DARBE-TFI - COUP-TFI

NR2F1
Mevcut yapılar
PDB	Ortologtur arama: PDBe RCSB
PDB kimlik kodlarının listesi
	2EBL
tanımlayıcılar
takma adlar	NR2F1 , BBOAS, BBSOAS, COUP-TFI, EAR-3, EAR3, ERBAL3, NR2F2, SVP44, TCFCOUP1, TFCOUP1, nükleer reseptör alt ailesi 2 grup F üye 1, COUPTF1
Harici kimlikler	OMIM : 132890 MGI : 1352451 HomoloGene : 21158 GeneCards : NR2F1
Gen konumu ( İnsan )
Chr.	Kromozom 5 (insan)
Son	93.594.611 baz puan
Gen konumu ( Fare )
Chr.	Kromozom 13 (fare)
Son	78.199.757 baz puan
RNA ifade modeli
	; ;
	Daha fazla referans ifade verisi
Gen ontolojisi
moleküler fonksiyon	• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA bağlayıcı transkripsiyon faktörü aktivitesi ; • steroid hormon reseptör aktivitesi ; • diziye özgü DNA bağlanması ; • GO:0001105 transkripsiyon koaktivatör aktivitesi ; • DNA bağlanması ; • GO:0038050, GO: 0004886, GO:0038051 nükleer reseptör aktivitesi ; • çinko iyonu bağlanması ; • GO:0001948 protein bağlanması ; • metal iyonu bağlanması ; • GO:0000980 RNA polimeraz II cis-düzenleyici bölge sekansına özgü DNA bağlanması ; • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA bağlayıcı transkripsiyon baskılayıcı aktivite, RNA polimeraz II'ye özgü ; • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA bağlayıcı transkripsiyon faktörü aktivitesi, RNA polimeraz II'ye özgü ; • retinoik aside duyarlı element bağlama;
Hücresel bileşen	• çekirdek ; • nükleoplazma ; • sitozol;
biyolojik süreç	• transkripsiyon başlatma RNA'dan II promotörü Polimeraz ; • transkripsiyonun düzenlenmesini, DNA şablonu ; • RNA tarafından transkripsiyonu negatif düzenlenmesi II Polimeraz ; • transkripsiyonu, DNA şablonu ; • sinyal transdüksiyon ; • steroid hormon kaynaklı sinyalizasyon yolunun ; • hücre içi reseptör sinyalleme yolağı ; • nükleik pozitif düzenleme asit şablonlu transkripsiyon ; • sinir sistemi gelişimi ; • nöron projeksiyon gelişiminin negatif regülasyonu ; • RNA polimeraz II tarafından transkripsiyonun pozitif regülasyonu;
	Kaynaklar: Amigo / QuickGO
ortologlar
	7025
	13865
	ENSG00000175745
	ENSMUSG00000069171
	P10589
	Q60632
	NM_005654
	NM_010151 ; NM_001347538 ; NM_001347539
	NP_005645
	NP_001334467 ; NP_001334468 ; NP_034281
	Vikiveri
İnsan Görüntüle/Düzenle	Fareyi Görüntüle/Düzenle

DARBE-TF1 ( DARBE T ranscription F aktör 1 olarak da bilinir) NR2F1 ( N uclear R çifti donörlüğü alt ailesi 2 , grup F , elemanı 1 ) a, proteinin insanlarda tarafından kodlandığını NR2F1 geni . Bu protein, steroid hormon reseptörlerinin nükleer hormon reseptör ailesinin bir üyesidir .

İşlev

Coup (tavuk ovalbümin yukarı akış promotörü) transkripsiyon faktörü , ovalbümin promotörüne bağlanır ve başka bir proteinle ( S300-II ) birlikte transkripsiyonun başlamasını uyarır . COUP-TF1 , 5'-AGGTCA-3' motifinin hem doğrudan tekrarlarına hem de palindromlarına bağlanır .

Etkileşimler

COUP-TFI'nin aşağıdakilerle etkileşime girdiği gösterilmiştir :

BCL11A ,
BCL11B ,
COPS2 ve
ESR1 .

Klinik

Bu gendeki mutasyonlar, Bosch-Boonstra-Schaaf optik atrofi sendromu ile ilişkilendirilmiştir .

