomotor Apraksi Tip 1 ile Ataksi üzerine GeneReviews/NCBI/NIH/UW girişi
Okülomotor Apraksi Tip 1 ile Ataksi ile ilgili OMIM girişleri
UCSC Genom Tarayıcısında insan APTX genom konumu ve APTX gen ayrıntıları sayfası .

Languages

In other projects