Viridans streptokoklar - Viridans streptococci

Viridans streptococci
bilimsel sınıflandırma
Krallık:	Bakteriler
Şube:	Firmicutes
Sınıf:	Cocci
Sipariş:	Lactobacillales
Aile:	Streptococcaceae
Cins:	Streptokok

Streptokok viridans büyük bir grup olan ortakçı streptokok , Gram-pozitif bakteriler olan türler α-hemolitik kan yeşil bir renklendirme oluşturabilen, agar plakaları (yeşil "viridis" Latin bu nedenle adı "viridans"). Sözde taksonomik terim "Streptococcus viridans" genellikle bu türler grubuna atıfta bulunmak için kullanılır, ancak (bir grup türü tek bir türmiş gibi ele alan) psödotaksonomik terimi kullanmayı sevmeyen yazarlar viridans streptococci terimlerini tercih eder. , viridans grubu streptococci ( VGS ) veya viridans streptococcal türleri .

Bu türlerde Lancefield antijenleri yoktur . Genel olarak patojenite düşüktür.

Kimlik

Viridans streptococci, viridans streptococci optochine dirençli olduğu için, bir optochin testi kullanılarak Streptococcus pneumoniae'dan Streptococcus pneumoniae'den ayırt edilebilir ; bunlar aynı zamanda, ya eksikliği polisakarit merkezli kapsül tipik S. pneumoniae veya Lancefield antijenleri arasında piyojenik cinsinin üyeleri.

	Viridans streptococci	Streptococcus pneumoniae
Safrada parçalanmış	Çözülmez	Çözünür
İnülin fermantasyonu	Mayalayıcı değil	Asit üretimi olan fermentör
Optokine duyarlılık	Hassas değil	Hassas
Farelere patojenite	Patojenik olmayan	Patojenik
Quellung testi (aktif olarak kullanılmamaktadır)	Olumsuz	Pozitif

Patoloji

Organizmalar en çok ağızda bulunur ve grubun bir üyesi olan S. mutans , çoğu durumda ve popülasyonda diş çürüğünün nedenidir . S. sanguinis de başka bir potansiyel nedendir. Diğerleri, perikoronit gibi diğer ağız veya dişeti enfeksiyonlarına karışabilir . Kan dolaşımına girerlerse , özellikle kalp kapakçıkları hasarlı kişilerde endokardite neden olma potansiyeline sahiptirler . Subakut bakteriyel endokarditin en yaygın nedenleridir . Viridans streptococci, neonatal enfeksiyon vakalarında tanımlanır .

Viridans streptococci , glikozdan dekstran sentezleme konusunda benzersiz bir yeteneğe sahiptir , bu da onların hasarlı kalp kapakçıklarında fibrin - trombosit agregalarına yapışmasına izin verir . Bu mekanizma, kan dolaşımına girmelerini takiben (örneğin diş çekimi sonrasında ) subakut kalp kapak hastalığına neden olma yeteneklerinin altında yatar .

Kimlik

Fenotipik ve biyokimyasal tanımlama

VGS'nin tür düzeyinde tanımlanması zor olabilir ve fenotipik tanımlama her zaman doğru değildir. Birçok tür kanlı agarda herhangi bir hemoliz üretmediğinden, "viridans" adı bir şekilde yanlış bir isimdir. Bir sınıflandırma perspektifinden, alfa-hemolizi kanlı agar plaklarındaki hemoliz eksikliğinden (bazen "gama-hemoliz" olarak anılır) ayırt etmeye çalışmak yararlı değildir; bu özellik, organizmayı yetiştirmek için kullanılan büyüme ortamına ve ayrıca inkübasyon sıcaklığına göre büyük ölçüde değişebilir. Alfa hemoliz eksikliği, hastalığın klinik sonucu veya ciddiyeti ile ilişkili görünmemektedir; alfa hemolizin bir yan ürünü olarak hiçbir enzimatik veya toksijenik etki belgelenmemiştir.

Mikroskop altında, viridans grubundaki bakteriler zincirlerde gram pozitif koklardır. Katalaz ifade etmezler ve dolayısıyla katalaz negatiftirler. Lösin aminopeptidaz pozitif, pirolidonilamidaz negatiftirler ve% 6,5 NaCl'de büyümezler ve neredeyse tüm türler safra eskülin agarda büyüme için negatiftir. Optokine dirençli olmaları ve safrada çözünür olmamaları bakımından pnömokoklardan farklıdırlar. Ancak Richter ve ark. pnömokok olarak antimikrobiyal sürveyans programlarına gönderilen VGS'nin yanlış tanımlanmasını incelemiş ve S. pneumoniae'nin VGS'den ayrımının zor olabileceğini bulmuştur , bu da S. mitis ve S. oralis'in >% 99 sekans homolojisine sahip olduğu gerçeği ışığında şaşırtıcı değildir. ile S. pneumoniae (47). Yazarlar ayrıca optokin disk testinin, tanımlama için safra çözünürlük testinin yanı sıra başarılı olmadığını da bulmuşlardır; Test edilen 1.733 izolat üzerinde yapılan bir ankette, safra çözünürlük testi, VGS'nin pnömokoklardan farklılaşması için daha yüksek duyarlılık ve özgüllüğe sahipti (47).

