PDPN - PDPN
Podoplanin bir olan protein insanlarda "PDPN" tarafından kodlandığını gen .
Yapı ve işlev
Podoplanin, 36 ila 43 kDa'lık bir kütleye sahip müsin tipi bir proteindir. İnsanlarda, farelerde, sıçanlarda, köpeklerde ve hamsterlerde homologları ile türler arasında nispeten iyi korunmuştur.
Bu gen , insan dokularında çeşitli dağılımlara sahip , yoğun olarak O- glikosillenmiş bir glikoprotein olan tip I, integral bir zar kodlar . Bu proteinin fizyolojik işlevi, müsin tipi karakteri ile ilgili olabilir. Diğer türlerdeki homolog protein, farklılaşma antijeni ve influenza virüsü reseptörü olarak tanımlanmıştır. Bu proteinin spesifik işlevi belirlenmemiştir, ancak akciğer hasarının bir belirteci olarak önerilmiştir. Farklı izoformları kodlayan alternatif olarak eklenmiş transkript varyantları tanımlanmıştır.
Bu proteinin akciğer alveolar hücrelerinde, böbrek podositlerinde ve lenfatik endotel hücrelerinde işlevleri olduğu bulunmuştur. Daha yakın zamanlarda, bu protein hem fare hem de insan örneklerinde nöral dokuda bulunmuştur.
Lenfatik endotelyal hücrelerde yapılan deneyler, podoplaninin kardiyovasküler sistem ile lenfatik sistemler arasında uygun bağlantıların oluşumunda rol oynadığını ve bu farelerde tipik olarak yağlı karaciğer hastalığına neden olduğunu göstermiştir.
Pek çok dokuda tam işlevi bilinmemekle birlikte, podoplanin genellikle immünofloresan boyama yoluyla algılamaya açıktır ve neredeyse esas olarak nöral dokularda eksprese edilen bir tip VI ara filament proteini olan Nestin proteini ile birlikte lokalize olduğu gösterilmiştir . Şu anda, fizyolojik olarak podoplanin ile etkileşime girdiği bilinen tek protein , trombositlerde ve hematopoietik hücrelerde eksprese edilen bir C-tipi lektin 2 olan CLEC-2'dir . Her ikisi de embriyonik gelişimde kan/lenfatik bağlantıların uygun oluşumunda rol oynar.
Klinik önemi
PDPN, kanser alanında kapsamlı bir şekilde incelenmiştir. Spesifik bir lenfatik damar belirtecidir ve kanser hastalarında lenfanjiyogenez seviyeleri kötü prognoz ile korele olduğundan tanısal bir belirteç olarak kullanılabilir. Çeşitli skuamöz hücreli karsinom türleri , malign mezotelyoma ve beyin tümörleri dahil olmak üzere belirli kanser türlerinde sıklıkla yukarı regüle edilir . Ayrıca, kötü prognoz ile ilişkili olduğu tümör stromasındaki kanserle ilişkili fibroblastlar (CAF'ler) tarafından yukarı regüle edilebilir.
Skuamöz hücreli karsinomlarda, PDPN'nin, invadopodia'yı kontrol ederek kanser hücresi istilasında anahtar bir rol oynadığına ve böylece etkili ECM bozulmasına aracılık ettiğine inanılmaktadır .
Referanslar
daha fazla okuma
- Wicki A, Christofori G (Ocak 2007). "Tümör istilasında podoplaninin potansiyel rolü" . İngiliz Kanser Dergisi . 96 (1): 1–5. doi : 10.1038/sj.bjc.6603518 . PMC 2360213 . PMID 17179989 .
- Robertson NG, Khetarpal U, Gutiérrez-Espeleta GA, Bieber FR, Morton CC (Eylül 1994). "Çıkarıcı hibridizasyon ve diferansiyel tarama kullanılarak bir insan fetal koklear cDNA kütüphanesinden yeni ve bilinen genlerin izolasyonu". genomik . 23 (1): 42–50. doi : 10.1006/geno.1994.1457 . PMID 7829101 .
- Cross SH, Charlton JA, Nan X, Bird AP (Mart 1994). "Metile DNA bağlama kolonu kullanılarak CpG adalarının saflaştırılması". Doğa Genetiği . 6 (3): 236–44. doi : 10.1038/ng0394-236 . PMID 8012384 . S2CID 12847618 .
- Bonaldo MF, Lennon G, Soares MB (Eylül 1996). "Normalleştirme ve çıkarma: gen keşfini kolaylaştırmak için iki yaklaşım" . Genom Araştırması . 6 (9): 791-806. doi : 10.1101/gr.6.9.791 . PMID 8889548 .
- Kato Y, Fujita N, Kunita A, Sato S, Kaneko M, Osawa M, Tsuruo T (Aralık 2003). "Aggrus/T1alfa'nın kolorektal tümörlerde ifade edilen trombosit agregasyonunu indükleyen faktör olarak moleküler tanımlanması" . Biyolojik Kimya Dergisi . 278 (51): 51599-605. doi : 10.1074/jbc.M309935200 . PMID 14522983 . S2CID 11119751 .
