Pasteurellaceae - Pasteurellaceae

Pastörelgiller
Haemophilus ducreyi 01.jpg
Haemophilus ducreyi
bilimsel sınıflandırma
Krallık:
Şube:
Sınıf:
Sipariş:
Pastöreliler
Aile:
Pastörelgiller

Castellani ve Chalmers, 1919
Genera

Actinobacillus
Aggregatibacter
Avibacterium
Basfia
Bibersteinia
Bisgaardia
Caviibacterium
Chelonobacter
Conservatibacter
Cricetibacter
Frederiksenia
Gallibacterium
Glaesserella
Haemophilus
Histophilus
Lonepinella
Mannheimia
Mesocricetibacter
Muribacter
Necropsobacter
Nicoletella
Otariodibacter
Pasteurella
Phocoenobacter
Rodentibacter
Seminibacterium
Terrahaemophilus
Testudinibacter
Ursidibacter
Vespertiliibacter
Volucribacter

Pasteurellaceae Gram-negatif ait geniş bir aileyi ihtiva bakteri . Çoğu üye , özellikle üst solunum yolu olmak üzere, kuşların ve memelilerin mukozal yüzeylerinde kommensal olarak yaşar . Pasteurellaceae tipik olarak çubuk şeklindedir ve dikkate değer bir fakültatif anaerob grubudur . Biyokimyasal özellikleri, oksidaz varlığıyla ilgili Enterobacteriaceae'den ve flagella'nın yokluğuyla diğer benzer bakterilerin çoğundan ayırt edilebilir .

Pasteurellaceae ailesindeki bakteriler, metabolik özelliklere dayalı olarak bir dizi cinse göre sınıflandırılmıştır, ancak bu sınıflandırmalar genellikle farklı türler arasındaki evrimsel ilişkilerin doğru yansımaları değildir. Haemophilus influenzae , genomu dizilenen ilk organizmadır ve genetik ve moleküler metodolojilerle yoğun bir şekilde çalışılmıştır. Haemophilus cinsi bakteremi , pnömoni , menenjit ve şankroid ile ilişkili kötü şöhretli bir insan patojenidir . Pasteurellaceae ailesinin diğer patojenik üyeleri arasında Aggregatibacter , Mannheimia , Pasteurella ve Actinobacillus türleri bulunur.

Moleküler imzalar ve filogenetik pozisyon

Pasteurellaceae genomlarının karşılaştırmalı analizleri, tüm sekanslı Pasteurellaceae türleri / suşları tarafından benzersiz bir şekilde paylaşılan, ancak diğer bakterilerde bulunmayan farklı önemli proteinlerde çok sayıda (> 20) korunmuş imza indel (CSI) tanımlamıştır . Pasteurellaceae türlerinin alt grupları için spesifik olan diğer birçok CSI'ya dayanarak, ailenin en az iki sınıfa bölünmesi önerilmiştir. Önerilen bir soyundan içeren Aggregatibacter , Pasteurella , Actinobacillus succinogenes , Haemophilus influenzae , Haemophilus somnus ve Mannheimia succiniciproducens diğer içerir ise, Actinobacillus minör , Actinobacillus pleuropneumoniae , Haemophilus ducreyi , Haemophilus parasuis , ve Mannheimia haemolytica .

CSI formundaki moleküler imzalar, Pasteurellaceae familyasındaki üç ana cinsin polifilik dağılımını çözmeye yardımcı olmak için de kullanılmıştır : Actinobacillus , Haemophilus ve Pasteurella . Bu cinsler, aile içinde yaygın polifilik gösterir, ancak CSI'lerin, her bir ilgili cins içinde bir monofiletik grup oluşturan belirli türler tarafından tutarlı bir şekilde paylaşıldığı bulunmuştur . CSI'lerin dağılımı sırasıyla "gerçek" Actinobacillus , Haemophilus ve Pasteurella türlerinin sensu stricto sınıflarına karşılık gelir . Ortak soyun göstergesi olduklarından, CSI dağılımının, CSI'yı paylaşmayan türlerin farklı bir cins olarak yeniden sınıflandırılabileceği cins kimliğini belirlemek için kullanılabileceği varsayılmıştır. Klinik olarak ilgili iki cins olan Aggregatibacter ve Mannheimia'ya özgü CSI'lar da bulunmuştur .

Pasteurellales ile birlikte Enterobacterales içerisinde en son ıraksak siparişlerin olan Gammaproteobacteria . Diğer tüm sıralardan farklılıkları, bu iki takım tarafından paylaşılan ve diğer tüm bakterilerde bulunmayan çeşitli korunmuş imza proteinlerinin (CSP'ler) varlığıyla desteklenir. Pasteurellales ayrıca, Enterobacterales, Vibrionales , Aeromonadales ve Alteromonadales ile ek CSP'leri paylaşarak , büyük Gammaproteobacteria sınıfı arasındaki evrimsel dallanma ve filogenetik konumlarına ek çözünürlük ekliyor.

Referanslar