Referanslar

Dış bağlantılar

UCSC Genom Tarayıcısında insan NR2F1 genom konumu ve NR2F1 gen ayrıntıları sayfası .
UCSC Genom Tarayıcısında insan NR2F2 genom konumu ve NR2F2 gen ayrıntıları sayfası .

daha fazla okuma

Kliewer SA, Umesono K, Heyman RA, Mangelsdorf DJ, Dyck JA, Evans RM (Şubat 1992). "Retinoid X reseptörü-COUP-TF etkileşimleri, retinoik asit sinyalini modüle eder" . Amerika Birleşik Devletleri Ulusal Bilimler Akademisi Bildirileri . 89 (4): 1448–52. Bibcode : 1992PNAS...89.1448K . doi : 10.1073/pnas.89.4.1448 . PMC 48468 . PMID 1311101 .
Berrodin TJ, Marks MS, Ozato K, Linney E, Lazar MA (Eylül 1992). "Tiroid hormonu reseptörü, retinoik asit reseptörü, retinoid X reseptörü, tavuk ovalbümin yukarı akış promotör transkripsiyon faktörü ve bir endojen karaciğer proteini arasında heterodimerizasyon". Moleküler Endokrinoloji . 6 (9): 1468–78. doi : 10.1210/me.6.9.1468 . PMID 1331778 .
Ing NH, Beekman JM, Tsai SY, Tsai MJ, O'Malley BW (Eylül 1992). "Steroid hormonu reseptörü süper ailesinin üyeleri, TFIIB (S300-II) ile etkileşime girer" . Biyolojik Kimya Dergisi . 267 (25): 17617–23. doi : 10.1016/S0021-9258(19)37087-5 . PMID 1517211 .
Wang LH, Tsai SY, Cook RG, Beattie WG, Tsai MJ, O'Malley BW (Tem 1989). "COUP transkripsiyon faktörü, steroid reseptör süper ailesinin bir üyesidir". Doğa . 340 (6229): 163–6. Bibcode : 1989Natur.340..163W . doi : 10.1038/340163a0 . PMID 2739739 . S2CID 4364164 .
Miyajima N, Kadowaki Y, Fukushige S, Shimizu S, Semba K, Yamanashi Y, Matsubara K, Toyoshima K, Yamamoto T (Aralık 1988). "Moleküler klonlama ile erbA süper ailesinin iki yeni üyesinin tanımlanması: ikisinin gen ürünleri birbiriyle oldukça ilişkilidir" . Nükleik Asitler Araştırma . 16 (23): 11057-74. doi : 10.1093/nar/16.23.11057 . PMC 338996 . PMID 2905047 .
Sawaya BE, Rohr O, Aunis D, Schaeffer E (Eylül 1996). "Tavuk ovalbümin yukarı akış promotör transkripsiyon faktörü, insan beyin hücrelerinde HIV-1 gen ekspresyonunun bir transkripsiyonel aktivatörü" . Biyolojik Kimya Dergisi . 271 (38): 23572–6. doi : 10.1074/jbc.271.38.23572 . PMID 8798567 .
Rohr O, Aunis D, Schaeffer E (Aralık 1997). "COUP-TF ve Sp1, insan mikroglial hücrelerinde insan immün yetmezlik virüsü tip 1 uzun terminal tekrarının transkripsiyonel aktivasyonunda etkileşime girer ve işbirliği yapar" . Biyolojik Kimya Dergisi . 272 (49): 31149-55. doi : 10.1074/jbc.272.49.31149 . PMID 9388268 .
Dressel U, Thormeyer D, Altıncıcek B, Paululat A, Eggert M, Schneider S, Tenbaum SP, Renkawitz R, Baniahmad A (Mayıs 1999). "Uzaylı, nükleer hormon reseptörü üst ailesinin üyeleri için bir koruyucunun özelliklerine sahip yüksek oranda korunmuş bir protein" . Moleküler ve Hücresel Biyoloji . 19 (5): 3383-94. doi : 10.1128/mcb.19.5.3383 . PMC 84131 . PMID 10207062 .
Klinge CM, Kaur K, Swanson HI (Ocak 2000). "Aril hidrokarbon reseptörü östrojen reseptörü alfa ve yetim reseptörler COUP-TFI ve ERRalpha1 ile etkileşime girer". Biyokimya ve Biyofizik Arşivleri . 373 (1): 163–74. doi : 10.1006/abbi.1999.1552 . PMID 10620335 .
