parakaspaz - Paracaspase

Paracaspases (insan: MALT1 ) C14 ailesinin üyeleridir sistein proteazlar . Paracaspases olan proteinler ile ilişkili kaspaz hayvan ve içinde mevcut balçık kalıp aksine, metacaspases bulunurlar, bitkiler , mantarlar ve " protistler ". Sümüksü küf, hayvan/mantar ayrımından daha önce ayrıldığından filogenetik dağılım biraz kafa karıştırıcıdır.

Parakaspaz ilk olarak MALT lenfomanın bir alt kümesiyle ilişkili tekrarlayan bir t(11;18)(q21;q21) kromozomal translokasyonunda tanımlanmıştır . Karboksil terminaline oluşan onkoprotein bir füzyon Bu yol açar MALT1 ve amino terminaline c-IAP2 . Parakaspazlar, metakaspazlardan daha fazla kaspazlara benzerler; bu, bu proteaz grubunun, ortak bir metakaspaz atadan gelen kaspazlardan ayrıldığını gösterir.

Yapı ve Evrim

Amiplerde veya bakterilerde bulunan metazoan olmayan parakaspazların çoğu , yalnızca kaspaz benzeri bir alana sahip "tip 2" parakaspazlardır. Hayvan parakaspazları büyük olasılıkla doğrudan amip paracaspaz ile ilgili değildir. Ökaryotlarda bulunan parakaspazların (ve kaspazların) prokaryotlardan birkaç (en az 2) bağımsız yatay gen transferi olayının bir sonucu olup olmadığı veya metakaspazlardan evrimleşen (para)kaspazların yakınsak bir evrimi olup olmadığı şu anda belirsizdir . ökaryotlarda farklı organizmalar.

Hayvanlar

"Tip 2"

Hayvanlardaki "tip 2" parakaspazlar, yalnızca kaspaz benzeri bir alandan oluşan atalara ait formu temsil eder. Paracaspase Bu tür bulunabilir ctenophora , placozoa , sünger ve cnidarians . Cnidarians ayrıca "tip 1" parakaspazlara sahiptir.

"Tip 1"

Tip 1 paracaspazların filogenetik ağacı.
Tür anahtarı: Hs= İnsan, Gg = Tavuk, Xt = Afrika pençeli kurbağası, Dr = Zebra balığı, Cm = Fil Köpekbalığı, Pm = Lamprey, Bf = Lancelet, Sk = Palamut solucanı, Cg = Pasifik istiridyesi, Ob = Ahtapot, Dp = Daphnia, Am = Bal arısı, Ce = nematod, Nv = Nematostella, Hv = Hydra.

"Tip 1" paracaspases bir ile karakterize edilir MALT1 bir ile alan bileşimin benzeri ölüm alanı , immünoglobulin benzeri alan ve bir kaspaz-benzeri alan. "Tip 1" parakaspazlar ilk olarak bilaterans ve cnidaria'nın son ortak atasından bir süre önce ortaya çıkmıştır , bu da "tip 1" parakaspazların ediacaran döneminde ortaya çıktığını gösterir . Çeneli omurgalıların başlayarak ( köpekbalığı ) 3 olması paralogunu : PCASP1 , PCASP2 ve PCASP3 . PCASP3 atalarının kopyasıdır ve tüm bulunabilir deuterostomes gibi, deniz kestanesi , lancelets , gömlekliler ve lamprey balıklarının (non çeneli omurgalı ). Özellikle, memeliler PCASP2 ve PCASP3'ü kaybetmiştir ve sadece PCASP1'e (MALT1) sahiptir. PCASP3'e en yakın döterostome olmayan omurgasız tip 1 parakaspaz şaşırtıcı bir şekilde yumuşakçalarda bulunabilir; bu, ilk bilateranlarda (cnidarians'ta olduğu gibi) 2 paralog tip 1 parakaspaz bulunduğunu ve farklı bilateran soylarının bir veya diğer paralog.

Bilinen işlevler

amipler

Dictyostelium'daki paracaspaz, vakuolar genişleme ile ozmotik stres toleransını düzenler gibi görünmektedir.

Hayvanlar

Hayvanlarda parakaspaz çoğunlukla insanlarda ve farelerde incelenmiştir (bakınız: MALT1 ), burada doğuştan gelen ve adaptif bağışıklıkta çeşitli proinflamatuar yolaklarda önemli bir rol oynar . Uzaktan ilişkili zebra balığı PCASP3 , NF-kappaB aktivasyonunda ve proteaz substrat spesifikliğinde korunmuş MALT1 benzeri aktivite gösterir; bu, bu fonksiyonların üç omurgalı paracaspaz paralogunun son ortak atasında mevcut olduğunu gösterir .

Ayrıca bakınız

Referanslar

  1. ^ Minina EA, Staal J, Alvarez VE, Berges JA, Berman-Frank I, Beyaert R; ve diğerleri (2020). "Metakaspazların ve Parakaspazların Sınıflandırılması ve Adlandırılması: Kaspazlarla Artık Karışıklık Yok" . Mol Hücre . 77 (5): 927-929. doi : 10.1016/j.molcel.2019.12.020 . PMC  7325697 . PMID  32142688 .CS1 bakımı: birden çok ad: yazar listesi ( bağlantı )
  2. ^ Uren A, O'Rourke K, Aravind L, Pisabarro M, Seshagiri S, Koonin E, Dixit V (2000). "Parakaspazların ve metakaspazların tanımlanması: biri MALT lenfomada önemli bir rol oynayan iki eski kaspaz benzeri protein ailesi" . Mol Hücre . 6 (4): 961–7. doi : 10.1016/S1097-2765(05)00086-9 . PMID  11090634 .
  3. ^ a b c d e Hulpiau P, Driege Y, Staal J, Beyaert R (2016). "MALT1 sonuçta yalnız değil: yeni paracaspazların tanımlanması". Hücresel ve Moleküler Yaşam Bilimleri . 73 (5): 1103-1116. doi : 10.1007/s00018-015-2041-9 . PMID  26377317 .
  4. ^ Staal, Jens; Driege, Yasemin; Haegman, Mira; Borghi, Alice; Hulpiau, Paco; Lievens, Laurens; Gül, İsmail Şahin; Sundararaman, Srividhya; Gonçalves, Amanda; Dhondt, Ineke; Pinzon, Jorge H.; Braeckman, Bart P.; Technau, Ulrich; Says, Yvan; van Roy, Frans; Beyaert, Rudi (2018). "CARD-Coiled Coil/Bcl10/MALT1-Benzeri Paracaspase Signaling Complex'in Antik Kökeni Bilinmeyen Kritik Fonksiyonları Gösterir" . İmmünolojide Sınırlar . 9 : 1136. doi : 10.3389/fimmu.2018.01136 . ISSN  1664-3224 . PMC  5978004 . PMID  29881386 .
  5. ^ Saheb E, Biton I, Maringer K, Bush J (2013). "Dictyostelium paracaspase'in kasılma vakuolü ve vakuolar proton ATPaz'ın olası bir ortağı ile işlevsel bir bağlantısı". J Biosci . 38 (3): 509–21. doi : 10.1007/s12038-013-9338-3 . PMID  23938384 .