ABO (gen) - ABO (gene)
Histo-kan grubu ABO sistem transferaz , insanlarda ABO geni tarafından kodlanan, glikoziltransferaz aktivitesine sahip bir enzimdir . Birçok doku ve hücre tipinde her yerde eksprese edilir. ABO , hücre yüzeyi glikoproteinleri üzerindeki oligosakkaritleri modifiye ederek bir bireyin ABO kan grubunu belirler . Bireyler arasındaki protein dizisindeki varyasyonlar, modifikasyon tipini ve kan grubunu belirler. ABO geni aynı zamanda 27 birini içerdiği SNP riski ile ilişkili koroner arter hastalığı .
Yapı
ABO gen bant 9q34.2 kromozom 9 üzerinde bulunan ve 7 içerir eksonlar . ABO lokusu üç kodlayan aleller . A alelinin üreten α-1,3-N-asetilgalaktozamin GalNAc transferini katalize transferaz (A-transferaz), kalıntıları alıcı Gal kalıntılarına UDP-GalNAc verici nükleotitlerin H antijeni içine H antijeni dönüştürülmesi, A A ve AB bireylerinde antijen . B aleli, UDP- Gal donör nükleotitinden Gal kalıntılarının alıcı H antijeninin Gal kalıntılarına transferini katalize eden ve H antijenini B antijenine dönüştüren α-1,3-galaktosil transferazı (B-transferaz) kodlar . B ve AB bireyleri. Dikkat çekici bir şekilde, A ve B glikoziltransferaz enzimleri arasındaki fark sadece dört amino asittir . O aleli , proteinin N-terminaline yakın bir bölgeye karşılık gelen gende guanin-258'in silinmesinin neden olduğu çerçeve kayması nedeniyle her iki enzimatik aktiviteden yoksundur . Bu, neredeyse tamamen farklı bir proteinin çerçeve kayması ve translasyonu ile sonuçlanır. Bu mutasyon , galaktoza bağlı fukoz ile biten oligosakkaritleri değiştiremeyen bir protein ile sonuçlanır . Böylece O bireylerinde A veya B antijeni bulunmaz. Bu şeker kombinasyonuna H antijeni denir . Bu antijenler, kan transfüzyonu ve organ nakli eşleşmesinde önemli bir rol oynamaktadır . Bu gen için başka küçük aleller bulunmuştur.
Ortak aleller
Avrupa kökenli bireylerde altı ortak alel vardır. Neredeyse her canlı insanın ABO geni için fenotipi , sadece bu altı alelin bir kombinasyonudur:
- A
- A101 (A1)
- A201 (A2)
- B
- B101 (B1)
- Ö
- O01 (O1)
- O02 (O1v)
- O03 (O2)
Bu alellerin pek çok nadir varyantı, dünyadaki insan popülasyonlarında bulunmuştur.
Klinik önemi
İnsan hücrelerinde, ABO allelleri ve bunların kodlanmış glikosiltransferazları, çeşitli onkolojik koşullarda tarif edilmiştir. Anti-GTA/GTB monoklonal antikorları kullanılarak, bu enzimlerin kaybının malign mesane ve oral epitel ile ilişkili olduğu gösterildi. Ayrıca, normal insan dokularında ABO kan grubu antijenlerinin ekspresyonu, epitelin farklılaşma tipine bağlıdır. Oral karsinom dahil çoğu insan karsinomunda, altta yatan mekanizmanın bir parçası olarak önemli bir olay, A ve B antijenlerinin ekspresyonunun azalmasıdır. Çeşitli çalışmalar, tümör gelişimi ile ilişkili olarak oral karsinomlarda GTA ve GTB'nin göreceli olarak aşağı regülasyonunun meydana geldiğini gözlemlemiştir. Daha yakın zamanlarda, bir genom çapında ilişki çalışması (GWAS), ABO lokusunda pankreas kanserine duyarlılıkla ilişkili varyantları tanımlamıştır .
