LMNA - LMNA

LMNA
Mevcut yapılar
PDB	Ortologtur arama: PDBe RCSB
PDB kimlik kodlarının listesi
	1IFR , 1IVT , 1X8Y , 2XV5 , 2YPT , 3GEF , 3V4Q , 3V4W , 3V5B
tanımlayıcılar
takma adlar	LMNA , CDCD1, CDDC, CMD1A, CMT2B1, EMD2, FPL, FPLD, FPLD2, HGPS, IDC, LDP1, LFP, LGMD1B, LMN1, LMNC, LMNL1, PRO1, lamin A/C, MADA, A tipi lamin
Harici kimlikler	OMIM : 150330 MGI : 96794 HomoloGene : 41321 GeneCards : LMNA
Gen konumu ( İnsan )
Chr.	Kromozom 1 (insan)
Son	156.140.081 baz puan
Gen konumu ( Fare )
Chr.	Kromozom 3 (fare)
Son	88.509.956 baz puan
RNA ifade modeli
	; ; ; ;
	Daha fazla referans ifade verisi
Gen ontolojisi
moleküler fonksiyon	• yapısal molekül aktivitesi ; • GO:0001948 protein bağlanması ; • özdeş protein bağlanması;
Hücresel bileşen	• nükleer lamina ; • sitozol ; • nükleer benek ; • lamin filament ; • sitoplazmanın perinükleer bölgesi ; • ara filament ; • çekirdek ; • GO:0005578 hücre dışı matris ; • nükleer membran ; • nükleoplazma ; • nükleer zarf;
biyolojik süreç	• hücre yaşlanmasının pozitif düzenlenmesi ; • hücre göçünün düzenlenmesi ; • çekirdek organizasyonu ; • mikrotübül hücre iskeleti polaritesinin kurulması veya sürdürülmesi ; • mitokondriden sitokrom c salınımının negatif düzenlenmesi ; • dışsal apoptotik sinyal yolunun negatif düzenlenmesi ; • kas organı gelişimi ; • protein lokalizasyonunun düzenlenmesi çekirdek ; • IRE1 aracılı katlanmamış protein tepkisi ; • mitotik nükleer membranın parçalanması ; • çekirdeğe protein lokalizasyonu ; • mitotik nükleer membranın yeniden birleşmesi ; • ventriküler kalp kası hücresi gelişimi ; • hipoksiye hücresel yanıt ; • gen ekspresyonunun pozitif düzenlenmesi ; • mezenkimal hücre proliferasyonunun negatif düzenlenmesi ; • nükleer zarf organizasyon ; • hücre popülasyon proliferasyonunun negatif regülasyonu ; • telomer bakımının regülasyonu ; • hücresel protein lokalizasyonu ; • strese yanıt olarak kalp kası hipertrofisinin negatif regülasyonu ; • çekirdeğe protein ithalatı ; • protein stabilitesinin regülasyonu ; • pozitif regul histon H3-K9 trimetilasyonu;
	Kaynaklar: Amigo / QuickGO
ortologlar
	4000
	16905
	ENSG000001160789
	ENSMUSG00000028063
	P02545
	P48678
NM_001257374 ; NM_001282624 ; NM_001282625 ; NM_001282626 ; NM_005572;
	NM_170707 ; NM_170708
	NM_001002011 ; NM_001111102 ; NM_019390
NP_001244303 ; NP_001269553 ; NP_001269554 ; NP_001269555 ; NP_005563;
	NP_733821 ; NP_733822
	NP_001002011 ; NP_001104572 ; NP_062263
	Vikiveri
İnsan Görüntüle/Düzenle	Fareyi Görüntüle/Düzenle

LMNA olarak da bilinen, Lamin / C a, proteinin insanlarda tarafından kodlandığını LMNA geni . Lamin A/C , proteinlerin lamin ailesine aittir .

İşlev

Normal hücrelerde lamin A'nın biyogenezi ve Hutchinson-Gilford progeria sendromunda olgun lamin A üretememe .

