Fumarat liyaz - Fumarate lyase

Lyase
Tanımlayıcılar
Sembol Lyase_1
Pfam PF00206
InterPro IPR000362
PROSITE PDOC00147
SCOP2 1jsw / SCOPe / SUPFAM
CDD cd01362

Fumarat liyaz , enzimlerin liyaz sınıfının bir substratıdır .

Muhtemelen bu tip enzimlerin katalitik aktivitesinde rol oynayan bir metiyonin etrafında kısa bir korunmuş sekansı paylaştığı gösterilmiştir . Aşağıdakiler bu ailenin üyelerine örnektir:

  • 3-karboksimukonat laktonize edici enzim, EC 5.5.1.2 (3-karboksi-cis, cis-mukonat sikloizomeraz), aromatik asitlerin katabolizmasında rol oynayan bir enzim.
  • Delta-kristalin, arginosüksinat liyaz ile yaklaşık% 90 sekans özdeşliğini paylaşır ve bunun bir 'kaçırılmış' enzim örneği olduğunu gösterir - ancak biriken mutasyonlar proteini enzimatik olarak inaktif hale getirmiştir.
  • Sınıf I Fumaraz enzimi, EC 4.2.1.2 ( fumarat hidrataz ), fumaratın L- malata geri dönüşümlü hidrasyonunu katalize eder. Sınıf I enzimler termolabil dimerik enzimlerdir (örneğin: Escherichia coli fumA ve fumB).
  • Argininin biyosentezinde son adım olan argininosüksinattan arginin ve fumarat oluşumunu katalize eden argininosüksinaz, EC 4.3.2.1 ( argininosüksinat liyaz ).
  • Aspartatın fumarata ve amonyağa geri dönüşümlü dönüşümünü katalize eden aspartat amonyak-liyaz, EC 4.3.1.1 ( aspartaz ). Bu reaksiyon, trans-eliminasyon reaksiyonunda su yerine amonyağın yer alması dışında fumaraz tarafından katalize edilene benzerdir.
  • sınıf II Fumaraz enzimi, EC 4.2.1.2 , termostabil ve tetrameriktir ve prokaryotlarda (örneğin: Escherichia coli fumC) ve ökaryotlarda bulunur. İki fumaraz sınıfının dizisi yakından ilişkili değildir.
  • Pürinlerin de novo biyosentezinde sekizinci adımı katalize eden Adenilosüksinaz, EC 4.3.2.2 ( adenilosüksinat liyaz ), 5'-fosforibosil-5-amino-4-imidazolkarboksamid ve 1- (5-fosforibosil) 'den fumarat oluşumu - 4- (N-suksino-karboksamid). Bu enzim ayrıca adenilosüksinattan fumarat ve AMP oluşumunu da katalize edebilir .

Referanslar

Bu makale, kamu malı Pfam ve InterPro : IPR000362'den metin içermektedir.