NPM1 - NPM1

NPM1
Mevcut yapılar
PDB	Ortologtur arama: PDBe RCSB
PDB kimlik kodlarının listesi
	2LLH , 2P1B , 2VXD
tanımlayıcılar
takma adlar	NPM1 , B23, NPM, nükleofosmin (nükleolar fosfoprotein B23, numatrin), nükleofosmin, nükleofosmin 1
Harici kimlikler	OMIM : 164040 MGI : 106184 HomoloGene : 81697 GeneCards : NPM1
Gen konumu ( İnsan )
Chr.	Kromozom 5 (insan)
Son	171.411.810 baz puan
RNA ifade modeli
	Daha fazla referans ifade verisi
Gen ontolojisi
moleküler fonksiyon	• ribozomal büyük alt birim bağlanması ; • protein homodimerizasyon aktivitesi ; • ribozomal küçük alt birim bağlanması ; • katlanmamış protein bağlanması ; • GO:0001105 transkripsiyon koaktivatör aktivitesi ; • protein kinaz inhibitör aktivitesi ; • histon bağlanması ; • Tat protein bağlanması ; • NF-kappaB bağlanması ; • GO:0001948 protein bağlanması ; • RNA bağlanma ; • protein heterodimerizasyon aktivitesi ; • nükleik asit bağlanması ; • protein kinaz bağlanması ; • transkripsiyon faktörü bağlanması ; • rRNA bağlanması ; • protein N-ucu bağlanması ; • kromatin bağlanması;
Hücresel bileşen	• sitoplazma ; • zar ; • odak yapışması ; • iğ kutup sentrozomu ; • nükleoplazma ; • mikrotübül düzenleme merkezi ; • çekirdekçik ; • hücre iskeleti ; • çekirdek ; • protein-DNA kompleksi ; • granüler bileşen ; • sentrozom ; • sitozol ; • büyük ribozomal alt birim ; • küçük ribozomal alt birim ; • nükleer benek ; • protein içeren kompleks ; • ribonükleoprotein kompleksi;
biyolojik süreç	• sentrozom çevrim ; • dsRNA ile elF-2a alfa fosforilasyon düzenlenmesi ; • Hücre döngüsü G2 pozitif düzenleme / M faz geçiş ; • sentrozom kopyalanması negatif düzenlenmesi ; • sentriol replikasyon düzenleme ; • strese cevap verdiği ; • çeviri pozitif düzenleme ; • CENP-A tertibatı nükleozom içeren ; • transkripsiyonun pozitif regülasyonu, DNA- temelli ; • hücre yaşlanması ; • NF-kappaB transkripsiyon faktörü aktivitesinin pozitif regülasyonu ; • protein kompleksi oligomerizasyonu ; • protein fosforilasyonunun regülasyonu ile protein kinaz aktivitesinin negatif regülasyonu ; • endodeoksiribonükleaz aktivitesinin regülasyonu ; • endoribonükleaz aktivitesinin regülasyonu ; • ribozom montajı ; • hücre içi protein nakli ; • DNA onarımı ; • sinyal iletimi ; • hücre popülasyonu proliferasyonunun negatif düzenlenmesi ; • nükleozom montajı ; • GO:0022415 viral süreç ; • DNA hasar yanıtı, hücre döngüsü durmasıyla sonuçlanan p53 sınıfı aracı tarafından sinyal iletimi ; • RNA polimeraz II tarafından transkripsiyonun düzenlenmesi ; • UV'ye hücresel tepki ; • çekirdekten ribozomal büyük alt birim ihracatı ; • çekirdekten ribozomal küçük alt birim ihracatı ; • çekirdekten rRNA ihracatı ; • hücre hacmi homeostazı ; • nükleositoplazmik taşıma ; • protein lokalizasyonu ; • hücre popülasyon proliferasyonunun pozitif düzenlenmesi ; • gen ekspresyonunun transkripsiyon sonrası düzenlenmesi ; • negatif regülasyonu gen ekspresyonu ; • sentrozom kopyalanması düzenlenmesi ; • sentrozom kopyalanması olumlu düzenleme ; • hücre büyüme ; • hücresel biyosentetik işleminin pozitif düzenleme ; • protein ubikuitinasyomınun pozitif düzenleme ; • protein dengesi düzenlenmesinde ; • ribozomal büyük alt ünite biyogenez ; • ribozomal küçük alt birim biyogenez ; • apoptotik prosesin negatif düzenlenmesi ; • DNA hasarı tepkisinin düzenlenmesi p53 sınıfı aracı sinyal transdüksiyon ; • protein kinaz aktivitesinin pozitif düzenleme ; • RNA transkripsiyon pozitif düzenleme II Polimeraz ; • mRNA ekleme negatif düzenlenmesi yoluyla spliceosom ; • protein stabilizasyonu ; • prote homooligomerization içinde ; • Hücre döngüsünün düzenlenmesi ; • protein pozitif düzenleme lokalizasyonu için çekirdekçik ; • kromatin yeniden modelleme ; • UV hücresel yanıt olarak dahil, mRNA stabilite düzenlenmesi;
	Kaynaklar: Amigo / QuickGO
ortologlar
	4869
	18148
	ENSG000000181163
	ENSMUSG00000057113
	P06748
	Q61937
NM_001037738 ; NM_002520 ; NM_199185 ; NM_001355006 ; NM_001355009;
	NM_001355007 ; NM_001355010
	NM_001252260 ; NM_001252261 ; NM_008722
NP_001032827 ; NP_002511 ; NP_954654 ; NP_001341935 ; NP_001341938;
	NP_001341936 ; NP_001341939
	NP_001239189 ; NP_001239190 ; NP_032748
	Vikiveri
İnsan Görüntüle/Düzenle	Fareyi Görüntüle/Düzenle

