HLA-C - HLA-C

HLA-C
Mevcut yapılar
PDB	İnsan UniProt arama: PDBe RCSB
PDB kimlik kodlarının listesi
	3BZF ,%%s 4NT6 ,%%s 1EFX ,%%s 1IM9 , 1QQD
tanımlayıcılar
takma adlar	HLA-C , D6S204, HLA-JY3, HLC-C, PSORS1, majör doku uyumluluk kompleksi, sınıf I, C, MHC
Harici kimlikler	OMIM : 142840 HomoloGene : 133080 GeneCards : HLA-C
Gen konumu ( İnsan )
Chr.	Kromozom 6 (insan)
Son	31,272.130 baz puan
RNA ifade modeli
	Daha fazla referans ifade verisi
Gen ontolojisi
moleküler fonksiyon	• peptit antijen bağlanması ; • GO:0001948 protein bağlanması;
Hücresel bileşen	• zarın ayrılmaz bileşeni ; • fagositik kesecik zarı ; • Golgi aygıtı ; • erken endozom zarı ; • zar ; • Golgi zarı ; • plazma zarı ; • hücre yüzeyi ; • endoplazmik retikulum ; • MHC sınıf I protein kompleksi ; • ER'den Golgi'ye taşıma kesecik zarı ; • lümen tarafının ayrılmaz bileşeni endoplazmik retikulum zarı ; • hücre dışı eksozom ; • salgı granül zarı ; • geri dönüşüm endozom zarı;
biyolojik süreç	• antijen işleme ve sunumu ; • antijen işleme ve eksojen peptit antijeninin MHC sınıf I yoluyla sunumu, TAP'ye bağlı ; • bağışıklık sistemi süreci ; • interferon-gama aracılı sinyal yolu ; • antijen işleme ve MHC sınıf I yoluyla peptit antijeninin sunumu ; • antijen işleme ve eksojen peptit antijeninin MHC sınıf I yoluyla sunumu, TAP'den bağımsız ; • tip I interferon sinyal yolu ; • immün yanıt ; • immün yanıtın düzenlenmesi ; • GO:0022415 viral süreç ; • nötrofil degranülasyonu;
	Kaynaklar: Amigo / QuickGO
ortologlar
	3107
	n/a
ENSG00000204525 ; ENSG00000233841 ; ENSG0000228299 ; ENSG0000225691 ; ENSG00000206435;
	ENSG00000237022 ; ENSG0000206452
	n/a
	P10321
	n/a
	NM_002117 ; NM_001243042
	n/a
	NP_001229971 ; NP_002108
	n/a
	Vikiveri
İnsan Görüntüle/Düzenle

HLA-C , MHC (insan = HLA) sınıf I ağır zincir reseptörlerine aittir . C reseptörü, bir HLA-C olgun gen ürünü ve β2-mikroglobulinden oluşan bir heterodimerdir . Olgun C zinciri zara sabitlenmiştir. HLA-C gibi MHC Sınıf I molekülleri hemen hemen tüm hücrelerde eksprese edilir ve kendi kendine olmayan peptitleri araştıran bağışıklık sistemine küçük peptitler sunar.

HLA-C, Sınıf I MHC reseptörleri olan birçok HLA-C alelini kodlayan kromozom 6 üzerinde bir lokustur. HLA-B lokusunun proksimalinde lokalize olan HLA-C, HLA bölgesinin distal ucunda yer alır. HLA-C:B haplotiplerinin çoğu güçlü bağlantı dengesizliği içindedir ve çoğu insan türünün kendisi kadar eskidir.

