TSG101 - TSG101

Mevcut protein yapıları:
Pfam	yapılar / ECOD
PDB	RCSB PDB ; PDBe ; PDBj
PDB toplamı	yapı özeti

Vps23_core
Vps23_core
	escrt-i çekirdeği
tanımlayıcılar
Sembol	Vps23_core
Pfam	PF09454
InterPro	IPR017916
Pfam
Mevcut protein yapıları:
Pfam	yapılar / ECOD
PDB	RCSB PDB ; PDBe ; PDBj
PDB toplamı	yapı özeti

TSG101
Mevcut yapılar
PDB	Ortologtur arama: PDBe RCSB
PDB kimlik kodlarının listesi
	1KPP , 1KPQ , 1M4P , 1M4Q , 1S1Q , 2F0R , 3IV1 , 3OBQ , 3OBS , 3OBU , 3OBX , 3P9G , 3P9H , 4EJE , 4YC1 , 4ZNY
tanımlayıcılar
takma adlar	TSG101 , TSG10, VPS23, tümör duyarlılığı 101
Harici kimlikler	OMIM : 601387 MGI : 106581 HomoloGene : 4584 GeneCards : TSG101
Gen konumu ( İnsan )
Chr.	Kromozom 11 (insan)
Son	18.526.951 baz puan
Gen konumu ( Fare )
Chr.	Kromozom 7 (fare)
Son	46.919.969 baz puan
RNA ifade modeli
	Daha fazla referans ifade verisi
Gen ontolojisi
moleküler fonksiyon	• DNA bağlanması ; • protein homodimerizasyon aktivitesi ; • GO:0001106 transkripsiyon koruyucu aktivitesi ; • kalsiyuma bağımlı protein bağlanması ; • ubikuitin bağlanması ; • GO:0001948 protein bağlanması ; • nükleer reseptör koaktivatör aktivitesi ; • virion bağlanması ; • ubikuitin protein ligaz bağlanması ; • GO:0032403 protein içeren kompleks bağlayıcı;
Hücresel bileşen	• Sitoplazma ; • multiveziküler vücut ; • endosome ; • Geç endozom ; • membran ; • Geç endozom membranı ; • plazma zarı ; • erken endozom ; • nükleolus ; • endosome membran ; • Hücre dışı eksozomla ; • ESCRT Karmaşık ; • çekirdeği ; • sitozolunda ; • konak hücre ; • merkezini organize mikrotübül ; • sitoskeleton ; • erken endozom membran ; • Flemming gövde;
biyolojik süreç	• GO: virüs 0046795 hücre içi ulaşım ; • hücre farklılaşması ; • ubiquitin bağımlı endositoz pozitif düzenleme ; • tertibatı hücre dışı eksozom düzenlenmesi ; • ana ESCRT kompleksi ile viral olgunlaşmasını ; • GO: 0019067 viral yaşam çevrimi ; • lizozom taşınması endozom ; • düzeneği multiveziküler gövde ; • Protein monoubikuitinasyon ; • viral tomurcuklanma ; • keratinosit farklılaşması ; • hücre bölünmesi ; • endozomal taşıma ; • GO:0000046 otofagozom olgunlaşması ; • hücresel protein modifikasyon süreci ; • hücre büyümesinin düzenlenmesi ; • protein taşınması ; • multiveziküler vücut sınıflandırma yolu yoluyla ubikuitine bağımlı protein katabolik süreç ; • MAP kinazın düzenlenmesi aktivitesi ; • pozitif düzenleme exosomal salgılama ; • hücre döngüsü ; • büyüme regülasyonu ; • transkripsiyon negatif düzenlenmesi, DNA şablonu ; • hücre popülasyonu çoğalmasının negatif düzenlenmesi ; • GO: 0022415, viral işlem ; • exosomal salgılama ; • macroautophagy ; • epidermal büyüme faktörü reseptörü sinyallemesinin negatif düzenlenmesi yol yol ; • epidermal büyüme faktörü ile aktive olan reseptör aktivitesinin negatif regülasyonu ; • taşıma ; • hücre dışı taşıma ; • nükleik asit şablonlu transkripsiyonun pozitif regülasyonu;
	Kaynaklar: Amigo / QuickGO
ortologlar
	7251
	22088
	ENSG00000074319
	ENSMUSG00000014402
	Q99816
	Q61187
	NM_006292
	NM_021884 ; NM_001348088 ; NM_001348089
	NP_006283
	NP_068684 ; NP_001335017 ; NP_001335018
	Vikiveri
İnsan Görüntüle/Düzenle	Fareyi Görüntüle/Düzenle

