Faktör IX - Factor IX

F9
Mevcut yapılar
PDB	Ortologtur arama: PDBe RCSB
PDB kimlik kodlarının listesi
	1CFH , 1CFI , 1EDM , 1IXA , 1MGX , 1NL0 , 1RFN , 2WPH , 2WPI , 2WPJ , 2WPK , 2WPL , 2WPM , 3KCG , 3LC3 , 3LC5 , 4YZU , 4Z0K , 4ZAE , 4WM0 , 4WMA , 4WMI , 4WMK , 4WN2 , 4WNH , 5EGM , 5JBC , 5JB9 , 5JBB , 5JB8 , 5JBA
tanımlayıcılar
takma adlar	F9 , F9 p22, FIX, HEMB, P19, PTC, THPH8, pıhtılaşma faktörü IX, Kan pıhtılaşma faktörü IX, Noel Faktörü
Harici kimlikler	OMIM : 300746 MGI : 88384 HomoloGene : 106 GeneCards : F9
Gen konumu ( İnsan )
Chr.	X kromozomu (insan)
Son	139.563.459 baz puan
Gen konumu ( Fare )
Chr.	X kromozomu (fare)
Son	60.030.759 baz puan
RNA ifade modeli
	Daha fazla referans ifade verisi
Gen ontolojisi
moleküler fonksiyon	• endopeptidaz aktivitesi ; • metal iyonu bağlanması ; • peptidaz aktivitesi ; • serin tipi peptidaz aktivitesi ; • hidrolaz aktivitesi ; • kalsiyum iyonu bağlanması ; • serin tipi endopeptidaz aktivitesi ; • GO:0001948 protein bağlanması;
Hücresel bileşen	• endoplazmik retikulum lümeni ; • plazma zarı ; • Golgi lümeni ; • hücre dışı eksozom ; • hücre dışı bölge ; • hücre dışı boşluk ; • kollajen içeren hücre dışı matris;
biyolojik süreç	• hemostaz ; • kan pıhtılaşması, intrinsik yol ; • zimojen aktivasyonu ; • Golgi vezikül aracılı taşımaya endoplazmik retikulum ; • sinyal peptit işlemesi ; • kan pıhtılaşması, dış yol ; • peptidil-glutamik asit karboksilasyonu ; • proteoliz ; • kan pıhtılaşması;
	Kaynaklar: Amigo / QuickGO
ortologlar
	2158
	14071
	ENSG00000101981
	ENSMUSG00000031138
	P00740
	P16294
	NM_000133 ; NM_001313913
	NM_007979 ; NM_001305797
	NP_000124 ; NP_001300842
	NP_001292726 ; NP_032005
	Vikiveri
İnsan Görüntüle/Düzenle	Fareyi Görüntüle/Düzenle

Faktör IX (veya Noel faktörü ) ( EC 3.4.21.22 ) pıhtılaşma sisteminin serin proteazlarından biridir ; peptidaz ailesi S1'e aittir. Bu proteinin eksikliği hemofili B'ye neden olur . 1952'de Stephen Christmas adlı genç bir çocuğun hemofiliye yol açan bu faktörden yoksun olduğunun bulunmasıyla keşfedildi .

Pıhtılaşma faktörü IX, Dünya Sağlık Örgütü'nün Temel İlaçlar Listesi'nde yer almaktadır .

fizyoloji

Kan pıhtılaşması ve Protein C yolu.

Faktör IX, aktif olmayan bir öncü olan bir zimojen olarak üretilir . Sinyal peptidini çıkarmak için işlenir , glikosile edilir ve daha sonra faktör XIa (temas yolunun) veya faktör VIIa (doku faktörü yolunun) tarafından parçalanarak zincirlerin bir disülfid köprüsü ile bağlandığı iki zincirli bir form üretilir . Ca2 ⁺ , membran fosfolipidleri ve bir Faktör VIII kofaktörünün varlığında faktör IXa'ya aktive edildiğinde, faktör Xa'yı oluşturmak için faktör X'teki bir arginin - izolösin bağını hidrolize eder .

Faktör IX, antitrombin tarafından inhibe edilir .

Faktör IX ifadesi, insanlarda ve farelerde yaşla birlikte artar. Fare modellerinde faktör IX'un promotör bölgesindeki mutasyonlar, yaşa bağlı bir fenotipe sahiptir.

Etki alanı mimarisi

Faktör VII , IX ve X'in tümü kan pıhtılaşmasında kilit rol oynar ve aynı zamanda ortak bir alan mimarisini paylaşır. Faktör IX proteini dört protein alanından oluşur : Gla alanı , EGF alanının iki ardışık kopyası ve katalitik bölünmeyi gerçekleştiren bir C-terminal tripsin benzeri peptidaz alanı.

Her protein alanının renkli bir kutu ile temsil edildiği insan faktörü IX protein alanı mimarisi

N-terminal EGF domeninin en azından kısmen doku faktörünün bağlanmasından sorumlu olduğu gösterilmiştir . Wilkinson ve ark . ikinci EGF alanının 88 ila 109 kalıntılarının trombositlere bağlanmaya ve faktör X aktive edici kompleksin birleştirilmesine aracılık ettiği sonucuna varır.

Dört alanın da yapıları çözüldü. Domuz proteini için iki EGF alanının ve tripsin benzeri alanın bir yapısı belirlendi. Ca(II)-bağımlı fosfolipid bağlanmasından sorumlu olan Gla domeninin yapısı da NMR ile belirlendi .

