RasGEF alanı - RasGEF domain
RasGEF alanı | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
tanımlayıcılar | |||||||||||
Sembol | RasGEF | ||||||||||
Pfam | PF00617 | ||||||||||
InterPro | IPR001895 | ||||||||||
AKILLI | RasGEF | ||||||||||
PROZİT | PDOC00594 | ||||||||||
SCOP2 | 1bkd / KAPSAM / SUPFAM | ||||||||||
OPM proteini | 1xd4 | ||||||||||
CDD | cd00155 | ||||||||||
|
RasGEF alanı alanı CDC25 bulunan bir ailenin bir guanin nükleotid değişim faktörleri için Ras benzeri küçük GTPases .
Ras proteinleri, GTP ve GDP'yi bağlayan ve GTP'yi GDP'ye yavaşça hidrolize eden zarla ilişkili moleküler anahtarlardır. GTP'ye bağlı (aktif) ve GDP'ye bağlı (etkin olmayan) durumlar arasındaki denge, GTPaz aktivitesini aktive eden proteinlerin ve bağlı GDP'nin kaybını ve taze GTP'nin alımını destekleyen proteinlerin zıt hareketi ile düzenlenir. İkinci proteinler, guanin-nükleotit ayrışma uyarıcıları (GDS'ler) (veya ayrıca guanin-nükleotit salma (veya değişim) faktörleri (GRF'ler) olarak bilinirler). GDS olarak görev yapan proteinler, dizi benzerlikleri temelinde en az iki ailede sınıflandırılabilir : CDC24 ailesi (bakınız InterPro : IPR001331 ) ve bu CDC25 (RasGEF) ailesi.
CDC25 ailesinin proteinlerinin boyutu 309 kalıntıdan (LTE1) 1596 kalıntıya (sos) kadar değişmektedir. Tüm bu proteinler tarafından paylaşılan dizi benzerliği, genellikle C-terminal bölümlerinde yer alan yaklaşık 250 amino asitlik bir bölge ile sınırlıdır (şu anda tek istisna, bu alanın proteinin merkezi kısmını oluşturduğu sos ve ralGDS'dir). Bu alanın, CDC25'te bir SCD25'te, bu proteinlerin aktivitesi için gerekli olduğu gösterilmiştir.
Bu alanı içeren insan proteinleri
KNDC1 ; PLCE1 ; RALGDS ; RALGPS1 ; RALGPS2 ; RAPGEF1 ; RAPGEF2 ; RAPGEF3 ; RAPGEF4 ; RAPGEF5 ; RAPGEF6 ; RAPGEFL1 ; RASGEF1A ; RASGEF1B ; RASGEF1C ; RASGRF1 ; RASGRF2 ; RASGRP1 ; RASGRP2 ; RASGRP3 ; RASGRP4 ; RGL1 ; RGL2 ; RGL3 ; RGL4/RGR ; SOS1 ; SOS2 ;
Referanslar
daha fazla okuma
- Boguski, MS ; McCormick, F (1993). "Ras ve akrabalarını düzenleyen proteinler". Doğa . 366 (6456): 643-54. Bibcode : 1993Natur.366..643B . doi : 10.1038/366643a0 . PMID 8259209 . S2CID 4338237 .
- Quilliam, Los Angeles; Khosravi-Far, R; Huff, SY; Der, CJ (1995). "Guanine nükleotid değişim faktörleri: Proteinlerin Ras süper ailesinin aktivatörleri". Biyolojik Makaleler . 17 (5): 395-404. doi : 10.1002/bies.950170507 . PMID 7786285 . S2CID 22140430 .
- Li, N; Batzer, A; Daly, R; Yajnik, V; Skolnik, E; Chardin, P; Bar-Sagı, D; Margolis, B; Schlessinger, J (1993). "Guanin-nükleotid salma faktörü hSos1, Grb2'ye bağlanır ve reseptör tirozin kinazları Ras sinyaline bağlar". Doğa . 363 (6424): 85-8. Bibcode : 1993Natur.363...85L . doi : 10.1038/363085a0 . PMID 8479541 . S2CID 4323174 .
- Skolnik, EY; Batzer, A; Li, N; Lee, CH; Lowenstein, E; Muhammedi, M; Margolis, B; Schlessinger, J (1993). "İnsülin reseptörünü Ras sinyal yollarına bağlamada GRB2'nin işlevi". Bilim . 260 (5116): 1953–5. Bibcode : 1993Sci...260.1953S . doi : 10.1126/science.8316835 . PMID 8316835 .