TSG101 olarak da bilinen tümör duyarlılık geni 101 , aynı adı taşıyan bir hücresel proteini kodlayan bir insan genidir .

İşlev

Bu gen tarafından kodlanan protein, ubikuitin-konjuge edici enzimlerin görünüşte aktif olmayan homologlarından oluşan bir gruba aittir. Gen ürünü, tümör oluşumunda rol oynayan bir sitozolik fosfoprotein olan statmin ile etkileşime giren bir sarmal-sarmal alanı içerir . Protein, hücre büyümesinde ve farklılaşmasında rol oynayabilir ve negatif büyüme düzenleyicisi olarak hareket edebilir. Bu tümöre yatkınlık geninin in vitro kararlı durum ekspresyonu, genomik stabilitenin ve hücre döngüsü düzenlemesinin sürdürülmesi için önemli görünmektedir. Bu gendeki mutasyonlar ve alternatif ekleme, meme kanserinde yüksek sıklıkta meydana gelir ve meme kanseri tümörijenezi ve/veya ilerlemesi sırasında kusurların meydana geldiğini düşündürür.

TSG101'in ana rolü ESCRT yoluna katılmaktır . Bu yol, ters topoloji tomurcuklanmasını ve lizozomlara bozulmaya yönelik kargo ileten multiveziküler cisimlerin (MVB) oluşumunu kolaylaştırır. TSG101 , VPS23/TSG101 alt biriminin UEV protein alanı aracılığıyla kısa doğrusal motifi tanır : P(T/S)AP . ESCRT-I kompleksinin montajı, VPS23'ün C-terminali sabitlik kutusu (SB), VPS28'in N-terminal yarısı ve VPS37'nin C-terminal yarısı tarafından yönetilir. Yapı, esas olarak üç uzun, paralel oluşan sarmal her biri farklı bir alt birimine karşılık gelen, saç tokası. Çekirdeğin ötesine uzanan ek alanlar ve motifler , ESCRT-I kritik işlevleri için kavrama araçları olarak hizmet eder.

viral korsanlık

TSG101, HIV ve diğer virüslerin patogenezinde önemli bir rol oynar . Enfekte olmamış hücrelerde, TSG101, multiveziküler gövdenin (MVB) biyogenezinde işlev görür; bu , HIV'in, MVB vezikül tomurcuklanmasını katalize eden akış aşağı makinelere erişim sağlamak için TSG101'i bağlayabileceğini düşündürür.

Etkileşimler

TSG101'in aşağıdakilerle etkileşime girdiği gösterilmiştir :

EP300 ,
HGS ,
LRSAM1 ,
P21 ,
P53 ve
VPS28 .

Ortolog, Vps23

İnsanlarda, ESCRT-1'in bir bileşenine sahip olan vps23'ün ortologu Tsg101 olarak adlandırılır. Tsg-101'deki mutasyonlar servikal, meme, prostat ve gastrointestinal kanserlerle ilişkilendirilmiştir. Moleküler biyolojide vps23 (vakuolar protein sıralama) bir protein alanıdır . Vps proteinleri, erken endozomda protein sınıflandırması için gerekli olan ESCRT'lerin (taşıma için gerekli endozomal sıralama kompleksleri) bileşenleridir. Daha spesifik olarak, vps23, ESCRT-I'nin bir bileşenidir. ESCRT kompleksleri makine tahrik oluşturan protein sıralama dan endozomlara için lizozomların . ESCRT kompleksleri, reseptör aşağı regülasyonu, lizozom biyogenezi ve HIV'in tomurcuklanması için merkezidir .