Pıhtılaşma kaskadında diğer proteinler tarafından faktör IX aktivasyonunun doğasını ortaya çıkaran birkaç 'süper aktif' mutant yapısı çözülmüştür.

Genetik

İnsanda F9 geni, X kromozomu üzerinde q27.1 konumunda bulunur.

Gen faktörü IX için yer almaktadır X kromozomu (Xq27.1-q27.2) ve bu nedenle X'e bağlı : bu gendeki mutasyonlar erkek çok daha sık daha dişileri etkiler. İlk olarak 1982 yılında Kotoku Kurachi ve Earl Davie tarafından klonlanmıştır .

Faktör IX için gen taşıyan transgenik klonlanmış bir Poll Dorset koyunu olan Polly , 1997 yılında Roslin Enstitüsünde Dr Ian Wilmut tarafından üretildi .

Hastalıktaki rolü

Faktör IX eksikliği Noel hastalığına ( hemofili B ) neden olur . 461 kalıntının %73'ünü etkileyen 3000'den fazla faktör IX varyantı tanımlanmıştır; bazıları hiçbir belirtiye neden olmaz, ancak çoğu önemli bir kanama bozukluğuna yol açar. Orijinal Noel hastalığı mutasyonu, Noel'in DNA'sının dizilenmesiyle tanımlandı ve bir sisteini serine dönüştüren bir mutasyonu ortaya çıkardı. Rekombinant faktör IX, Noel hastalığını tedavi etmek için kullanılır. Formülasyonlar şunları içerir:

nonacog alfa (marka adı BeneFix)
albutrepenonacog alfa (marka adı Idelvion)
eftrenonacog alfa (Alprolix markası)
nonacog beta pegol (marka adı Refixia)

Faktör IX'un bazı nadir mutasyonları, pıhtılaşma aktivitesinin artmasıyla sonuçlanır ve derin ven trombozu gibi pıhtılaşma hastalıklarına neden olabilir . Bu fonksiyon mutasyonu kazancı , proteini hiperfonksiyonel hale getirir ve ailesel erken başlangıçlı trombofili ile ilişkilidir.

Faktör IX eksikliği, çeşitli hayvan veya hayvan hücresi vektörlerinde klonlama yoluyla üretilen saflaştırılmış faktör IX'un enjeksiyonu ile tedavi edilir. Traneksamik asit , perioperatif kanama riskini azaltmak için kalıtsal faktör IX eksikliği olan ameliyat geçiren hastalarda değerli olabilir.

Faktör IX'daki tüm mutasyonların bir listesi EAHAD tarafından derlenir ve korunur.

Pıhtılaşma faktörü IX, Dünya Sağlık Örgütü'nün Temel İlaçlar Listesi'nde yer almaktadır .

Referanslar

daha fazla okuma

Davie EW, Fujikawa K (1975). "Kan pıhtılaşmasında temel mekanizmalar". Biyokimyanın Yıllık İncelemesi . 44 : 799-829. doi : 10.1146/annurev.bi.44.070175.004055 . PMID 237463 .
Sommer SS (Temmuz 1992). "İnsan germ hattı mutasyonlarının altında yatan modelin değerlendirilmesi: faktör IX geninden alınan dersler". FASEB Dergisi . 6 (10): 2767-74. doi : 10.1096/fasebj.6.10.1634040 . PMID 1634040 . S2CID 15211597 .
Lenting PJ, van Mourik JA, Mertens K (Aralık 1998). "Yapısı ve işlevi açısından pıhtılaşma faktörü VIII'in yaşam döngüsü". Kan . 92 (11): 3983-96. doi : 10.1182/kan.V92.11.3983 . PMID 9834200 .
Lowe GD (Aralık 2001). "Faktör IX ve tromboz" (PDF) . İngiliz Hematoloji Dergisi . 115 (3): 507–13. doi : 10.1046/j.1365-2141.2001.03186.x . PMID 11736930 . S2CID 44650866 .
O'Connell NM (Haziran 2003). "Faktör XI eksikliği - moleküler genetikten klinik yönetime". Kan Pıhtılaşması ve Fibrinoliz . 14 Ek 1: S59-64. doi : 10.1097/00001721-200306001-00014 . PMID 14567539 .
Du X (Mayıs 2007). "Trombosit glikoprotein Ib-IX-V kompleksinin sinyalizasyonu ve düzenlenmesi". Hematolojide Güncel Görüş . 14 (3): 262–9. doi : 10.1097/MOH.0b013e3280dce51a . PMID 17414217 . S2CID 39904506 .

Dış bağlantılar

"Pıhtılaşma Faktörü IX (Rekombinant), Fc Füzyon Proteini" . İlaç Bilgi Portalı . ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.
"Eftrenonacog alfa" . İlaç Bilgi Portalı . ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.
"Nonacog alfa" . İlaç Bilgi Portalı . ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.
"Albutrepenonacog alfa" . İlaç Bilgi Portalı . ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.
"Nonacog beta pegol" . İlaç Bilgi Portalı . ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi.
Uygun yapısal bilginin her genel PDB için Uniprot : P00740 (Pıhtılaşma faktörü IX) 'de PDBe-KB .
Hemofili B ile ilgili GeneReviews/NCBI/NIH/UW girişi
Merops peptidazlar ve bunların inhibitörleri için çevrimiçi veritabanı: S01.214

Languages

In other projects