Sinyal peptidazlar olan enzimler bunların ayrılması suretiyle olgun ya da pro biçimlerinin salgı ve bazı zar proteinlerini dönüştürmek sinyal peptidlerini kendi gelen N-uçlarının .
Sinyal peptidazları başlangıçta fare miyelom hücrelerinden izole edilen endoplazmik retikulum (ER) türevli membran fraksiyonlarında gözlendi . César Milstein ve meslektaşlarının temel gözlemi , immünoglobulin hafif zincirlerinin, ER membran fraksiyonu tarafından işlenen daha yüksek moleküler ağırlıklı bir formda üretildiğiydi. Bu bulguyu doğrudan yer değiştirme makinelerinin keşfi takip etti . Sinyal peptidazları, prokaryotların yanı sıra mitokondri ve kloroplastların protein içe aktarma mekanizmasında da bulunur .
Şimdiye kadar açıklanan tüm sinyal peptidazları serin proteazlardır . Sinyal peptitlerini transloke öncü proteinlerden endoproteolitik olarak ayıran aktif bölge , zarın ekstrasitoplazmik bölgesinde bulunur. Ökaryotik sinyal peptidazı, ayrılmaz bir zar protein kompleksidir. Maya genetiği tarafından tanımlanan ilk alt birim, Spc3p (21 kDa), Spc2p (18 kDa) ve Spc1p (11 kDa) olarak adlandırılan üç alt birim ile ilişkili 17 kDa'lık bir zar proteini olan Sec11'dir. Sec11, silinmesi üzerine bir büyüme kusurundan çıkarılabilen sinyal peptit işlemesi için tek temel faktördür. Fonksiyonel sinyal peptidaz kompleksi ilk olarak bir köpek ER membran fraksiyonundan saflaştırıldı. Beş memeli alt birimi, moleküler ağırlıklarına göre SPC12 , SPC18 , SPC21 , SPC22 /23 ve SPC25 olarak adlandırılır .