Klinik belirteç
ABO geni de dahil olmak üzere 27 lokusun bir kombinasyonuna dayanan çok lokuslu bir genetik risk skoru çalışması , hem vaka hem de tekrarlayan koroner arter hastalığı olayları için yüksek risk altında olan bireyleri ve ayrıca statin tedavisinden artan klinik faydayı tanımladı. Çalışma, bir topluluk kohort çalışmasına (Malmo Diyet ve Kanser çalışması) ve birincil önleme kohortları (JUPITER ve ASCOT) ve ikincil önleme kohortlarına (CARE ve PROVE IT-TIMI 22) ilişkin dört ek randomize kontrollü çalışmaya dayanmaktadır.
Referanslar
daha fazla okuma
- Nagai M, Davè V, Kaplan BE, Yoshida A (Ocak 1978). "İnsan kan grubu glikosiltransferazları. I. n-asetilgalaktozaminiltransferazın saflaştırılması" . Biyolojik Kimya Dergisi . 253 (2): 377–9. doi : 10.1016/S0021-9258(17)38216-9 . PMID 618875 .
- Takeya A, Hosomi O, Shimoda N, Yazawa S (Eylül 1992). "Kan grubu P antijen benzeri GalNAc beta 1-->3Gal beta 1-->4GlcNAc/Glc yapısının biyosentezi: insan kan plazmasında yeni bir N-asetilgalaktozaminiltransferaz". Biyokimya Dergisi . 112 (3): 389-95. doi : 10.1093/oxfordjournals.jbchem.a123910 . PMID 1429528 .
- Kominato Y, McNeill PD, Yamamoto M, Russell M, Hakomori S, Yamamoto F (Kasım 1992). "Hayvan histo-kan grubu ABO genleri". Biyokimyasal ve Biyofiziksel Araştırma İletişimi . 189 (1): 154-64. doi : 10.1016/0006-291X(92)91538-2 . PMID 1449469 .
- Yamamoto F, McNeill PD, Hakomori S (Ağustos 1992). "A alt tiplerinden biri olan A2 aleli tarafından kodlanan insan histo-kan grubu A2 transferaz, kodlama dizisinde tek bir baz silinmesi ile karakterize edilir, bu da karboksil terminalinde ek bir alan ile sonuçlanır". Biyokimyasal ve Biyofiziksel Araştırma İletişimi . 187 (1): 366-74. doi : 10.1016/S0006-291X(05)81502-5 . PMID 1520322 .
- Clausen H, White T, Takio K, Titani K, Stroud M, Holmes E, Karkov J, Thim L, Hakomori S (Ocak 1990). "İnsan akciğer dokusundan bir histo-kan grubu A tanımlı Fuc alfa 1----2Gal alfa 1----3-N-asetilgalaktozaminiltransferazın homojenliğine izolasyon ve kısmi karakterizasyonu" . Biyolojik Kimya Dergisi . 265 (2): 1139–45. doi : 10.1016/S0021-9258(19)40169-5 . PMID 2104827 .
- Yamamoto F, Marken J, Tsuji T, White T, Clausen H, Hakomori S (Ocak 1990). "İnsan UDP-GalNAc için tamamlayıcı DNA'nın klonlanması ve karakterizasyonu: Fuc alfa 1----2Gal alfa 1----3GalNAc transferaz (histo-kan grubu A transferaz) mRNA" . Biyolojik Kimya Dergisi . 265 (2): 1146–51. doi : 10.1016/S0021-9258(19)40170-1 . PMID 2104828 .
- Yamamoto F, Hakomori S (Kasım 1990). "Histo-kan grubu A ve B transferazlarının şeker-nükleotid donör özgüllüğü, amino asit ikamelerine dayanmaktadır" . Biyolojik Kimya Dergisi . 265 (31): 19257-62. doi : 10.1016/S0021-9258(17)30652-X . PMID 2121736 .
- Whitehead JS, Bella S, Kim YS (Haziran 1974). "İnsan kan grubu A plazmasından bir N-asetilgalaktozaminiltransferaz. II. Kinetik ve fizikokimyasal özellikler" . Biyolojik Kimya Dergisi . 249 (11): 3448-52. doi : 10.1016/S0021-9258(19)42593-3 . PMID 4831223 .
- Whitehead JS, Bella A, Kim YS (Haziran 1974). "İnsan kan grubu A plazmasından bir N-asetilgalaktozaminiltransferaz. I. Saflaştırma ve agaroz bağlama özellikleri" . Biyolojik Kimya Dergisi . 249 (11): 442–7. doi : 10.1016/S0021-9258(19)42592-1 . PMID 4831233 .
