HLA-DQ6 - HLA-DQ6

HLA-DQ6
( MHC Sınıf II , DQ hücre yüzey antijeni)
DQ İllüstrasyon.PNG
HLA-DQ'nun bağlı peptit ile gösterimi
Cis haplotip Haplotip
izoform alt tür DQA1 DQB1
DQ α 1.3 β 6.1 DQ6.1 * 0103 * 0601
DQ α 1.2 β 6.2 DQ6.2 * 0102 * 0602
DQ α 1.3 β 6.3 DQ6.3 * 0103 * 0603
DQ α 1.2 β 6.4 DQ6.4 * 0102 * 0604
nadir haplotipler
DQ α 1.2 β 6.3 DQ6.3v * 0102 * 0603
DQ α 1.3 β 6.2 DQ6.2v * 0103 * 0602
DQ α 1,2 β 6,9 DQ6.9 * 0102 * 0609


HLA-DQ6 (DQ6), HLA-DQ  (DQ) serotip grubu içinde bir insan lökosit antijen serotipidir . Serotip, DQ p-zincirlerinin β 6 alt kümesinin antikor tanıması ile belirlenir . DQ ve β-zinciri izoformları tarafından kodlanan HLA-DQB1 lokusu ve DQ6 HLA-DQB1 tarafından kodlanır * 06 alel grubu. Bu grup şu anda birçok yaygın alel içerir, DQB1 * 0602 en yaygın olanıdır. HLA-DQ6 ve DQB1 * 06 neredeyse anlam olarak eşanlamlıdır. DQ6 β zincirleri, cis - haplotip izoformlarını oluşturmak için genetik olarak bağlı HLA-DQA1 alelleri tarafından kodlanan α zincirleriyle birleşir . Bununla birlikte, DQ6 için, cis-izoform eşleşmesi yalnızca DQ1 a-zincirleri ile gerçekleşir. DQ6'nın birçok haplotipi vardır.

Seroloji

Bazı DQB1 * allellerinin DQ6, DQ1 ve DQ5 tarafından tanınması
DQ6 DQ1 DQ5 N
alel % % % boyut (N)
* 0601 64 23 675
* 0602 67 30 1 5151
* 0603 62 23 2 2807
* 0604 59 27 2 1592
* 0605 76 13 358
* 0609 48 32 3 149

Aleller

HLA DQB1 * 0601 frekansları
frekans
ref. Nüfus (%)
Indig. Avustralya Cape York 31.3
Indig. Avustralyalı Kimberly 30.5
Nauru 28.4
Fiji Viti Levu 26.3
Hindistan Bombay 26.3
Papua Yeni Gine Ovası 26.0
Çin Guizhou Prov. Miao 25.9
Papua Yeni Gine Madang 23.1
Kiribati 22.6
Japonya 22.0
Endonezya Nusa Tenggara 19.2
Hindistan Kuzey Hinduları 18.7
Japonya Hokkaido Wajin 17.0
Uttar Pradesh Hindu 15.1
PNG Ova Wosera 14.1
Batı Samoa ve Tokelau 13.7
Pakistan Kalash 13.0
Hindistan Lucknow 12.9
Çin Wuhan 12.8
Güney Kore (4) 11.4
PNG Highland 10.9
Hindistan Delhi 9.0
İran Beluc 8.0
Moğolistan Khalkha 5.5
Lübnan Yuhmur 4.3
Tunus Ghannouch 4.3
Polonya Wielkopolska 4.0
Meksika Mazatecans 3.5
İspanya E. Endülüs 2.0
İtalya Merkez 1.9
Fransa Güney Doğu 1.6
İngiltere Caucasoid 1.1
İrlanda Güney 0.2
İtalya Sardunya 0.1
Brezilya Guarani Kaiowa 0.0
Kamerun Saa 0.0

DQB1 * 0601

DQB1 * 0601 genel olarak DQA1 * 0103'e 6.1 haplotip olarak bağlıdır. Bu haplotip, Japonya'da ve Doğu Asya'nın diğer bölgelerinde daha yaygındır.