Hastalık dernekleri

by serotip

Cw1: multinodüler guatrlar

by alleli

C*16: B kronik lenfositik lösemi

isimlendirme

C*01

Cw1 serotipi: C*01:02 ve C*01:09
Cw11
C*01:04 - *01:08

C*02

Cw2 serotipi: C*02:02 ve *02:08
C*02:03 - *02:07 ve 02:09

C*03

Cw9 serotipi: C*03:03
Cw10 serotipi: C*03:02, *03:04 ve *03:06
Cw3 serotipi: C*03:07
C*03:05 ve 03:08

C*04

Cw4 serotipi: C*0401, *0407 ve *0410

C*05

Cw5 serotipi: C*05:01 ve *05:02
C*05:03 ila *05:06 ve *05:08 ila *05:10

C*06

Cw6 serotipi: C*06:02 ve *06:05
C*06:03, *06:04 ve *06:06 - *06:11
Cw7 serotipi: C*07:01 ila *07:06, *07:12, *07:14, *07:16
C*07:07 - *07:11, *07:13, *07:15 ve *07:17 - *07:29

C*08

Cw8 serotipi: C*08:01, *08:02 ve *08:03
C*08:05 ila *08:12

Diğerleri

C*12:02 ile *12:15 arası
C*14:02 ila *14:05
C*15:01 ila *15:11
C*16:01 ila *16:06
C*17:01 ila *17:03
C*18:01 ve *18:02

Ortak haplotip

Cw4-B35 (Batı Afrika'dan Yerli Amerikalılara) Cw7-B7 (Batı Avrasya, Güney Afrika) Cw7-B8 (Batı Avrasya) Cw1-B46 (Çin, Çinhindi) Cw5-B44 (Batı Avrasya)

Etkileşimler

HLA-C'nin aşağıdakilerle etkileşime girdiği gösterilmiştir :

KIR2DL1 ,
LILRA3
Lökosit immünoglobulin benzeri reseptör ailesi, özellikle aktive edici LILRA1 reseptörü

Referanslar

daha fazla okuma

Geyer M, Fackler OT, Peterlin BM (2001). "HIV-1 Nef'te yapı-fonksiyon ilişkileri" . EMBO Rep . 2 (7): 580–5. doi : 10.1093/embo-reports/kve141 . PMC 1083955 . PMID 11463741 .
Greenway AL, Holloway G, McPhee DA, Ellis P, Cornall A, Lidman M (2004). "Hücre sinyal moleküllerinin HIV-1 Nef kontrolü: virüs replikasyonunu teşvik etmek için çoklu stratejiler". J. Biosci . 28 (3): 323–35. doi : 10.1007/BF02970151 . PMID 12734410 . S2CID 33749514 .
Benichou S, Benmerah A (2003). "[HIV nef ve Kaposi-sarkomla ilişkili virüs K3/K5 proteinleri: endositoz yolunun "parazitleri"]" . Med Sci (Paris) . 19 (1): 100–6. doi : 10.1051/medsci/2003191100 . PMID 12836198 .
Leavitt SA, SchOn A, Klein JC, Manjappara U, Chaiken IM, Freire E (2004). "Hücresel ortakları ile HIV-1 proteinleri gp120 ve Nef Etkileşimleri yeni bir allosterik paradigma tanımlar". Kör. Protein Pepti. Sci . 5 (1): 1–8. doi : 10.2174/1389203043486955 . PMID 14965316 .
Tolstrup M, Ostergaard L, Laursen AL, Pedersen SF, Duch M (2004). "Bağışıklık gözetiminden HIV/SIV kaçışı: Nef'e odaklanın". Kör. HIV Araş . 2 (2): 141–51. doi : 10.2174/1570162043484924 . PMID 15078178 .
Joseph AM, Kumar M, Mitra D (2005). "Nef: HIV enfeksiyonunda "gerekli ve zorlayıcı faktör". Kör. HIV Araş . 3 (1): 87–94. doi : 10.2174/15701162052773013 . PMID 15638726 .
Anderson JL, Umut TJ (2005). "HIV aksesuar proteinleri ve konakçı hücrenin hayatta kalması". Güncel HIV/AIDS Raporları . 1 (1): 47–53. doi : 10.1007/s11904-004-0007-x . PMID 16091223 . S2CID 34731265 .

Languages

In other projects