- Kobata A, Ginsburg V (Mart 1970). "Üridin difosfat-N-asetil-D-galaktozamin: D-galaktoz alfa-3-N-asetil-D-galaktozaminiltransferaz, insanda A kan grubunu belirleyen genin bir ürünü" . Biyolojik Kimya Dergisi . 245 (6): 1484–90. doi : 10.1016/S0021-9258(18)63261-2 . PMID 5442829 .
- Yoshida A, Yamaguchi H, Okubo Y (Mayıs 1980). "cis-AB kalıtımının genetik mekanizması. I. Eşit olmayan kromozomal geçişle ilişkili bir vaka" . Amerikan İnsan Genetiği Dergisi . 32 (3): 332–8. PMC 1686052 . PMID 6770676 .
- Olsson ML, Thuresson B, Chester MA (Kasım 1995). "Kan grubu ABO lokusunda bir Ael aleline özgü nükleotid eklenmesi ve diziye özgü bir polimeraz zincir reaksiyonu kullanılarak saptanması". Biyokimyasal ve Biyofiziksel Araştırma İletişimi . 216 (2): 642–7. doi : 10.1006/bbrc.1995.2670 . PMID 7488159 .
- Bennett EP, Steffensen R, Clausen H, Weghuis DO, van Kessel AG (Ocak 1995). "İnsan histo-kan grubu ABO lokusunun genomik klonlanması". Biyokimyasal ve Biyofiziksel Araştırma İletişimi . 206 (1): 318–25. doi : 10.1006/bbrc.1995.1044 . hdl : 2066/22100 . PMID 7598760 .
- Yamamoto F, McNeill PD, Hakomori S (Şubat 1995). "İnsan histo-kan grubu ABO genlerinin genomik organizasyonu". Glikobiyoloji . 5 (1): 51–8. doi : 10.1093/glikob/5.1.51 . PMID 7772867 .
- Bennett EP, Steffensen R, Clausen H, Weghuis DO, Geurts van Kessel A (Haziran 1995). "İnsan histo-kan grubu ABO lokusunun genomik klonlanması". Biyokimyasal ve Biyofiziksel Araştırma İletişimi . 211 (1): 347. doi : 10.1006/bbrc.1995.1817 . hdl : 2066/22100 . PMID 7779106 .
- Yamamoto F, McNeill PD, Kominato Y, Yamamoto M, Hakomori S, Ishimoto S, Nishida S, Shima M, Fujimura Y (1993). "ABO kan grubu sisteminin moleküler genetik analizi: 2. cis-AB alelleri". Vox Sanguinis . 64 (2): 120–3. doi : 10.1111/j.1423-0410.1993.tb02529.x . PMID 8456556 . S2CID 23119465 .
- Yamamoto F, McNeill PD, Yamamoto M, Hakomori S, Harris T (1993). "ABO kan grubu sisteminin moleküler genetik analizi: 3. A(X) ve B(A) alelleri". Vox Sanguinis . 64 (3): 171–4. doi : 10.1111/j.1423-0410.1993.tb05157.x . hdl : 2027.42/71979 . PMID 8484250 . S2CID 43662514 .
- Ogasawara K, Yabe R, Uchikawa M, Saitou N, Bannai M, Nakata K, Takenaka M, Fujisawa K, Ishikawa Y, Juji T, Tokunaga K (Ekim 1996). "ABO kan grubu sisteminin varyant fenotiplerinin moleküler genetik analizi" . Kan . 88 (7): 2732–7. doi : 10.1182/blood.V88.7.2732.bloodjournal8872732 . PMID 8839869 .
Ayrıca bakınız
Dış bağlantılar
- UCSC Genom Tarayıcısında insan ABO genom konumu ve ABO gen ayrıntıları sayfası .
- Uygun yapısal bilginin her genel PDB için Uniprot : P16442 de (Histo-kan grubu ABO sistemi transferaz) PDBe-KB .
Bu makale , kamu malı olan Amerika Birleşik Devletleri Ulusal Tıp Kütüphanesinden alınan metinleri içermektedir .