Yapı

Maya ESCRT-I, VPS23, VPS28 ve VPS37 olmak üzere üç protein alt biriminden oluşur. İnsanlarda ESCRT-I, TSG101, VPS28 ve dört potansiyel insan VPS37 homologundan birini içerir .

Ayrıca bakınız

FGI-104 - geniş spektrumlu bir antiviral olarak araştırılan bir ESCRT inhibitörü

Referanslar

daha fazla okuma

Mazze FM, Derece L (2006). "İnsan immün yetmezlik virüsünün tomurcuklanmasında viral ve hücresel proteinlerin rolü". Acta Virol . 50 (2): 75–85. PMID 16808324 .
Serbest EO, Mouland AJ (2006). "HIV-1 ve diğer retrovirüslerin hücre biyolojisi" . Retroviroloji . 3 : 77. doi : 10.1186/1742-4690-3-77 . PMC 1635732 . PMID 17083721 .
Li L, Li X, Francke U, Cohen SN (1997). "TSG101 tümör duyarlılığı geni, kromozom 11 bant p15'te bulunur ve insan meme kanserinde mutasyona uğrar" . Hücre . 88 (1): 143–54. doi : 10.1016/S0092-8674(00)81866-8 . PMID 9019400 .
Koonin EV, Abagyan RA (1997). "TSG101, bir baskın negatif ubikuitin düzenleyici sınıfının prototipi olabilir". Nat. Genet . 16 (4): 330–1. doi : 10.1038/ng0897-330 . PMID 9241264 . S2CID 36275138 .
Steiner P, Barnes DM, Harris WH, Weinberg RA (1997). "İnsan meme kanserinde tümör duyarlılık geni TSG101'de yeniden düzenlemelerin olmaması". Nat. Genet . 16 (4): 332–3. doi : 10.1038/ng0897-332 . PMID 9241265 . S2CID 20233125 .
Lee MP, Feinberg AP (1997). "İnsan meme kanserinde TSG101'in anormal ekleme ama mutasyonları değil". Kanser Araş . 57 (15): 3131–4. PMID 9242438 .
Gayther SA, Barski P, Batley SJ, Li L, de Foy KA, Cohen SN, Ponder BA, Caldas C (1997). "TSG101 ve FHIT genlerinin anormal eklenmesi, çoklu malignitelerde ve normal dokularda sıklıkla meydana gelir ve daha önce tümörlerde tarif edilen değişiklikleri taklit eder" . onkogen . 15 (17): 2119–26. doi : 10.1038/sj.onc.1201591 . PMID 9366528 .
Xie W, Li L, Cohen SN (1998). "TSG101 proteininin hücre döngüsüne bağlı hücre altı lokalizasyonu ve TSG101 eksikliği ile ilişkili mitotik ve nükleer anormallikler" . Proc. Natl. Acad. bilim ABD . 95 (4): 1595–600. Bibcode : 1998PNAS...95.1595X . doi : 10.1073/pnas.95.4.1595 . PMC 19109 . PMID 9465061 .
Wagner KU, Dierisseau P, Rucker EB, Robinson GW, Hennighausen L (1998). "Fare ve insan tümör duyarlılığı geni TSG101'in genomik mimarisi ve transkripsiyonel aktivasyonu: yaygın kısa transkript türleri gerçek alternatif ek varyantlarıdır" . onkogen . 17 (21): 2761-70. doi : 10.1038/sj.onc.1202529 . PMID 9840940 .
Sun Z, Pan J, Hope WX, Cohen SN, Balk SP (1999). "Tümör duyarlılığı gen 101 proteini androjen reseptörü transaktivasyonunu bastırır ve p300 ile etkileşime girer". kanser . 86 (4): 689-96. doi : 10.1002/(SICI)1097-0142(19990815)86:4<689::AID-CNCR19>3.0.CO;2-P . PMID 10440698 .