Nükleofosmin olarak da bilinen (NPM), nükleolar fosfoprotein B23 veya numatrin , a, bir protein , insanlarda tarafından kodlandığını NPM1 geni .

İşlev

NPM1 ilişkili nükleolar ribonükleoprotein yapıları ve bağlar tek sarmallı ve çift sarmallı nükleik asitler, ancak tercihli olarak bağlanan G-dörtlüsü nükleik asitleri oluşturur. Ribozomların biyogenezinde yer alır ve küçük bazik proteinlerin nükleolusa taşınmasına yardımcı olabilir . SUMOylation yoluyla düzenlenmesi ( SENP3 ve SENP5 tarafından ), proteinin düzenlenmesi ve hücresel fonksiyonların başka bir yönüdür.

Bu bulunur çekirdekçik , ancak taþýnmalýdýr olabilir çekirdek plazması antikanser ilaçları ile, serum açlığından veya tedavi durumunda. Protein fosforile edilir .

Nükleofosmin'in birden fazla işlevi vardır:

Histon refakatçileri
Ribozom biyogenezi ve taşınması
Genomik stabilite ve DNA onarımı
endoribonükleaz aktivitesi
Hücre döngüsü sırasında sentrozom duplikasyonu
ARF-p53 tümör baskılayıcı yolunun düzenlenmesi
RNA sarmalının kararsızlaştırıcı aktivitesi
Kaspazla aktive olan DNaz'ın inhibisyonu
Çekirdekçikte bulunduğunda apoptozu önler

Klinik önemi

NPM1 geni, birçok tümör tipinde yukarı regüle edilir, mutasyona uğratılır ve kromozomal olarak yer değiştirir. Hodgkin olmayan lenfoma , akut promiyelositik lösemi , miyelodisplastik sendrom ve akut miyeloid lösemili hastalarda NPM1'i içeren kromozomal anormallikler bulundu . NPM1 için heterozigot fareler, tümör gelişimine karşı savunmasızdır. Katı tümörlerde NPM1 sıklıkla aşırı eksprese olarak bulunur ve NPM1'in tümör baskılayıcı p53/ARF yolunun inaktivasyonu yoluyla tümör büyümesini destekleyebileceği düşünülür; aksine, düşük seviyelerde ifade edildiğinde, NPM1, sentrozom duplikasyonunun inhibisyonu yoluyla tümör büyümesini baskılayabilir.

Hastaların sitoplazmasında katlanmış bir C-terminal alanı (NPM1c+) içermeyen mutasyona uğramış bir proteinin bulunduğu akut miyeloid lösemide NPM tutulumu büyük önem taşımaktadır . Bu anormal lokalizasyon, hastalığın gelişimi ile bağlantılıdır ve iyileştirilmiş klinik sonuçlarla ilişkilidir. Akut miyelojenöz löseminin bu alt tipine karşı stratejiler, farmakolojik şaperonlar kullanılarak C-terminal alanının yeniden katlanmasını ve apoptotik mekanizmalarla bağlantılı olan proteinin nükleolustan nükleoplazmaya yer değiştirmesini içerir. Ayrıca, bir DNMT3A mutasyonunu barındıran belirsiz öneme sahip klonal hematopoez bağlamında, müteakip NPM1 mutasyonlarının, ilerlemeyi açık miyeloproliferatif neoplazmaya yönlendirdiği de gösterilmiştir.

