İnsan mitokondriyal DNA haplogroup - Human mitochondrial DNA haplogroup

26 popülasyondan 2.054 bireyin analizine dayanan çağdaş insan mtDNA haplogroup dağılımı. (a) Haritadaki pasta grafikler. (b) Tablo formatında haplogrupların sayıları. Popülasyon ayrıntıları için, bkz. 1000 Genom Projesi#İnsan genom örnekleri .

Olarak insan genetiği , bir insan mitokondriyal DNA haplogrouptarafından a, haplogrouptarafından içindeki farklar ile tanımlanan insan mitokondriyal DNA . Haplogruplar, mitokondriyal filogenetik ağaçtaki ana dal noktalarını temsil etmek için kullanılır. Dişi soyunun evrimsel yolunu anlamak, popülasyon genetikçilerinin modern insanın anasoylu mirasını Afrika'daki insan kökenlerine ve ardından dünyaya yayılmasına kadar takip etmelerine yardımcı oldu .

Haplogrupların (sadece mitokondriyal DNA haplogruplarının değil) harf isimleri A'dan Z'ye uzanır. Haplogruplar keşif sırasına göre isimlendirildiğinden, alfabetik sıralamanın gerçek genetik ilişkiler açısından bir anlamı yoktur.

Tüm bu grupların kökündeki varsayımsal kadın (yani sadece mitokondriyal DNA haplogrupları), şu anda yaşayan tüm insanlar için anasoylu en son ortak atadır (MRCA) . Genellikle Mitokondriyal Havva olarak adlandırılır .

Mitokondriyal DNA'nın mutasyona uğrama hızı, mitokondriyal moleküler saat olarak bilinir . 8000 yılda bir mutasyon bildiren bir çalışma ile devam eden bir araştırma alanıdır.

filogeni

mtDNA haplogroup ağacı ve dağılım haritası. Sayılar, http://www.phylotree.org/ terminolojisine göre rapor edilen haplogrup etiketleridir ve türetilmiş haplotipe yol açan mutasyonlardan birinin yerini verir. (Tercihen kodlama bölgesinden yalnızca tek bir dal tanımlayıcı işaret gösterilmektedir.) Haplogrup dağılımının ana coğrafi özellikleri renkle vurgulanmıştır.

İnsan mtDNA haplogruplarının dağılma yolu

Bu filogenetik ağaç, Van Oven'e (2009) dayanmaktadır.

L ( Mitokondriyal Havva )
- L0
- L1-6
  - L1
  - L2-6
    - L5
    - L2'3'4'6
      - L2
      - L3'4'6
        
        L6
        
        L3'4
        
        L4
        
        L3
        
        n
        
        N1 : ben
        
        N2 : W
        
        N9: E
        
        A
        
        S
        
        x
        
        r
        
        R0 (FMKA HV öncesi)
        YG : ( Y , V )
        
        JT öncesi veya R2'JT
        JT : ( J , T )
        
        R9: F
        
        R11'B: B
        
        P
        
        U (eski İngiltere )
        U8 : K
        
        Ö
        
        m
        
        M9: E
        
        M12'G: G
        
        M29'Q: S
        
        NS
        
        M8: CZ ( C , Z )

kronoloji

mtDNA haplogruplarına dayalı insan göçlerinin tahmini dünya haritası.

haplogrubu	Avustralya, Brezilya ve Kuzey Amerika ülkelerinin kullandığı saat uygulaması. menşe zamanı ( kya )	Olası menşe yeri
L	200
L1-6	170	Doğu Afrika
L2-6	150	Doğu Afrika
L0	150	Doğu Afrika
L1	140	Orta Afrika
L3-6	130
L5	120
L2	90
L3	70	Doğu Afrika
n	70	Doğu Afrika veya Batı Asya
m	60	Doğu Afrika, Batı Asya veya Güney Asya
r	60
sen	55	Kuzey-Doğu Afrika veya Hindistan (Güney Asya)
RT'JT	55	Orta Doğu
JT	50	Orta Doğu
U8	50	Batı Asya
R9	47
B4	44
F	43
U4'9	42	Orta Asya
U5	35	Batı Asya
U6	35	Kuzey Afrika
J	35
x	30
K	30
U5a	27
YG	27	Yakın Doğu
J1a	27	Yakın Doğu
T	27	Mezopotamya
K1	27
ben	26
J1	24	Yakın Doğu
W	20
U4	20	Orta Asya
X2	20
H	20	Batı Asya
U5a1	18	Avrupa
J1b	11
V	14
X2a	13	Kuzey Amerika
H1	12
H3	12
X1	10

