BECN1 - BECN1

BECN1
Mevcut yapılar
PDB	Ortologtur arama: PDBe RCSB
PDB kimlik kodlarının listesi
	2P1L , 2PON , 3DVU , 4DDP , 4MI8
tanımlayıcılar
takma adlar	BECN1 , ATG6, VPS30, beclin1, beclin 1
Harici kimlikler	OMIM : 604378 MGI : 1891828 HomoloGene : 2794 GeneCards : BECN1
Gen konumu ( İnsan )
Chr.	Kromozom 17 (insan)
Son	42.833.350 bp
Gen konumu ( Fare )
Chr.	Kromozom 11 (fare)
Son	101.302.286 baz puan
RNA ifade modeli
	; ;
	Daha fazla referans ifade verisi
Gen ontolojisi
moleküler fonksiyon	• fosfatidilinositol 3-kinaz bağlanması ; • GO:0001948 protein bağlanması ; • GTPaz bağlanması ; • ubikuitin protein ligaz bağlanması ; • protein kinaz bağlanması ; • protein homodimerizasyon aktivitesi;
Hücresel bileşen	• endozom membran ; • sitoplazma ; • mitokondriyal membran ; • trans Golgi ağı ; • Golgi aygıtı ; • sitosol ; • çekirdeği ; • otofagozom ; • phagophore Montaj yerine ; • membran ; • dendrit ; • endoplazmik retikulum ; • fosfatidilinositol 3-kinaz, karmaşık, sınıf III ; • endoplazmik retikulum membran ; • fosfatidilinositol 3- kompleksi, sınıf III kinaz II tip ; • GO: 0016023 sitoplazmik vezikül ; • endozom ; • dış bileşen membran ; • fosfatidilinositol 3-kinaz, karmaşık, sınıf III, tip I ; • fagositik kesecik ; • mitokondri ; • protein içeren kompleks;
biyolojik süreç	• hücre popülasyonu proliferasyonunun negatif düzenlenmesi ; • hipoksiye yanıt ; • alüminyum iyonuna hücresel yanıt ; • E vitaminine yanıt ; • lizozom organizasyonu ; • hücre döngüsü ; • fosfatidilinositol 3-kinaz sinyalinin pozitif düzenlenmesi ; • glukoz açlığına hücresel yanıt ; • hücresel savunma yanıtı ; • sitokinez ; • epidermal büyüme faktörü uyarıcıya hücresel yanıt ; • hücre bölünmesi ; • alıcı katabolik işlem ; • çekirdeğin otofajinin ; • azot açlık hücresel yanıt ; • GO: 0022415, viral işlem ; • vakuol taşımaya geç endozom ; • apoptosis ; • CVT ile vaküol taşıma sitoplazmadan yolu ; • endositoz ; • apoptotik hücrenin yutulması ; • mitotik iğ mikrotübüllerinin kinetokora bağlanmasının pozitif regülasyonu ; • amiloid-beta metabolik süreç ; • nöron gelişimi ; • virüse karşı savunma yanıtı ; • diğer organizmaya yanıt ; • mitotik metafaz plaka kongresi ; • ilaca yanıt ; • GO:0048552 regülasyonu katalitik aktivite ; • reaktivasyonun negatif düzenlenmesi E oksijen türü metabolizma ; • sitokinez düzenlenmesi ; • apoptotik prosesin negatif düzenlenmesi ; • hücre ölümünün negatif düzenlenmesi ; • otofagozom düzeneği ; • macroautophagy ; • yaşlanma ; • (II) iyonu, demir yanıt ; • talebi iyonuna karşılık ; • Protein deubiquitination ; • besin seviyelerine yanıt ; • amino asit açlık hücresel yanıt ; • hidrojen peroksite hücresel yanıt ; • bakır iyonuna hücresel yanıt ; • lizozom kuruluşun negatif düzenlenmesi ; • otofagozom tertibatı pozitif düzenleme ; • mitokondrinin otofajinin ; • mitophagy ; • otofajinin ; • otofajinin pozitif düzenleme ; • mitokondriyal depolarizasyon yanıt ; • erken geç endozom taşımaya endosome ; • otofajinin negatif regülasyon ; • kalp kası hipertrofisi pozitif düzenleme ; • otofagozom montaj negatif regülasyon ; • iç apoptotik sinyal yolunun olumlu düzenleme;
	Kaynaklar: Amigo / QuickGO
ortologlar
	8678
	56208
	ENSG000000126581
	ENSMUSG00000035086
	Q14457
	O88597
	NM_001313998 ; NM_001313999 ; NM_001314000 ; NM_003766
	NM_019584 ; NM_001359819 ; NM_001359820 ; NM_001359821
	NP_001300927 ; NP_001300928 ; NP_001300929 ; NP_003757
	NP_062530 ; NP_001346748 ; NP_001346749 ; NP_001346750
	Vikiveri
İnsan Görüntüle/Düzenle	Fareyi Görüntüle/Düzenle

