Sinyal tanıma parçacık reseptörü - Signal recognition particle receptor
| Sinyal tanıma parçacığı (SRP) reseptörü alfa alt birimi, N-terminali | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 Ökaryotik sinyal tanıma parçacık reseptörünün beta alt biriminin yapısı.
| |||||||||
| tanımlayıcılar | |||||||||
| Sembol | SRX | ||||||||
| Pfam | PF09201 | ||||||||
| InterPro | IPR015284 | ||||||||
| SCOP2 | 1nrj / KAPSAM / SUPFAM | ||||||||
| OPM süper ailesi | 136 | ||||||||
| OPM proteini | 1nrj | ||||||||
| membran | 38 | ||||||||
| |||||||||
Docking protein olarak da adlandırılan sinyal tanıma partikülü (SRP) reseptörü , memeli hücrelerinde yalnızca kaba ER ile ilişkili olan 2 farklı alt birimden oluşan bir dimerdir . Ana işlevi, SRP birimlerini tanımlamaktır . SRP (sinyal tanıma parçacık) a, molekül yardımcı ribozom -mRNA- polipeptid kompleksi ile yerleşmek için membran arasında endoplazmik retikulum .
Ökaryotik SRP reseptörü (SR olarak adlandırılır ), her ikisi de bir GTP bağlama alanı içeren SR-alfa (70 kDa; SRPRA ) ve SR-beta'nın (25 kDa; SRPRB ) bir heterodimeridir , prokaryotik SRP reseptörü ise yalnızca monomerik gevşek membran bağlantılı SR-alfa homologu FtsY ( P10121 ).
SRX alanı
SR-alfa, SRP-ribozom-yeni oluşan polipeptit komplekslerinin translokona hedeflenmesini düzenler . SR-alfa, SRP kompleksinin SRP54 alt birimine bağlanır. SR-beta alt birimi, SR-alfa alt birimini (periferik bir zar GTPazı) ER zarına bağlayan bir zar-ötesi GTPaz'dır. SR-beta, bakteriyel FtsY homologunda bulunmayan SR-alfa'nın N-terminal SRX-alanıyla etkileşime girer. SR-beta ayrıca, SRP-yeni polipeptidin protein ileten kanala alınmasında da işlev görür.
SRX ailesi, SR reseptörünün alfa alt biriminin ökaryotik homologlarını temsil eder. Bu girdinin üyeleri, bir tarafta alfa1 sarmal ve diğer tarafta sarmallar alpha2-alpha4 ile sıkıştırılmış merkezi altı iplikli anti-paralel beta yaprağından oluşur. Rap-Raf, Ras-PI3K(gama), Ras-RalGDS ve Arl2-PDE(delta) dahil olmak üzere küçük G protein efektör komplekslerinin bir sınıfıyla eşleşen bir kompleks oluşturarak küçük GTPaz SR-beta ile etkileşime girerler. SR-alfa ve FtsY'nin C-terminalinde SRP54'e benzer bir bölge bulunur.
NG alanı
Reseptör , her iki protein tarafından paylaşılan bir 4-sarmal demetli "N" alanının ( InterPro : IPR013822 ) ve bir GTPaz "G" alanının ( InterPro : IPR000897 ) bir kombinasyonu olan "NG alanı" ile SPR54/Ffh'ye bağlanır . Bağlı yapı, hedefleme kompleksi olarak adlandırılan yarı simetrik bir heterodimerdir.
Sinyal tanıma parçacığı (SRP)
Sinyal tanıma parçacık (SRP) konjügat reseptörü (SR) ile birlikte, ökaryotlarda granüllü endoplazmik retikulum (RER) membrana salgılama proteinlerini hedef yer, veya prokaryotlar içine plazma zarına bir multimerik proteinidir. SRP, ribozom üzerindeki yeni oluşan polipeptidin sinyal dizisini tanır, uzamasını geciktirir ve SRP-ribozom-polipeptid kompleksini SR reseptörü aracılığıyla RER zarına yerleştirir. SRP, altı polipeptitten (SRP9, SRP14, SRP19, SRP54, SRP68 ve SRP72) ve tek bir 300 nükleotid 7S RNA molekülünden oluşur. RNA bileşeni, SRP'nin SR reseptörü ile etkileşimini katalize eder. Daha yüksek ökaryotlarda, SRP kompleksi, Alu alanından ve SRP RNA tarafından bağlanan S alanından oluşur. Alu alanı, SRP RNA'nın 5' ve 3' terminal dizilerine bağlı bir SRP9 ve SRP14 heterodimerinden oluşur. Bu alan, SRP'ye ribozom-polipeptit kompleksini RER zarına yerleştirmek için zaman veren yeni oluşan polipeptit zincirinin uzamasını geciktirmek için gereklidir.