Ayarında ZMPSTE24 eksikliği lamin işleme son adım olarak, farnesil-prelamin A'nın bir birikimi ile sonuçlanır, oluşmaz Hutchinson-Gilford Progeria sendromu , prelamin A 50 amino asit delesyonu (amino 607-656 asitleri) ikinci endoproteolitik bölünme için bölgeyi kaldırır. Sonuç olarak, hiçbir olgun lamin A oluşmaz ve hücrelerde farnesillenmiş bir mutant prelamin A (progerin) birikir. Nükleer lamina, yanında yer alan bir protein, iki boyutlu bir matris meydana iç nükleer membran . Lamin proteinlerin aile matrisi oluşturan ve son derece evrim halinde muhafaza edilmektedir. Mitoz sırasında , lamina proteinleri fosforile edildiğinden, lamina matrisi geri dönüşümlü olarak demonte edilir . Lamin proteinlerinin nükleer stabilite, kromatin yapısı ve gen ekspresyonunda yer aldığı düşünülmektedir . Omurgalı katmanları A ve B olmak üzere iki tipten oluşur. Alternatif ekleme yoluyla bu gen, üç tip A lamin izoformunu kodlar.

Mitozun başlarında, olgunlaşma teşvik edici faktör (kısaltılmış MPF, aynı zamanda mitoz teşvik edici faktör veya M-faz teşvik edici faktör olarak da adlandırılır), üç nükleer tabakanın tamamında spesifik serin tortularını fosforile eder ve tabakalı ara filamentlerin depolimerizasyonuna neden olur. Fosforillenmiş lamin B dimerleri, izoprenil çapaları aracılığıyla nükleer membran ile ilişkili kalır . Lamin A, bir izoprenil grubu tarafından nükleer zara hedeflenir, ancak zara ulaştıktan kısa bir süre sonra parçalanır. Kendi protein-protein etkileşimleri ve LAP1 gibi diğer zarla ilişkili proteinler yoluyla zarla ilişkili kalır. Nükleer laminlerin depolimerizasyonu, nükleer zarfın parçalanmasına yol açar. Transfeksiyon deneyleri, insan lamin A'nın fosforilasyonunun, lamin depolimerizasyonu için ve dolayısıyla normalde mitozun başlarında meydana gelen nükleer zarfın sökülmesi için gerekli olduğunu gösterir.

Klinik önemi

Lamin A'nın Ig-katının vahşi tip (solda) ve mutasyona uğramış (sağda) formu (LMNA, PDB: 1IFR). Normalde, arginin 527 (mavi) , glutamat 537 (macenta) ile bir tuz köprüsü oluşturur , ancak R527L ikamesi bu etkileşimin kırılmasıyla sonuçlanır (lösin, glutamata ulaşmak için çok kısadır). Modeller yüzey (üst) ve çizgi (alt) gösterimde sunulmuştur.

LMNA genindeki mutasyonlar , Emery-Dreifuss kas distrofisi , ailesel kısmi lipodistrofi , uzuv kuşağı kas distrofisi , dilate kardiyomiyopati , Charcot-Marie-Tooth hastalığı ve kısıtlayıcı dermopati dahil olmak üzere çeşitli hastalıklarla ilişkilidir . Yaygın olarak progerin olarak bilinen lamin A'nın kesilmiş bir versiyonu Hutchinson-Gilford-Progeria sendromuna neden olur . Bugüne kadar 1400'den fazla SNP bilinmektedir [1] . mRNA, splicing veya protein (örn. Arg471Cys, Arg482Gln, Arg527Leu, Arg527Cys, Ala529Val ) seviyesindeki değişikliklerde kendini gösterebilirler.

DNA hasarı

DNA çift sarmal hasarları , homolog rekombinasyon (HR) veya homolog olmayan uç birleştirme (NHEJ) ile tamir edilebilir . LMNA, HR ve NHEJ'de kilit rolleri olan protein seviyelerini koruyarak genetik stabiliteyi destekler. Prelamin A'nın olgunlaşması için eksik olan fare hücreleri, artan DNA hasarına ve kromozom sapmalarına sahiptir ve DNA'ya zarar veren ajanlara karşı artan hassasiyet gösterir. Gelen Progeria , LMNA kusurlu nedeniyle DNA onarımının yetersizliği, erken yaşlanma özellikleri neden olabilir (bakınız yaşlanma DNA hasarı teori ).