Hittelman AB, Burakov D, Iñiguez-Lluhi JA, Freedman LP, Garabedian MJ (1999). "AF-1 ile ilişkili proteinler yoluyla glukokortikoid reseptörü transkripsiyonel aktivasyonunun farklı düzenlenmesi" . EMBO J. . 18 (19): 5380–8. doi : 10.1093/emboj/18.19.5380 . PMC 1171607 . PMID 10508170 .
Rountree MR, Bachman KE, Baylin SB (2000). "DNMT1, çoğaltma odaklarında bir kompleks oluşturmak için HDAC2'yi ve yeni bir yardımcı baskılayıcı olan DMAP1'i bağlar". Nat. Genet . 25 (3): 269-77. doi : 10.1038/77023 . PMID 10888872 . S2CID 26149386 .
Piskopos N, Woodman P (2001). "TSG101/memeli VPS23 ve memeli VPS28, doğrudan etkileşime girer ve VPS4 ile indüklenen endozomlara alınır" . J. Biol. Chem . 276 (15): 11735–42. doi : 10.1074/jbc.M009863200 . PMID 11134028 .
Li L, Liao J, Ruland J, Mak TW, Cohen SN (2001). "Bir TSG101/MDM2 düzenleyici döngü, MDM2 bozulmasını ve MDM2/p53 geri besleme kontrolünü modüle eder" . Proc. Natl. Acad. bilim ABD . 98 (4): 1619–24. Bibcode : 2001PNAS...98.1619L . doi : 10.1073/pnas.98.4.1619 . PMC 29306 . PMID 11172000 .
VerPlank L, Bouamr F, LaGrassa TJ, Agresta B, Kikonyogo A, Leis J, Carter CA (2001). "Ubikuitin-konjuge edici (E2) enzimlerinin bir homologu olan Tsg101, HIV tip 1 Pr55(Gag) içindeki L alanını bağlar" . Proc. Natl. Acad. bilim ABD . 98 (14): 7724–9. Bibcode : 2001PNAS...98.7724V . doi : 10.1073/pnas.131059198 . PMC 35409 . PMID 11427703 .
Garrus JE, von Schwedler UK, Pornillos OW, Morham SG, Zavitz KH, Wang HE, Wettstein DA, Stray KM, Côté M, Rich RL, Myszka DG, Sundquist WI (2001). "Tsg101 ve vakuolar protein sıralama yolu, HIV-1 tomurcuklanması için gereklidir" . Hücre . 107 (1): 55-65. doi : 10.1016/S0092-8674(01)00506-2 . PMID 11595185 . S2CID 18525780 .
Martin-Serrano J, Zang T, Bieniasz PD (2002). "HIV-1 ve Ebola virüsü, çıkışı kolaylaştırmak için Tsg101'i partikül toplanma bölgelerine alan küçük peptit motiflerini kodlar". Nat. Med . 7 (12): 1313–9. doi : 10.1038/nm1201-1313 . PMID 11726971 . S2CID 19655035 .
Demirov DG, Ono A, Orenstein JM, Freed EO (2002). "TSG101'in N-terminal alanının aşırı ekspresyonu, geç alan işlevini bloke ederek HIV-1 tomurcuklanmasını engeller" . Proc. Natl. Acad. bilim ABD . 99 (2): 955–60. Bibcode : 2002PNAS...99..955D . doi : 10.1073/pnas.032511899 . PMC 117412 . PMID 11805336 .
Bennett NA, Pattillo RA, Lin RS, Hsieh CY, Murphy T, Lyn D (2002). "Jinekolojik tümörlerde TSG101 ekspresyonu: siklin D1, siklin E, p53 ve p16 proteinleri ile ilişki". Hücre. Mol. Biol. (Gürültülü-le-grand) . 47 (7): 1187-93. PMID 11838966 .
Piskopos N, Horman A, Woodman P (2002). "Memeli sınıfı E vps proteinleri, ubikuitini tanır ve endozomal protein-ubikuitin konjugatlarının çıkarılmasında hareket eder" . J. Hücre Biol . 157 (1): 91–101. doi : 10.1083/jcb.200112080 . PMC 2173266 . PMID 11916981 .

Languages

In other projects