HLA DQB1 * 0602 frekansları
frekans
ref. Nüfus (%)
İspanya Pas Vadisi 31.5
Kamerun Saa 30.8
Kongo Kinşasa Bantu 30.0
PNG E. Highlands Goroka 29.8
Sibirya Ket Aşağı Yenisey 29.4
İspanya Kuzey Cabuernigo 28.9
Rusya Arkhangelsk Pomors 24.7
İspanya Kuzey Cantabrian 24.7
İrlanda Güney 19.6
Belçikalı (2) 19.4
Sibirya Kushun Buryat 18.0
Finlandiya 17.1
Sibirya Kets Sulamai Köyü 17.0
Polonya Wielkopolska 16.9
Almanca Essen 16.7
Sp. Bask Arratia Vadisi 16.7
Danimarka 16.6
Fransa Ceph 15.7
Kenya 14.6
İngiltere Caucasoid 14.4
İsveç 14.1
Fransa Rennes 13.8
Tunus Matmata Berber 11.7
Ürdün Amman 10.7
Japonya Hokkaido Wajin 10.0
Suudi A. Guraiat ve Hail 8.4
Japonya Merkez 8.2
Nauru 8.2
Gürcistan Svaneti Svans 8.1
Fransa Güney Doğu 8.0
Etiyopya Amhara 7.7
Cezayir Oran 7.6
Slovenya 7.5
Güney Kore (1) 7.4
Japonya Fukuoka 6.4
Pakistan Kalash 5.8
Çin Xinjiang Uygur 5.4
Papua Yeni Gine Ovası 5.2
Moğolistan Khalkh Ulaanbaatar 4.9
İspanya Murcia 4.8
Hindistan Bombay 4.2
Japonya 4.0
Yunanistan (2) 3.3
İsrail Arapları 2.3
Vietnam Hanoi Kinh 2.0
İsrail Yahudileri 1.5
Moğolistan Khoton Tarialan 1.2
ABD Alaska Yupik Yerlileri 0.8
Meksika Mixtec Oaxaca 0.5
İtalya Sardunya pop2 0.1

DQB1 * 0602

DQB1 * 0602, 6.2 haplotip oluşturmak için genellikle DQA1 * 0102'ye bağlanır . DQ6.2 ve Orta Asya'dan Batı Avrupa'ya kadar yaygındır, * 0602 ayrıca Asya'nın bazı kısımlarında DQA1 * 0103 ile bağlantılıdır.

HLA DQB1 * 0603 frekansları
frekans
ref. Nüfus (%)
Gürcistan Svaneti Svans 14.4
Fransa Batı 11.0
Hollanda 10.6
Almanca Essen 9.2
Çek Cumhuriyeti 9.0
İspanya Murcia 8.7
Slovakya 8.4
Danimarka 8.3
Hindistan Lucknow 8.3
Ürdün Amman 8.3
Fransa Rennes 8.1
Polonya Wielkopolska 8.0
Suudi Arabistan Guraiat ve Hail 8.0
Tunus Jerba Berber 7.8
Uganda Muganda Baganda 7.4
İspanya Kuzey Cantabrian 7.2
Finlandiya 7.1
Fransa Güney 6.9
Çin Xinjiang Uygur 6.5
Rusya Kuzeybatı Slav 6.0
İrlanda Donegal 5.3
Yunanistan (3) 5.2
İrlanda Kuzey (2) 4.9
İtalya Roma 4.0
ARABA Aka Pigmeler 3.6
Lübnan Kafar Zubian 3.2
İsveç 2.5
Tayland 2.1
Çin Wuhan 1.7
Japonya (2) 1.0
Güney Kore (3) 0.9
Malezya 0.6

DQB1 * 0603

DQB1 * 0603, genellikle DQA1 * 0103 ile 6.3 olarak bağlantılıdır ve Orta Asya'dan Batı Avrupa'ya kadar yaygındır, * 0603 ayrıca Asya'nın bazı kısımlarında DQA1 * 0102 ile bağlantılıdır. Avrupa'da en çok Hollanda'da yaygındır.

HLA DQB1 * 0604 frekansları
frekans
ref. Nüfus (%)
Etiyopya Amhara 10.7
Ruanda Kigali Hutu ve Tutsi 10.7
Etiyopya Oromo 10.2
Japonya 8.0
Suudi Arabistan Guraiat ve Hail 8.0
İran Yazd Zerdüştler 6.9
ARABA Aka Pigmeler 6.5
Güney Kore (2) 6.5
İsveç 6.1
Hollanda 5.6
Uganda Muganda Baganda 5.3
Lübnan Niha el Shouff 4.9
Danimarka 4.6
Fransa Rennes 4.6
İsrail Gazze Filistinliler 3.9
Çin Xinjiang Uygur 3.8
Cezayir1 3.5
Rusya Kuzeybatı Slav 3.5
İngiltere Caucasoid 3.1
Almanca Essen 2.6
Çek Cumhuriyeti 2.4
Yunanistan 2.0
Hindistan Delhi 1.8
Nauru 1.5
Finlandiya 1.4
Gambiya 0.7