S. anginosus grubu S. anginosus organizmaların grubu, alfa- veya beta-hemolitik olmayan olabilir. Beta hemolizden yoksun izolatlar genellikle VGS ile gruplandırılmış olanlardır. S. constellatus , bu grubun beta hemolitik olma olasılığı en yüksek olanıdır. Beta-hemolitik S. constellatus subsp. farenjit nedeni olarak farenjis (55). S. intermedius , bu gruptaki en yaygın beyin ve karaciğer apselerinden izole edilen türdür. S. anginosus rağmen Lancefield gruba sahip olabilir grubudur, A, C, G ve F antijenleri S. intermedius hemen hemen hiç Lancefield grup antijenleri sahiptir. S. anginosus grubunun izolatları karakteristik bir "karamela" kokusuna sahiptir. Grubun üyeleri, üç biyokimyasal reaksiyon için evrensel olarak pozitiftir: glikozdan asetoin üretimi (pozitif Vogues-Proskauer reaksiyonu), arginin ve sorbitoldür. Bunlar, bu grubun diğer VGS'den ayrılması için çok kullanışlıdır.

S. mitis grubu. S. mitis organizma grubu, birkaç tür içerir ve türlerin düzeyde tanımlama çok zor bir hale gelebilir, çok etkisiz biyokimyasal olan. Geçersiz tür adlarının kullanılması da S. mitis grubu için özel bir sorun olmuştur . Bu gruptaki izolatlar asetoin üretimi, arginin, eskülin ve mannitol için negatiftir ve sorbitol fermentasyonu negatiftir (14). S. pneumoniae , S. mitis grubunun yeni karakterize edilmiş bir üyesidir (1). Organizma S. pneumoniae ve diğer S. mitis grubu organizmalarla yakından ilişkili olduğundan, doğru tanımlama zor olabilir. S. pseudopneumoniae pnömokok kapsülü yoksundur ve yüksek CO içeren bir atmosferde inkübe optokine dayanıklıdır ₂ ama süre boyunca ortam havasında zaman açıktır. Organizma safrada çözünür olmadığından, safra çözünürlüğü, S. pseudopneumoniae için optokine duyarlılığından daha spesifik bir testtir (1).

S. sanguinis grubu Genetik olarak heterojen S. sanguinis grubu, daha önce S. sanguinis olarak biliniyordu . Bazı taksonomistler, S. sanguinis grubunu , 16S rRNA gen sekans analizine dayalı olarak S. mitis grubuyla birleştirmişlerdir, ancak S. sanguinis grubu organizmaları, farklı fenotipik özellikler sergilemektedir. S. sanguinis grubundaki izolatlar arginin ve eskülin pozitiftir. S. mitis grubunun üyeleri gibi , asetoin üretimi ve mannitol ve sorbitol fermantasyonu için negatiftirler. S. Sanguinis grubu içeren S. Sanguinis , S. parasanguinis ve S. Gordonii (14).

S. salivarius grubu S. salivarius grubu yakından ilgilidir S. bovis grubu. İnsan enfeksiyonu izole edilmiştir, bu gruptan türler bulunmaktadır , S. salivarius ve S. vestibularis yanı sıra , S. thermophilus süt ürünlerinden tespit edilmiştir. S. salivarius grubu organizmalar asetoin üretimi için pozitiftir ve eskülin pozitiftir ancak arginin hidrolizi ve mannitol ve sorbitol fermentasyonu için negatiftir.

S. mutans grubu üyeleri S. mutans grubu ağırlıklı olarak insan ağız boşluğu izole edilmiş ve fenotipik yönlerden birbirine benzer birçok türü içerir edilir. S. mutans ve S. sobrinus , insan enfeksiyonundan en yaygın olarak izole edilen bu gruptaki türlerdir. Arginin hidrolize etmezler ancak asetoin üretimi, eskülin hidrolizi ve mannitol ve sorbitol fermantasyonu için pozitiftirler.

