Stenotrophomonas - Stenotrophomonas
| Stenotrofomonas | |
|---|---|
| bilimsel sınıflandırma | |
| Krallık: | |
| Şube: | |
| Sınıf: | |
| Sipariş: | |
| Aile: | |
| Cins: |
Stenotrofomonas
Palleroni ve Bradbury 1993
|
| Türler | |
|
S. acidaminiphila |
|
Stenotrophomonas a, cins ve Gram-negatif bakteri , en az on türlerini içeren,. Stenotrophomonas'ın ana rezervuarları toprak ve bitkilerdir. Stenotrophomonas türleri, yaygın toprak organizmalarından ( S. nitritireducens ) fırsatçı insan patojenlerine ( S. maltophilia ) kadar çeşitlilik gösterir, cinsin moleküler taksonomisi hala biraz belirsizdir.
Önem
En yaygın tür olan S. maltophilia çok yönlüdür ve bitki büyümesi ve sağlığı için yararlı olabilir, tarım, biyo-kontrol, biyoremediasyon ve fitoremediasyon stratejilerinin yanı sıra ekonomik değeri olan biyomoleküllerin üretiminde kullanılabilir. Öte yandan, bazı S. maltophilia suşları, çoklu ilaca dirençli profile sahip insanlar için patojeniktir . S. indologenes ayrıca insanlarda, özellikle küçük çocuklarda polimikrobiyal enfeksiyonlara neden olabilir veya bunların bir parçası olabilir. Stenotrophomonas , yakından ilişkili cins Xylella ve Xanthomonas'ın aksine fitopatojenik olabilir . Stenotrophomonas cinsinin üyeleri , nitrojen ve sülfür döngülerinde önemli bir ekolojik role sahiptir. Stenotrophomonas türleri, özellikle S. maltophilia ve S. rhizophila , genellikle salatalık, yağlı tohum kolza, patates, çilek, yonca, ayçiçeği, mısır, pirinç, buğday, çeşitli yabani otlar, söğüt ve kavak gibi bitkilerle birlikte bulunur. Stenotrofomonas , rizosferden veya iç bitki dokularından, özellikle kök ve gövdenin vasküler dokularından izole edilebilir .
Tarih
Tanımlanan ilk tür , 1961'de Hugh ve Ryschenko tarafından S. maltophila idi . O zamanlar Pseudomonas maltophilia olarak adlandırıldı , ancak daha sonra kendi cinsi verilmeden önce Xanthomonas cinsine aktarıldı . Cins adı (Yunanca 'stenos', dar anlamında, 'trophus', besleyen anlamına gelir ve 'monas', birim anlamına gelir) bakterinin sınırlı beslenme aralığını vurgulamayı amaçladı. Bununla birlikte, daha sonra birkaç çalışma, cinsin büyük metabolik çok yönlülük ve intraspesifik heterojenlik yeteneğine sahip olduğunu gösterdi.
Genetik
Bir çevresel izolatın tam genom sekansı, S. maltophilia R551‑3 ve bir klinik izolat, S. maltophilia K279a mevcuttur. Her iki suş da , yapışma ve biyofilm oluşumunun erken aşamalarında yer alan tip I pili'yi kodlayan genleri ve yapışma, oto-agregasyon, seğirme motilitesi ve biyofilm oluşumunda rol oynayan tip IV pili içerir . Sıralı genomlarda pili kodlayıcı gen kümelerinin korunmuş dağılımı, bitki ve hayvan kolonizasyon stratejilerindeki benzerlikleri gösterebilir. Tanımlanması Stenotrophomonas spp . bu bakteriler, standart metabolizma bazlı fenotipleme panellerinin çoğunda hiçbir aktivite göstermediğinden, sorunludur. Ek olarak, türler% 95.7-99.6 16S rRNA gen dizisi benzerlikleriyle genotipik olarak benzerdir. DNA girazının B alt birimini kodlayan temizlik genlerinden biri olan gyrB, tipleme için başarıyla kullanıldı. Ayrıca gyrB sekans karşılaştırmaları, S. maltophilia olarak tanımlanan suşların farklı yeni türleri temsil edebileceğini gösterir.
Stenotrophomonas maltophilia genomunda bir uçta tetranükleotid GTAG taşıyan küçük palindromik elementlerin yaygın olduğu bulunmuştur . Tekrarlar, tekrarlayan ekstragenik palindromların (REP'ler) süper ailesinin türe özgü varyantlarıdır. Yüzlerce gen, bu tekrarlar tarafından hemen kuşatılır ve bunlar, mRNA'daki tekrarların katlanmasıyla ve yukarı akış transkriptlerini stabilize ederek veya bunların degradasyonunu destekleyerek RNA kontrol sekansları olarak işlev görür.
Metabolizma
Stenotrophomonas spp. bitkiler, insanlar ve deniz ortamları gibi farklı biyotopları verimli bir şekilde kolonileştirebilir. Stenotrophomonas spp. Bitki kökü sızıntılarında bulunan fenolik bileşikler de dahil olmak üzere rizosferde bulunan çok çeşitli organik bileşikleri metabolize eder. S. maltophilia düşürebilir p -nitrofenolu ve 4-klorofenol, polisiklik aromatik hidrokarbonlar , selenyum bileşikleri, benzen, toluen, etilbenzen ve xenobiotik. Stenotrophomonas spp. bitki büyüme hormonu indol ‑ 3 ‑ asetik asit (IAA) üretir, ayrıca bitkiler için sülfat sağlayan nitrojen fiksasyonu ve elemental sülfürün oksidasyonu nedeniyle bitki büyümesini teşvik edebilir. Birçok S. maltophilia suşu, çeşitli ağır metallere karşı içsel dirence sahiptir. Çoğu S. maltophilia izolatı, maltofilin ve ksantobasin gibi antifungal bileşikler veya antifungal aktiviteye sahip uçucu organik bileşikler üretir. S. maltophilia suşları, olağanüstü yüksek hidrolitik potansiyele sahiptir; çeşitli proteazlar, kitinazlar, glukanazlar, DNazlar, RNazlar, lipazlar ve lakkazlar üretirler. S. maltophilia , demir-siderofor komplekslerinin aktif taşınması için kullanılan siderofor enterobaktin ve birçok TonB'ye bağımlı reseptör (TBDR) ürettikleri için demir alımı için donatılmıştır.
Referanslar
Dış bağlantılar
 
|
Bu Gammaproteobacteria ile ilgili makale bir taslaktır . Wikipedia'yı genişleterek yardım edebilirsiniz . |