Etkileşimler

NPM1 gösterilmiştir etkileşim ile

Nucleophosmin'in birden fazla bağlayıcı ortağı vardır:

rRNA
HIV Rev ve Rex peptidi
p53 tümör baskılayıcı
ARF tümör baskılayıcı
MDM2 (fare çift dakika 2, ubiquitin ligaz)
Ribozom proteini S9
Fosfatidilinositol 3,4,5-trifosfat (PIP3)
Exportin-1 (CRM1, kromozom bölgesi bakımı)
nükleolin/C23
myc onkogenin transkripsiyon hedefi

Referanslar

daha fazla okuma

Yun C, Wang Y, Mukhopadhyay D, Backlund P, Kolli N, Yergey A, Wilkinson KD, Dasso M (Kasım 2008). "Nükleolar protein B23/nükleofosmin, omurgalı SUMO yolunu SENP3 ve SENP5 proteazları aracılığıyla düzenler" . Hücre Biyolojisi Dergisi . 183 (4): 589-95. doi : 10.1083/jcb.200807185 . PMC 2582899 . PMID 19015314 .
Haindl M, Harasim T, Eick D, Muller S (Mart 2008). "Nükleolar SUMO'ya özgü proteaz SENP3, nükleofosminin SUMO modifikasyonunu tersine çevirir ve rRNA işlemesi için gereklidir" . EMBO Raporları . 9 (3): 273–9. doi : 10.1038/embor.2008.3 . PMC 2267381 . PMID 18259216 .
Li L, Li HS, Pauza CD, Bukrinsky M, Zhao RY (2006). "Viral patogenezde HIV-1 yardımcı proteinlerinin rolleri ve konakçı-patojen etkileşimleri" . Hücre Araştırması . 15 (11–12): 923–34. doi : 10.1038/sj.cr.7290370 . PMID 16354571 . S2CID 24253878 .
Gjerset RA (Eylül 2006). "DNA hasarı, p14ARF, nükleofosmin (NPM/B23) ve kanser". Moleküler Histoloji Dergisi . 37 (5–7): 239–51. doi : 10.1007/s10735-006-9040-y . PMID 16855788 . S2CID 24017618 .
Chen W, Rassidakis GZ, Medeiros LJ (Kasım 2006). "Akut miyeloid lösemide nükleofosmin gen mutasyonları". Patoloji ve Laboratuvar Tıbbı Arşivleri . 130 (11): 1687–92. doi : 10.5858/2006-130-1687-NGMIAM . PMID 17076533 .
Falini B, Nicoletti I, Bolli N, Martelli MP, Liso A, Gorello P, Mandelli F, Mecucci C, Martelli MF (Nisan 2007). "Lenfomalarda ve lösemilerde nükleofosmin (NPM1) genini içeren translokasyonlar ve mutasyonlar" (PDF) . hematolojik . 92 (4): 519–32. doi : 10.3324/hematol.11007 . hdl : 2434/424144 . PMID 17488663 .
Fankhauser C, Izaurralde E, Adachi Y, Wingfield P, Laemmli Birleşik Krallık (Mayıs 1991). "İnsan immün yetmezlik virüsü tip 1 rev ve nükleolar B23 proteinlerinin spesifik kompleksi: Rev yanıt elemanı ile ayrışma" . Moleküler ve Hücresel Biyoloji . 11 (5): 2567–75. doi : 10.1128/MCB.11.5.2567 . PMC 360026 . PMID 2017166 .
Venkatesh LK, Muhammed S, Chinnadurai G (Mayıs 1990). "Trans-regülasyon ve hücre altı lokalizasyon için gerekli HIV-1 rev geninin fonksiyonel alanları". Viroloji . 176 (1): 39-47. doi : 10.1016/0042-6822(90)90228-J . PMID 2109912 .
Cochrane AW, Perkins A, Rosen CA (Şubat 1990). "İnsan immün yetmezlik virüsü Rev'in nükleolar lokalizasyonunda önemli olan dizilerin tanımlanması: nükleolar lokalizasyonun fonksiyonla ilgisi" . Viroloji Dergisi . 64 (2): 881–5. doi : 10.1128/JVI.64.2.881-885.1990 . PMC 249184 . PMID 2404140 .
Chan PK, Chan WY, Yung BY, Cook RG, Aldrich MB, Ku D, Goldknopf IL, Busch H (Ekim 1986). "Protein B23'ün spesifik bir antijenik peptidinin amino asit dizisi" . Biyolojik Kimya Dergisi . 261 (30): 14335–41. doi : 10.1016/S0021-9258(18)67023-1 . PMID 2429957 .