Beclin-1 a, bir protein , insanlarda tarafından kodlandığını BECN1 geni . Beclin-1, C. elegans nematodundaki maya otofajisi ile ilişkili gen 6 (Atg6) ve BEC-1'in bir memeli ortologudur . İle ya Bu protein etkileşime BCL-2 veya PI3k iki düzenlenmesinde önemli bir rol oynayan sınıf III, otofaji ve hücre ölümü .

Hastalıktaki rolü

Beclin-1 , otofajik programlanmış hücre ölümünde rol oynayan tümörijenez ve nörodejenerasyonda önemli bir rol oynar . Artmış otofajiye sahip yumurtalık kanseri , daha az agresif bir davranışa sahiptir ve kemoterapiye daha duyarlıdır.

Şizofreni , etkilenen kişinin hipokampusunda düşük seviyelerde Beclin-1 ile ilişkilidir ve bu da azalmış otofajiye neden olur ve bu da artan nöronal hücre ölümü ile sonuçlanır.

Etkileşimler

BECN1'in aşağıdakilerle etkileşime girdiği gösterilmiştir :

modülatörler

trehaloz: Trehaloz P62 / Beclin-1 oranı ve artar azaltır otofajiyi muhtemelen Beclin-1 artırarak, ICR farelere frontal korteksinde.

