Rickettsiales - Rickettsiales
| Rickettsiales | |
|---|---|
|
|
| Bir geyik kene hücresinde Rickettsia rickettsii (kırmızı noktalar) | |
bilimsel sınıflandırma 
|
|
| İhtisas: | bakteri |
| filum: | proteobakteriler |
| Sınıf: | Alfaproteobakteriler |
| Emir: |
Rickettsiales Gieszczykiewicz 1939 (Onaylı Listeler 1980) |
| Aileler | |
|
|
Rickettsiales gayri denilen Rickettsias , küçük bir düzen vardır Alfaproteobacteria . Bunlar zorunlu hücre içi parazitlerdir ve bazıları insanlarda çeşitli hastalıklara neden olan Rickettsia ve çiftlik hayvanlarında hastalıklara neden olan Ehrlichia dahil olmak üzere dikkate değer patojenlerdir . İyi bilinen bir başka Rickettsiales cinsi, tüm eklembacaklıların yaklaşık üçte ikisini ve neredeyse tüm filaryal nematodları enfekte eden Wolbachia'dır . Genetik çalışmalar, mitokondri ve ilgili organellerin bu grubun üyelerinden geliştiğine göre endosimbiyotik teoriyi desteklemektedir .
Rickettsiales'i yetiştirmek zordur, çünkü hayatta kalmak için ökaryotik konak hücrelere güvenirler.
Rickettsiales soyoluş
Rickettsiales ayrıca bilinen üç aileden, Rickettsiaceae , Midichloriaceae ve Anaplasmataceae'den oluşur . Çoğu çalışma Holosporaceae'nin dahil edilmesini de destekler , ancak bir çalışma bu görüşe meydan okudu. Bu alternatifte, Holosporaceae kendi düzenlerinin, Holosporales'in tek temsilcileridir ve bu nedenle Rickettsiales'in bir parçası değildir (aşağıdaki şematik ağaca bakın). Açıkça herhangi bir ailenin parçası olmayan diğer soylar da tanımlanmıştır. Örnekler arasında Candidatus Arcanobacter lacustris ve Rickettsiales bakterisi Ac37b yer alır.
| Alfaproteobakterilerin şematik ribozomal RNA filogenisi | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Rickettsidae kladogramı Ferla ve diğerleri tarafından çıkarılmıştır . karşılaştırmasından 16S + 23S ribozomal RNA dizileri. |
Rickettsiales ve Pelagibacterales arasındaki filogenetik ilişki (SAR11)
Bu iki grup arasındaki filogenetik ilişki henüz bilimsel literatürde fikir birliğine varmamıştır.
İlk raporlar, birbirlerine kardeş dalları temsil ettiklerini ileri sürdü. Bununla birlikte, daha sonraki çalışmalar, bu ilişkinin yanlış olduğunu ve bağımsız AT açısından zengin ve hızlı gelişen soyları (Rickettsiales ve Pelagibacterales her iki özelliğe sahiptir) yapay olarak gruplandıran filogenetik bir artefakttan kaynaklandığını ileri sürdü. Bu artefaktı düzelttikten sonra Pelagibacterales , bunun yerine Hyphomicrobiales , Rhodobacterales ve Caulobacterales için bir kardeş klad oluşturur .
Başka bir çalışma, iki dal arasındaki kardeş ilişkiye bağlıdır (şematik ağaca bakınız). Sınıflandırmalarında, iki düzen arasındaki ilişki, Rickettsiales, Pelagibacteriales ve soyu tükenmiş protomitokondriyi içeren Rickettsidae alt sınıfında korunur (mitokondrilerin kendileri bakteri değil, organellerdir).
indirgeyici evrim
Rickettsiales genomları indirgeyici evrim geçirmektedir ve tipik olarak küçük (genellikle < 1,5 Mbp), AT açısından zengindir (genellikle < %40 GC), düşük kodlama yoğunluğuna (genellikle < %85) ve nispeten yüksek sayıda psödojene sahiptir. Genom boyutunda, % GC'de ve kodlama yoğunluğunda ve genlerde azalma genellikle genetik sürüklenme ve Muller's cırcır ile ilişkilendirilir . Düşük popülasyon büyüklükleri (endosimbiyotik yapıları göz önüne alındığında) ve sık popülasyon darboğazları nedeniyle Rickettsiales genomlarında genetik sürüklenme artar. Benzer şekilde, Müller'in mandalı, rekombinasyon ve yatay gen transferi eksikliği yoluyla aktive edilir (ökaryotik konakçı hücre doğal bir bariyerdir).
Referanslar
 
|
Bu Alfaproteobacteria lı makale bir taslaktır . Vikipedi'yi genişleterek yardımcı olabilirsiniz . |