Zhang XX, Thomis DC, Samuel CE (Ekim 1989). "İzolasyonu ve bir insan mRNA'sının moleküler cDNA klonunun karakterizasyonu, nükleolar protein B23, numatrin kodlayan interferonla muamele edilmiş hücrelerden". Biyokimyasal ve Biyofiziksel Araştırma İletişimi . 164 (1): 176-84. doi : 10.1016/0006-291X(89)91699-9 . PMID 2478125 .
Hale TK, Mansfield BC (Aralık 1989). "İnsan proteini B23'ün üçüncü bir alelini temsil eden bir cDNA klonunun nükleotid dizisi" . Nükleik Asitler Araştırma . 17 (23): 10112. PMC 335249 . PMID 2602120 .
Chan WY, Liu QR, Borjigin J, Busch H, Rennert OM, Tease LA, Chan PK (Şubat 1989). "İnsan nükleofosmini kodlayan cDNA'nın karakterizasyonu ve normal ve anormal büyümedeki rolünün çalışmaları". Biyokimya . 28 (3): 1033–9. doi : 10.1021/bi00429a017 . PMID 2713355 .
Li XZ, McNeilage LJ, Whittingham S (Ağustos 1989). "Yüksek düzeyde korunmuş nükleolar fosfoprotein B23'ü kodlayan bir insan cDNA'sının nükleotid dizisi". Biyokimyasal ve Biyofiziksel Araştırma İletişimi . 163 (1): 72–8. doi : 10.1016/0006-291X(89)92100-1 . PMID 2775293 .
Chan PK, Aldrich M, Cook RG, Busch H (Şubat 1986). "Protein B23 fosforilasyon bölgesinin amino asit dizisi" . Biyolojik Kimya Dergisi . 261 (4): 1868–72. doi : 10.1016/S0021-9258(18)67023-1 . PMID 3944116 .
Bocker T, Bittinger A, Wieland W, Buettner R, Fauser G, Hofstaedter F, Rüschoff J (Nisan 1995). "Prostatın iyi huylu ve kötü huylu epitel lezyonlarında nükleolar proteinler B23 ve p120'nin in vitro ve ex vivo ekspresyonu". Modern Patoloji . 8 (3): 226–31. PMID 7542384 .
Dundr M, Leno GH, Hammarskjöld ML, Rekosh D, Helga-Maria C, Olson MO (Ağustos 1995). "HIV-1 Rev proteininin hücre altı konumunda nükleolar yapı ve fonksiyonun rolleri". Hücre Bilimi Dergisi . 108 ( Bölüm 8) (8): 2811–23. doi : 10.1242/jcs.108.8.2811 . PMID 7593322 .
Miyazaki Y, Takamatsu T, Nosaka T, Fujita S, Martin TE, Hatanaka M (Temmuz 1995). "İnsan immün yetmezlik virüsü tip 1 Rev'in sitotoksisitesi: nükleolar protein B23 ile etkileşimi için çıkarımlar". Deneysel Hücre Araştırması . 219 (1): 93–101. doi : 10.1006/excr.1995.1209 . PMID 7628555 .
Szebeni A, Herrera JE, Olson MO (Haziran 1995). "Nükleolar protein B23'ün nükleer lokalizasyon sinyalleriyle ilgili peptitlerle etkileşimi". Biyokimya . 34 (25): 8037-42. doi : 10.1021/bi00025a009 . PMID 7794916 .
Kato S, Sekine S, Oh SW, Kim NS, Umezawa Y, Abe N, Yokoyama-Kobayashi M, Aoki T (Aralık 1994). "Bir insan tam uzunlukta cDNA bankasının yapımı". gen . 150 (2): 243–50. doi : 10.1016/0378-1119(94)90433-2 . PMID 7821789 .
Marasco WA, Szilvay AM, Kalland KH, Helland DG, Reyes HM, Walter RJ (1995). "Stabil bir şekilde transfekte Jurkat T-hücrelerinde HIV-1 tat proteini ve nükleolar taşıma proteini B23'ün uzamsal ilişkisi". Viroloji Arşivleri . 139 (1–2): 133–54. doi : 10.1007/BF01309460 . PMID 7826206 . S2CID 24710329 .
Valdez BC, Perlaky L, Henning D, Saijo Y, Chan PK, Busch H (Eylül 1994). "Protein p120'nin nükleer ve nükleolar lokalizasyon sinyallerinin tanımlanması. Translokasyon proteini B23 ile etkileşim" . Biyolojik Kimya Dergisi . 269 (38): 23776-83. doi : 10.1016/S0021-9258(17)31583-1 . PMID 8089149 .

Languages

In other projects