Coğrafi dağılım

2004 tarihli bir makale, modern Avrupa popülasyonlarında en yaygın olan haplogrupların H, J, K, N1, T, U4, U5, V, X ve W olduğunu öne sürdü.

Afrika haplogrupları: L0, L1, L2, L3, L4, L5, L6, T, U5a

Avustralya haplogrupları: M42a, M42c, M14, M15, Q, S, O, N, P. (Refs 1, 2, 3, 4, 5, 6)

Asya haplogrupları: F, C, W, M, D, N, K, U, T, A, B, C, Z, U her bölüme birçok sayı varyantı

Ayrıca bakınız

Referanslar

^ Rishishwar L, Jordan IK (2017). "Mitokondriyal replasman tedavisi için insan evrimi ve karışımın etkileri" . BMC Genomik . 18 (1): 140. doi : 10.1186/s12864-017-3539-3 . PMC 5299762 . PMID 28178941 .
^ Loogvali, Eva-Liis; Kivisild, Toomas; Margus, Tonu; Villems, Richard (2009), O'Rourke, Dennis (ed.), "Explaining the Imperfection of the Molecular Clock of Hominid Mitokondri", PLOS ONE , 4 (12): e8260, Bibcode : 2009PLoSO...4.8260L , doi : 10.1371/journal.pone.0008260 , PMC 2794369 , PMID 20041137
^ Kivisild T (2015). "Bütün mitokondriyal genomlardan Anne soy ve nüfus tarihi" . Genet'i araştırın . 6 : 3. doi : 10.1186/s13323-015-0022-2 . PMC 4367903 . PMID 25798216 .
^ ^a ^b van Oven M, Kayser M (Şubat 2009). "Küresel insan mitokondriyal DNA varyasyonunun güncellenmiş kapsamlı filogenetik ağacı" . İnsan Mutasyonu . 30 (2): E386–94. doi : 10.1002/humu.20921 . PMID 18853457 . S2CID 27566749 .
^ "Arındırıcı Seçim için Düzeltme: Geliştirilmiş Bir İnsan Mitokondriyal Moleküler Saat Eki" (PDF) . 2009: 82-83 [89]. Orijinalinden (PDF) 2009-12-29 tarihinde arşivlendi . Alıntı günlüğü gerektirir |journal=( yardım )
^ Villems, Richard; Usanga, Esien; Mikerezi, İlya; Gölge, Mukaddes; Claustres, Mireille; Mihalodimitrakis, Emmanuel N.; Pappa, Kalliopi I.; Anagnou, Nicholas P.; Chaventre, Andre; Moisan, Jean-Paul; Richard, Christelle; Grechanina, Elena; Balanovska, Elena V.; Rudan, Pavao; Puzyrev, Valery; Stepanov, Vadim; Khusnutdinova, Elsa K.; Gusar, Vladislava; Balanovsky, Oleg P.; Peričić, Marijana; Baraç, Lovorka; Golubenko, Maria; Lunkina, Arina; Laos, Sirle; Pennarun, Erwan; Parik, Jüri; Tolk, Helle-Viivi; Reidla, Maere; Tambets, Kristiina; Metspalu, Ene; Kivisild, Toomas; Derenko, Miroslava V.; Malyarçuk, Boris A.; Roostal, Urmas; Loogväli, Eva-Liis (1 Kasım 2004). "Bölünmüş Tekdüzelik: Avrasya'da mtDNA Haplogroup H'nin Alacalı Kladistik Tuvali" . Moleküler Biyoloji ve Evrim . 21 (11): 2012–2021. doi : 10.1093/molbev/msh209 . PMID 15254257 – Academic.oup.com aracılığıyla.