- Kaneko M, Kato Y, Kunita A, Fujita N, Tsuruo T, Osawa M (Eylül 2004). "Çin hamsteri yumurtalık hücrelerinde ifade edilen Aggrus (T1alpha/Podoplanin) molekülleri üzerinde fonksiyonel sialile O-glikandan trombosit agregasyonuna" . Biyolojik Kimya Dergisi . 279 (37): 38838-43. doi : 10.1074/jbc.M407210200 . PMID 15231832 . S2CID 37651644 .
- Martín-Villar E, Scholl FG, Gamallo C, Yurrita MM, Muñoz-Guerra M, Cruces J, Quintanilla M (Mart 2005). "İnsan PA2.26 antijeninin (T1alfa-2, podoplanin), oral skuamöz hücreli karsinomlarda indüklenen küçük bir membran müsin karakterizasyonu". Uluslararası Kanser Dergisi . 113 (6): 899–910. doi : 10.1002/ijc.20656 . hdl : 10261/81190 . PMID 15515019 . S2CID 2895153 .
- Schacht V, Dadras SS, Johnson LA, Jackson DG, Hong YK, Detmar M (Mart 2005). "İnsan skuamöz hücreli karsinomlarda ve germ hücreli tümörlerde müsin tipi bir transmembran glikoproteini olan lenfatik işaretleyici podoplaninin yukarı regülasyonu" . Amerikan Patoloji Dergisi . 166 (3): 913-21. doi : 10.1016/S0002-9440(10)62311-5 . PMC 1602360 . PMID 15743802 .
- Otsuki T, Ota T, Nishikawa T, Hayashi K, Suzuki Y, Yamamoto J, Wakamatsu A, Kimura K, Sakamoto K, Hatano N, Kawai Y, Ishii S, Saito K, Kojima S, Sugiyama T, Ono T, Okano K , Yoshikawa Y, Aotsuka S, Sasaki N, Hattori A, Okumura K, Nagai K, Sugano S, Isogai T (2007). "Oligo başlıklı cDNA kitaplıklarından salgı veya zar proteinlerini kodlayan tam uzunluktaki insan cDNA'larının seçimi için silico'da sinyal dizisi ve anahtar kelime tuzağı" . DNA Araştırması . 12 (2): 117–26. doi : 10.1093/dnares/12.2.117 . PMID 16303743 .
- Hultgård-Ekwall AK, Mayerl C, Rubin K, Wick G, Rask-Andersen H (Mart 2006). "İnsan endolenfatik kanalında podoplanin eksprese eden hücrelerin bir interstisyel ağı" . Kulak Burun Boğaz Araştırmaları Derneği Dergisi . 7 (1): 38-47. doi : 10.1007/s10162-005-0021-8 . PMC 2504586 . PMID 16408168 .
- Dumoff KL, Chu CS, Harris EE, Holtz D, Xu X, Zhang PJ, Acs G (Mayıs 2006). "Tedavi öncesi biyopsi materyalindeki düşük podoplanin ekspresyonu, primer radyasyonla tedavi edilen uterin serviksin ileri evre skuamöz hücreli karsinomunda kötü prognozu öngörür" . Modern Patoloji . 19 (5): 708–16. doi : 10.1038/modpathol.3800580 . PMID 16528371 . S2CID 502212 .
- Omachi T, Kawai Y, Mizuno R, Nomiyama T, Miyagawa S, Ohhashi T, Nakayama J (Şubat 2007). "Kolorektal karsinomda çoğalan lenf damarlarının immünohistokimyasal gösterimi ve klinikopatolojik önemi". Kanser Mektupları . 246 (1–2): 167–72. doi : 10.1016/j.canlet.2006.02.013 . PMID 16574316 .
- Mishima K, Kato Y, Kaneko MK, Nishikawa R, Hirose T, Matsutani M (Mayıs 2006). "Malign ilerlemenin yeni bir moleküler belirteci olarak malign astrositik tümörlerde artan podoplanin ekspresyonu". Açta Nöropatolojik . 111 (5): 483–8. doi : 10.1007/s00401-006-0063-y . PMID 16596424 . S2CID 17760421 .
- Wicki A, Lehembre F, Wick N, Hantusch B, Kerjaschki D, Christofori G (Nisan 2006). "Epitel-mezenkimal geçiş yokluğunda tümör istilası: aktin hücre iskeletinin podoplanin aracılı yeniden şekillenmesi" . Kanser Hücresi . 9 (4): 261–72. doi : 10.1016/j.ccr.2006.03.010 . PMID 16616332 .
- Mishima K, Kato Y, Kaneko MK, Nakazawa Y, Kunita A, Fujita N, Tsuruo T, Nishikawa R, Hirose T, Matsutani M (Haziran 2006). "Birincil merkezi sinir sistemi germ hücreli tümörlerinde podoplanin ekspresyonu: germinom tanısı için yararlı bir histolojik belirteç". Açta Nöropatolojik . 111 (6): 563–8. doi : 10.1007/s00401-006-0033-4 . PMID 16718353 . S2CID 25060022 .