Etkileşimler

LMNA'nın aşağıdakilerle etkileşime girdiği gösterilmiştir :

Referanslar

daha fazla okuma

Gruenbaum Y, Wilson KL, Harel A, Goldberg M, Cohen M (2000). "İnceleme: nükleer laminler - temel işlevleri olan yapısal proteinler". J. Yapı. Biol . 129 (2–3): 313–23. doi : 10.1006/jsbi.2000.4216 . PMID 10806082 .
Worman HJ, Courvalin JC (2000). "İç nükleer zar". J. Üye Biol . 177 (1): 1–11. doi : 10.1007/s002320001096 . PMID 10960149 . S2CID 20121844 .
Burke B, Mounkes LC, Stewart CL (2002). "Musküler distrofi ve kardiyovasküler hastalıklarda nükleer zarf". Trafik . 2 (10): 675–83. doi : 10.1034/j.1600-0854.2001.21001.x . PMID 11576443 . S2CID 19392394 .
Mounkes LC, Burke B, Stewart CL (2001). "A tipi tabakalar: kas distrofisi ve kardiyovasküler hastalıklar için bir odak noktası olarak nükleer yapısal proteinler". Trendler Kardiyovasküler Med . 11 (7): 280–5. doi : 10.1016/S1050-1738(01)00126-8 . PMID 11709282 .
Vigouroux C, Magré J, Desbois-Mouthon C, Lascols O, Cherqui G, Caron M, Capeau J (2002). "[Büyük insülin direnci sendromları: klinik ve fizyopatolojik yönler]". J. Soc. Biol . 195 (3): 249–57. doi : 10.1051/jbio/2001195030249 . PMID 11833462 .
Helbling-Leclerc A, Bonne G, Schwartz K (2002). "Emery-Dreifuss müsküler distrofisi" . Avro. J. Hım. Genet . 10 (3): 157-61. doi : 10.1038/sj.ejhg.5200744 . PMID 11973618 .
Burke B, Stewart CL (2002). "Kenarda Yaşam: nükleer zarf ve insan hastalığı". Nat. Rev. Mol. Hücre Biol . 3 (8): 575–85. doi : 10.1038/nrm879 . PMID 12154369 . S2CID 11913118 .
Novelli G, D'Apice MR (2004). ""Lumper" lamin A/C geninin garip durumu ve insan erken yaşlanması". Moleküler Tıpta Eğilimler . 9 (9): 370–5. doi : 10.1016/S1471-4914(03)00162-X . PMID 13129702 .
Pasotti M, Repetto A, Pisani A, Arbustini E (2004). "[Lamin A/C gen kusurları ile ilişkili hastalıklar: klinik kardiyologun bilmesi gerekenler]". İtalyan Kalp Dergisi Eki . 5 (2): 98–111. PMID 15080529 .
Al-Shali KZ, Hegele RA (2005). "Laminopatiler ve ateroskleroz" . Damar tıkanıklığı. Trombüs. Vask. Biol . 24 (9): 1591–5. doi : 10.1161/01.ATV.0000136392.59656.8b . PMID 15205220 .
Garg A, Çoğulu Ö, Özkınay F, Onay H, Ağarwal AK (2005). "Mandibuloakral displazili Türk hastalarda yeni bir homozigot Ala529Val LMNA mutasyonu" . J. Clin. endokrinol. Metab . 90 (9): 5259-64. doi : 10.1210/jc.2004-2560 . PMID 15998779 .
Lees-Miller SP (2006). "Lamin A'nın işlev bozukluğu, bir DNA hasar tepkisini ve hücresel yaşlanmayı tetikler". DNA Onarımı (Amst.) . 5 (2): 286–9. doi : 10.1016/j.dnarep.2005.10.007 . PMID 16344005 .
Donadille B, Lascols O, Capeau J, Vigouroux C (2006). "Görünür tip 2 diyabette etiyolojik araştırmalar: lamin A/C mutasyonları ne zaman aranmalı?". Diyabet Metab . 31 (6): 527–32. doi : 10.1016/S1262-3636(07)70227-6 . PMID 16357800 .
Genç SG, Meta M, Yang SH, Fong LG (2007). "Prelamin A farnesilasyonu ve progeroid sendromları" . J. Biol. Chem . 281 (52): 39741–5. doi : 10.1074/jbc.R600033200 . PMID 17090536 .
Halaschek-Wiener J, Brooks-Wilson A (2007). "Kök hücrelerin progeria'sı: Hutchinson-Gilford progeria sendromunda kök hücre tükenmesi" (PDF) . J. Gerontol. Bir Biol. bilim Med. Sci . 62 (1): 3–8. doi : 10.1093/gerona/62.1.3 . PMID 17301031 .