Referanslar

daha fazla okuma

Funderburk SF, Wang QJ, Yue Z (Haziran 2010). "Beclin 1-VPS34 kompleksi - otofajinin ve ötesinin kavşağında" . Hücre Biyolojisindeki Eğilimler . 20 (6): 355–62. doi : 10.1016/j.tcb.2010.03.002 . PMC 3781210 . PMID 20356743 .
Rommens JM, Durocher F, McArthur J, Tonin P, LeBlanc JF, Allen T, et al. (Ağustos 1995). "17q21'de BRCA1'e sentromerik HSD17B lokusunda bir transkripsiyon haritasının üretilmesi". genomik . 28 (3): 530–42. doi : 10.1006/geno.1995.1185 . PMID 7490091 .
Maruyama K, Sugano S (Ocak 1994). "Oligo-kaplama: ökaryotik mRNA'ların başlık yapısını oligoribonükleotidlerle değiştirmek için basit bir yöntem". gen . 138 (1–2): 171–4. doi : 10.1016/0378-1119(94)90802-8 . PMID 8125298 .
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (Ekim 1997). "Bir tam uzunlukta zenginleştirilmiş ve bir 5'-uç zenginleştirilmiş cDNA kitaplığının yapımı ve karakterizasyonu". gen . 200 (1–2): 149–56. doi : 10.1016/S0378-1119(97)00411-3 . PMID 9373149 .
Aita VM, Liang XH, Murty VV, Pincus DL, Yu W, Cayanis E, et al. (Temmuz 1999). "Klonlama ve beclin 1'in genomik organizasyonu, kromozom 17q21 üzerinde bir aday tümör baskılayıcı gen". genomik . 59 (1): 59–65. doi : 10.1006/geno.1999.5851 . PMID 10395800 .
Liang XH, Jackson S, Denizci M, Brown K, Kempkes B, Hibshoosh H, Levine B (Aralık 1999). "Beclin 1 tarafından otofajinin indüksiyonu ve tümörijenezin inhibisyonu". Doğa . 402 (6762): 672–6. Bibcode : 1999Natur.402..672L . doi : 10.1038/45257 . PMID 10604474 . S2CID 4423132 .
Kihara A, Kabeya Y, Ohsumi Y, Yoshimori T (Nisan 2001). "Trans-Golgi ağındaki Beclin-fosfatidilinositol 3-kinaz kompleksi fonksiyonları" . EMBO Raporları . 2 (4): 330–5. doi : 10.1093/embo-reports/kve061 . PMC 1083858 . PMID 11306555 .
Liang XH, Yu J, Brown K, Levine B (Nisan 2001). "Beclin 1, otofajisi ve tümör baskılayıcı işlevi için gerekli olan lösin açısından zengin bir nükleer dışa aktarma sinyali içerir". Kanser Araştırması . 61 (8): 3443–9. PMID 11309306 .
Weinmann AS, Bartley SM, Zhang T, Zhang MQ, Farnham PJ (Ekim 2001). "Yeni E2F hedef promotörlerini klonlamak için kromatin immünopresipitasyonunun kullanımı" . Moleküler ve Hücresel Biyoloji . 21 (20): 6820–32. doi : 10.1128/MCB.21.20.6820-6832.2001 . PMC 99859 . PMID 11564866 .
Yue Z, Horton A, Bravin M, DeJager PL, Selimi F, Heintz N (Ağustos 2002). "Delta 2 glutamat reseptörü ve otofajiyi birbirine bağlayan yeni bir protein kompleksi: lurcher farelerde nörodejenerasyon için çıkarımlar" . Nöron . 35 (5): 921–33. doi : 10.1016/S0896-6273(02)00861-9 . PMID 12372286 . S2CID 10534933 .
Song H, Xia SL, Liao C, Li YL, Wang YF, Li TP, Zhao MJ (Şubat 2004). "Pir51, Beclin 1, RbAp48 ve aldolaz b'yi kodlayan genler, insan birincil hepatoselüler karsinomunda yukarı veya aşağı regüle edilir" . Dünya Gastroenteroloji Dergisi . 10 (4): 509–13. doi : 10.3748/wjg.v10.i4.509 . PMC 4716970 . PMID 14966907 .
Scarlatti F, Bauvy C, Ventruti A, Sala G, Cluzeud F, Vandewalle A, et al. (Nisan 2004). "Seramid aracılı makrootofaji, protein kinaz B'nin inhibisyonunu ve beclin 1'in yukarı regülasyonunu içerir" . Biyolojik Kimya Dergisi . 279 (18): 18384-91. doi : 10.1074/jbc.M313561.200 . PMID 14970205 .
Furuya D, Tsuji N, Yagihashi A, Watanabe N (Temmuz 2005). "Beclin 1, kaspaz-9 aktivitesinin arttırılması yoluyla cis-diamindikloroplatin ile indüklenen apoptozu artırdı". Deneysel Hücre Araştırması . 307 (1): 26-40. doi : 10.1016/j.yexcr.2005.02.023 . PMID 15922724 .
Kruse KB, Brodsky JL, McCracken AA (Ocak 2006). "Bir ERAD geninin VPS30/ATG6 olarak karakterizasyonu, iki alternatif ve işlevsel olarak farklı protein kalite kontrol yolunu ortaya koymaktadır: biri insan alfa-1 proteinaz inhibitörünün (A1PiZ) çözünür Z varyantı için ve diğeri A1PiZ agregatları için" . Hücrenin Moleküler Biyolojisi . 17 (1): 203–12. doi : 10.1091/mbc.E04-09-0779 . PMC 1345659 . PMID 16267277 .
Zeng X, Overmeyer JH, Malta WA (Ocak 2006). "Endositoz ve lizozomal enzim kaçakçılığına karşı makrootofajide memeli Beclin-Vps34 PI 3-kinaz kompleksinin fonksiyonel özgüllüğü" . Hücre Bilimi Dergisi . 119 (Pt 2): 259–70. doi : 10.1242/jcs.02735 . PMID 16390869 .
Shibata M, Lu T, Furuya T, Degterev A, Mizushima N, Yoshimori T, et al. (Mayıs 2006). "Mutant Huntingtin'in hücre içi birikiminin Beclin 1 tarafından düzenlenmesi" . Biyolojik Kimya Dergisi . 281 (20): 14474–85. doi : 10.1074/jbc.M600364200 . PMID 16522639 .
Lim J, Hao T, Shaw C, Patel AJ, Szabó G, Rual JF, et al. (Mayıs 2006). "İnsan kalıtsal ataksiler ve Purkinje hücre dejenerasyonu bozuklukları için bir protein-protein etkileşim ağı" . Hücre . 125 (4): 801–14. doi : 10.1016/j.cell.2006.03.032 . PMID 16713569 . S2CID 13709685 .
Daniel F, Legrand A, Pessayre D, Vadrot N, Descatoire V, Bernuau D (Mayıs 2006). "Kısmi Beclin 1 susturma HepG2 hücrelerinde doksorubisin- ve Fas kaynaklı apoptozu şiddetlendirir" . Dünya Gastroenteroloji Dergisi . 12 (18): 2895–900. doi : 10.3748/wjg.v12.i18.2895 . PMC 4087807 . PMID 16718815 .

Dış bağlantılar

UCSC Genom Tarayıcısında insan BECN1 genom konumu ve BECN1 gen ayrıntıları sayfası .
Bulunan tüm yapısal bilgi genel PDB için Uniprot : Q14457 de (Beclin-1) PDBe-KB .

Languages

In other projects