Tanımlamaya yönelik otomatik biyokimyasal yöntemler VGS için, tanımlama için otomatikleştirilmiş sistemlerin kullanımı geçmişte sorunlu olarak rapor edilmiştir ve bu tema birden fazla otomatikleştirilmiş metodoloji için geçerlidir. Oluşturulan tanımlamaların kalitesini etkileyen en önemli faktörlerden biri, sistemlerin veritabanlarında temsil edilen tüm türlere sahip olmayabilmesidir (32). Vitek2 ID-GPC kartının doğruluğunu çeşitli Gram-pozitif ve Gram-negatif organizmaların tanımlanmasına yönelik geleneksel agar bazlı biyokimyasal yöntemlerle karşılaştıran bir araştırmada, Gram-pozitif izolatların% 72'si Vitek2 tarafından doğru bir şekilde tanımlanmıştır. sistemi (21). En sorunlu tanımlamalar arasında (yanlış tanımlanmış veya çözülmemiş) VGS; S. anginosus , S. mutans ve S. sanguinis , diğer VGS türleri olarak ve bazı durumlarda S. pneumoniae olarak yanlış tanımlandı (21).

BD Phoenix sistemi SMIC / ID panelinin Streptococcus spp. 34 VGS izolatı da dahil olmak üzere 97 ardışık klinik streptokok izolatını biyokimyasal yöntemlerle referans yöntem olarak sınıflandırmıştır (26). Streptokokal izolatların yüzde doksan biri, Phoenix ve referans yöntem arasında uyum gösterdi. Test edilen 12 S. mitis grubu izolatından Phoenix sistemi, iki uyumsuz tanımlamayla yedi izolatı doğru bir şekilde tanımladı ve Phoenix sisteminin herhangi bir tanımlama üretmediği üç izolat vardı. 22 S. anginosus grubu izolatından 18'i doğru olarak tanımlandı ve dördü uyumsuzdu. İkinci bir çalışma, Phoenix SMIC / ID-2 panelini bir karşılaştırma yöntemi olarak API 20 Strep sistemini kullanarak değerlendirdi (tutarsız sonuçların 16S rRNA gen sıralaması ve temizlik genlerinin amplifikasyonu ve dizilemesi yoluyla çözümlenmesi) (5). VGS için, Phoenix ile S. mitis grubu organizmaları için referans yöntemler arasında yalnızca% 53 uyum, S. anginosus grubu için% 100 uyum ve S. sanguinis grubu organizmaları için% 75 uyum ile 31 izolat test edilmiştir (5) .

Dizi bazlı tanımlama Geçmişte, DNA-DNA hibridizasyon çalışmaları, VGS için tür düzeyinde tanımlamaları doğrulamak için kullanılmıştır. Ancak bu prosedürler, klinik laboratuvarların bu organizmaların tanımlanmasında kullanması için pratik değildir. Diğer sekans bazlı tanımlama sistemleri daha sonra VGS tür seviyesi tanımlaması için tanıtıldı. Genel olarak, 16S rRNA gen sıralaması, VGS'de tür seviyesinde zayıf çözünürlükle sonuçlanır. Bunun nedeni, bu organizma grubundaki yüksek 16S rRNA gen homolojisidir; S. mitis , S. oralis , S. pseudopneumoniae ve S. pneumoniae , bu gende hemen hemen her zaman>% 99 sekans homolojisine sahiptir. 16S rRNA gen dizisi benzerliğinin yüksek derecesinin ışığında, tür düzeyinde güvenilir tanımlama için alternatif gen hedeflerinin dizilenmesi araştırılmıştır. Umut verici bir hedef olan rnpB, iki değişken rnpB bölgesini pyrosequencing ile analiz eden Innings ve arkadaşları tarafından araştırıldı (28). : 43 tür analiz ki, bütün iki izolatın haricinde tür düzeyinde belirlendi S. anginosus / S. constellatus ve S. infantis / S. peroris . rnpB, yüksek seviyeli çözünürlükle VGS'nin tanımlanması için kullanılabilir. Bir diğer başarılı yaklaşım, Poyart ve diğerleri tarafından açıklanan, manganeze bağımlı süperoksit dismutaz geninin dizi analizidir. Bu teknik, S. mitis , S. oralis ve S. pneumoniae'nin (44, 45) açık bir şekilde farklılaşmasıyla 16 VGS türü dahil 29'dan fazla streptokok türünü doğru bir şekilde ayırt etmek için kullanıldı . Çeşitli başarı dereceleri ile kullanılan diğer teknikler, 16S-23S intergenik aralayıcı bölgenin dizi analizi, d-alanin-d-alanin ligaz gen dizilemesi ve hiyaluronat liyaz gen dizilemesidir.

Referanslar

daha fazla okuma

Naveen Kumar, Venkatesan; van der Linden, Mark; Menon, Thangam; Patric Nitsche-Schmitz, D. (Mayıs 2014). "İki bölgede zıt epidemiyolojiye sahip enfektif endokardite neden olan Viridans ve bovis grubu streptokoklar". Uluslararası Tıbbi Mikrobiyoloji Dergisi . 304 (3–4): 262–268. doi : 10.1016 / j.ijmm.2013.10.004 . PMID   24220665 .