NACHT alanı - NACHT domain

NACHT alanı bir evrimsel korunmuş olan protein alanı . Bu NTPaz alanı bulunan apoptoz proteinleri hem de yer alanların MHC transkripsiyon . Adından da içeren proteinlerin bir kısmını geri yansıtarak: NAIP (NLP aile apoptoz inhibitörü proteini), CIITA (C2TA veya yani MHC sınıf II transkripsiyon aktivatörü), Het-E (dan uyumsuzluk lokusu proteini Podospora anserina ) ve TEP1 (yani , TP1 ve telomeraz ile ilişkili protein).

NACHT alanı 300 ila 400 içerir amino asitleri . Bu tahmin edilmiş nükleozid trifosfat bulunan (NTPaz) etki alanı, hayvan , mantar ve bakteri protein. Bu gibi başka etki ile ilişkili olarak bulunan KART alan ( InterPro : IPR001315 ), pirin alan ( InterPro : IPR004020 ), ISI tekrar alan ( InterPro : IPR004155 ), WD40 tekrar ( InterPro : IPR001680 ), lösin bakımından zengin tekrar (LRR) ya da BİR tekrar ( InterPro : IPR001370 ).

NACHT alan ATP / GTPaz spesifik P-döngü olmak üzere yedi farklı korunmuş motiflerin oluşur, Mg ^{+ 2} bağlama sahası ( Walker A ve B motifleri sırasıyla) ve beş daha özel motifleri. NACHT alan eşsiz özellikleri 'küçük' tortuları (glisin, alanin ya da serin) Mg ile doğrudan C-terminali sıklığını içerir ²⁺ diğer yaygın ikinci asidik artığı yerine Walker Yatak motifinde aspartat -coordinating, NTPases. İkinci bir asidik kalıntı, tipik olarak iki pozisyonları, aşağı doğru NACHT içeren proteinler bulunur. Ayrıca, distal motifi VII başka NTPaz ailesinde görülmez, kutupsal aromatik ve hidrofobik kalıntıların bir korunmuş deseni içerir.

Örnekler

Bu sahayı içeren insan proteinleri şunları içerir:

• CIITA
• NAIP
• NLRC3 , NLRC4 , NLRC5
• NLRP1 , NLRP2 , NLRP3 , NLRP4 , NLRP5 , NLRP6 , NLRP7 , NLRP8 , NLRP9 , NLRP10 , NLRP11 , NLRP12 , NLRP13 , NLRP14 , NLRX1
• NOD1 , NOD2
• NWD1
• TEP1

Referanslar

Bu protein, lı makale bir taslaktır . Sen Vikipedi'ye katkıda bulunabilirsiniz genişletmeden . v t e