DQB1 * 0604

DQB1 * 0604, Afrika ve Asya'nın bazı bölgelerinde daha yüksek frekanslarda bulunur ve neredeyse yalnızca DQA1 * 0102 ile 6.4 olarak bağlantılıdır . Bu haplotip, Japonya'daki en yüksek Avrasya frekanslarında bulunur.

HLA DQB1 * 0609 frekansları
frekans
ref. Nüfus (%)
Ruanda Kigali Hutu ve Tutsi 5.7
Kenya 5.3
Uganda Muganda Baganda 5.3
Kongo Kinşasa Bantu 4.4
Gambiya 4.4
Moğolistan Tsaatan 4.2
Güney Kore (3) 3.7
Kamerun Saa 3.5
Slovenya 3.0
Tunus 3.0
Zimbabve Harare Shona 2.2
Vietnam Hanoi Kinh 2.0
Hollanda 1.7
Suudi Arabistan Guraiat ve Hail 1.6
Cezayir Oran 1.5
Yunanistan (2) 1.2
Tayland (2) 1.2
Tunus Matmata Berber 1.2
İtalya Roma 1.0
İspanya Granada 0.7
İtalya Bergamo 0.6
İrlanda Güney 0.2
Çin Ürümqi Uygur 0.0
ABD Alaska Yupik Yerlileri 0.0

DQB1 * 0609

DQB1 * 0609, Afrika'da ve Avrasya'nın yakın bölgelerinde bulunur.

Haplotipler ve hastalık

Leptospirosis enfeksiyonuna duyarlılık , farklılaşmamış DQ6 ile ilişkili bulundu. DQ6 ise, birincil sklerozan kolanjitte ölüme (veya karaciğer nakli ihtiyacına) karşı koruyucuydu .

DQ6.1

DQA1 * 0103: DQB1 * 0601 (DQ6.1), Asya'da artan frekanslarda bulunur ve Batı Avrupa'da neredeyse yoktur. Bu koruma sağlayan narkolepsi , genç tipi diyabet , Vogt-Koyanagi-Harada (VKH) sendromu, pemfigus vulgaris , multipl skleroz , miyasteni gravis .

DQ6.2

DQ6.2 (DQA1 * 0102  : DQB1 * 0602 ) genellikle DR15'e bağlıdır ve bu nedenle HLA B7-DR15-DQ6 haplotipinin bir parçasıdır . Bu haplotip, 4.7 milyondan fazla nükleotidi kapsadığı için insan genomunda bilinen en uzun multigen haplotip olarak kabul edilir. DR15-DQ6.2 haplotipi, Avrupa'da en yaygın DR-DQ haplotipidir ve Amerikalıların yaklaşık% 30'u en az DQ6.2 taşır. Haplotip Orta Asya'da daha da yaygındır.

DQ6.2 hastalıkla ilişkiler

İçin myastenia gravis , AChR'ye tanınması α34-49 DQ6.2 artmıştır. DQA1 * 0102 rahim ağzı kanseri riskini artırır . Gelen multipl skleroz DQA1 * 0102 En sık allel oldu ve DQB1 * 0602 MS hastalarında önemli ölçüde artmıştır.

DQ6.2'nin koruyucu etkileri

Olarak primer biliyer siroz DQ6.2 hastalığı olan negatif bir ilişki var gibi görünmektedir. DQ6.2'nin ayrıca genç diyabette koruyucu bir etkisi olduğu görülmektedir . DQ6.2 ayrıca mestizolardaki infantil spazmlara karşı koruyucudur.

DQ6.3

DQ6.3 (DQA1 * 0103  : DQB1 * 0603 ) kuzey-merkez Avrupa'da orta frekanslarda bulunur, birçok otoimmün hastalığa karşı koruyucudur. Aynı zamanda HIV enfeksiyonuna karşı bir miktar koruma sağlar.

DQ6.4

DQ6.4 (DQA1 * 0102  : DQB1 * 0604 ) timoma kaynaklı miyastenia gravis ile ilişkili olabilir.

Referanslar