Rohr O, Schwartz C, Hery C, Aunis D, Tardieu M, Schaeffer E (Ocak 2000). "Nükleer reseptör tavuk ovalbümin yukarı akış promotör transkripsiyon faktörü, HIV-1 Tat ile etkileşime girer ve insan mikroglial hücrelerinde viral replikasyonu uyarır" . Biyolojik Kimya Dergisi . 275 (4): 2654-60. doi : 10.1074/jbc.275.4.2654 . PMID 10644726 .
Sugiyama T, Wang JC, Scott DK, Granner DK (Şubat 2000). "Yetim nükleer reseptör tarafından transkripsiyon aktivasyonu, tavuk ovalbümin yukarı akış promotör-transkripsiyon faktörü I (COUP-TFI). Fosfoenolpiruvat karboksikinaz geninin glukokortikoid tepkisinde yer alan alanın tanımı" . Biyolojik Kimya Dergisi . 275 (5): 3446-54. doi : 10.1074/jbc.275.5.3446 . PMID 10652338 .
Vlahou A, Flytzanis CN (Şubat 2000). "Erken embriyonik hücre döngüsünde nükleer reseptör COUP-TF'nin hücre içi ticareti" . Gelişim Biyolojisi . 218 (2): 284–98. doi : 10.1006/dbio.1999.9456 . PMID 10656770 .
Avram D, Fields A, Pretty On Top K, Nevrivy DJ, Ishmael JE, Leid M (Nisan 2000). "Tavuk ovalbümin yukarı akış promotör transkripsiyon faktörü (COUP-TF) yetim nükleer reseptörlerinin aracılık ettiği transkripsiyonel baskıda rol oynayan yeni bir C(2)H(2) çinko parmak proteinleri ailesinin izolasyonu" . Biyolojik Kimya Dergisi . 275 (14): 10315–22. doi : 10.1074/jbc.275.14.10315 . PMC 2819356 . PMID 10744719 .
Gay F, Anglade I, Gong Z, Salbert G (Ekim 2000). "LIM/homeodomain protein adacık-1 östrojen reseptör fonksiyonlarını modüle eder" . Moleküler Endokrinoloji . 14 (10): 1627–48. doi : 10.1210/me.14.10.1627 . PMID 11043578 .
Siz M, Fischer M, Cho WK, Crabb D (Şubat 2002). "Hepatosit nükleer faktör 4 tarafından insan aldehit dehidrojenaz 2 promotörünün transkripsiyonel kontrolü: siklik AMP ve COUP transkripsiyon faktörleri ile inhibisyon". Biyokimya ve Biyofizik Arşivleri . 398 (1): 79-86. doi : 10.1006/abbi.2001.2713 . PMID 11811951 .
Lin F, Kolluri SK, Chen GQ, Zhang XK (Haziran 2002). "Yetim reseptör tavuk ovalbümin yukarı akış promotör-transkripsiyon faktörü tarafından AP-1 aktivitesinin retinoik asit kaynaklı inhibisyonunun düzenlenmesi" . Biyolojik Kimya Dergisi . 277 (24): 21414–22. doi : 10.1074/jbc.M201885200 . PMID 11934895 .
Métivier R, Gay FA, Hübner MR, Flouriot G, Salbert G, Gannon F, Kah O, Pakdel F (Tem 2002). "Bir hER alfa-COUP-TFI kompleksinin oluşumu, MAPK tarafından Ser118 fosforilasyonu yoluyla hER alfa AF-1'i geliştirir" . EMBO Dergisi . 21 (13): 3443-53. doi : 10.1093/emboj/cdf344 . PMC 126093 . PMID 12093745 .
Yu X, Mertz JE (Şubat 2003). "Nükleer reseptörler HNF4alpha ve COUP-TF1 tarafından hepatit B virüsünün transkripsiyonunun farklı düzenlenmesi modları" . Viroloji Dergisi . 77 (4): 2489–99. doi : 10.1128/JVI.77.4.2489-2499.2003 . PMC 141100 . PMID 12551987 .

Bu makale , kamu malı olan Amerika Birleşik Devletleri Ulusal Tıp Kütüphanesinden alınan metinleri içermektedir .

Languages

In other projects