Mazereeuw-Hautier J, Wilson LC, Muhammed S, Smallwood D, Shackleton S, Atherton DJ, Harper JI (2007). "Hutchinson-Gilford progeria sendromu: LMNA'da G608G mutasyonunu taşıyan üç hastada klinik bulgular ve literatürün gözden geçirilmesi". Br. J. Dermatol . 156 (6): 1308–14. doi : 10.1111/j.1365-2133.2007.07.97.x . PMID 17459035 . S2CID 25944330 .
Sliwińska MA (2007). "[Fizyolojik ve erken yaşlanmada LMNA geninin laminlerinin ve mutasyonlarının rolü] Lehçe". Postepy Biyokimya . 53 (1): 46–52. PMID 17718387 .
Genschel J, Schmidt HH (Aralık 2000). "Lamin A/C'yi kodlayan LMNA genindeki mutasyonlar". Hımm. Mutat . 16 (6): 451–9. doi : 10.1002/1098-1004(200012)16:6<451::AID-HUMU1>3.0.CO;2-9 . PMID 11102973 .
Scaffidi P, Misteli T (Nisan 2005). "Erken yaşlanma hastalığı Hutchinson-Gilford progeria sendromunda hücresel fenotipin tersine çevrilmesi" . Nat. Med . 11 (4): 440–5. doi : 10.1038/nm1204 . PMC 1351119 . PMID 15750600 .
Kuş, TD; Adem, Milletvekili; Ardinger, HH; Pagon, RA; Wallace, SE; Fasulye LJH; Stephens, K.; Amemiya, A. (1993). "Charcot–Marie–Tooth Nöropati Tip 2". PMID 20301462 . Alıntı günlüğü gerektirir |journal=( yardım )
Kıvılcımlar, SE; Quijano-Roy, S.; Harper, A.; Rutkowski, A.; Gordon, E.; Hoffman, EP; Pegoraro, E.; Adem, Milletvekili; Ardinger, HH; Pagon, RA; Wallace, SE; Fasulye LJH; Stephens, K.; Amemiya, A. (1993). "Konjenital Musküler Distrofiye Genel Bakış". PMID 20301468 . Alıntı günlüğü gerektirir |journal=( yardım )
Hershberger, RE; Morales, A.; Adem, Milletvekili; Ardinger, HH; Pagon, RA; Wallace, SE; Fasulye LJH; Stephens, K.; Amemiya, A. (1993). " LMNA ile İlgili Dilate Kardiyomiyopati". PMID 20301717 . Alıntı günlüğü gerektirir |journal=( yardım )
Pegoraro, E.; Hoffman, EP; Adem, Milletvekili; Ardinger, HH; Pagon, RA; Wallace, SE; Fasulye LJH; Stephens, K.; Amemiya, A. (1993). "Uzuv Kuşağı Müsküler Distrofisine Genel Bakış". PMID 20301582 . Alıntı günlüğü gerektirir |journal=( yardım )
Bonne, G.; Leturcq, F.; Ben Yaou, R.; Adem, Milletvekili; Ardinger, HH; Pagon, RA; Wallace, SE; Fasulye LJH; Stephens, K.; Amemiya, A. (1993). "Emery-Dreifuss Kas Distrofisi". PMID 20301609 . Alıntı günlüğü gerektirir |journal=( yardım )
Gordon, LB; Kahverengi, KT; Collins, FS; Adem, Milletvekili; Ardinger, HH; Pagon, RA; Wallace, SE; Fasulye LJH; Stephens, K.; Amemiya, A. (1993). "Hutchinson-Gilford Progeria Sendromu". PMID 20301300 . Alıntı günlüğü gerektirir |journal=( yardım )
Martin, B.; Smith RJH; Adem, Milletvekili; Ardinger, HH; Pagon, RA; Wallace, SE; Fasulye LJH; Stephens, K.; Amemiya, A. (1993). "Yoğun Mevduat Hastalığı/Membranoproliferatif Glomerülonefrit Tip II". PMID 20301598 . Alıntı günlüğü gerektirir |journal=( yardım )

Dış bağlantılar

İnsanda Çevrimiçi Mendel Kalıtımı (OMIM): Kardiyomiyopati, Genişletilmiş, 1A; CMD1A - 115200
İnsanda Çevrimiçi Mendel Kalıtımı (OMIM): LAMIN A/C; LMNA - 150330
LMNA+protein,+insan ABD Ulusal Tıp Kütüphanesinde Tıbbi Konu Başlıkları (MeSH)
LOVD mutasyon veritabanı: LMNA
LMNA için GeneCard'lar
Lay Public için Laminopati Bilgi Sitesi

Languages

In other projects