GNMT - GNMT

GNMT
Mevcut yapılar
PDB	Ortologtur arama: PDBe RCSB
PDB kimlik kodlarının listesi
	1R74 , 2AZT
tanımlayıcılar
takma adlar	GNMT , HEL-S-182mP, glisin N-metiltransferaz
Harici kimlikler	OMIM : 606628 MGI : 1202304 HomoloGene : 7741 GeneCards : GNMT
Gen konumu ( İnsan )
Chr.	Kromozom 6 (insan)
Son	42.963.880 baz puan
Gen konumu ( Fare )
Chr.	Kromozom 17 (fare)
Son	46.729.168 baz puan
RNA ifade modeli
	Daha fazla referans ifade verisi
Gen ontolojisi
moleküler fonksiyon	• metiltransferaz aktivitesi ; • transferaz aktivitesi ; • folik asit bağlanması ; • GO:0001948 protein bağlanması ; • glisin bağlanması ; • glisin N-metiltransferaz aktivitesi ; • özdeş protein bağlanması ; • S-adenosil-L-metionin bağlanması;
Hücresel bileşen	• sitoplazma ; • sitozol;
biyolojik süreç	• glikojen metabolik süreç ; • glukoneogenezin düzenlenmesi ; • metiyonin metabolik süreç ; • metilasyon ; • S-adenosilmetiyonin metabolik süreç ; • hücresel protein modifikasyon süreci ; • tek karbonlu metabolik süreç ; • protein homotetramerizasyonu ; • hücresel nitrojen bileşiği metabolik süreç ; • S-adenosilhomosistein metabolik süreç ; • sarkozin metabolik süreç;
	Kaynaklar: Amigo / QuickGO
ortologlar
	27232
	14711
	ENSG00000124713
	ENSMUSG00000002769
	Q14749
	Q9QXF8
	NM_018960 ; NM_001318865
	NM_010321 ; NM_001364890
	NP_001305794 ; NP_061833
	NP_034451 ; NP_001351819
	Vikiveri
İnsan Görüntüle/Düzenle	Fareyi Görüntüle/Düzenle

Glisin N-metiltransferaz , insanlarda GNMT geni tarafından kodlanan bir enzimdir .

keşif

Enzim ilk olarak Blumenstein ve Williams (1960) tarafından kobay karaciğerinde tanımlanmıştır. Ancak bu enzim 1972 yılına kadar Kerr tarafından tavşan karaciğerinde saflaştırılmamıştır. 1984 yılında Cook ve Wagner, bir karaciğer sitozolik folat bağlayıcı proteinin GNMT ile aynı olduğunu gösterdi. İnsan GMNT geni 2000 yılında Chen ve çalışma arkadaşları tarafından klonlandı.

Doku dağılımı

GNMT, karaciğer sitozolünde bol miktarda bulunan bir enzimdir ve karaciğerde bulunan çözünür proteinin %0,9 ila %3'ünden oluşur. Karaciğere ek olarak, GNMT aktivitesi pankreas ve böbrek dahil olmak üzere bir dizi başka dokuda bulunmuştur. GNMT en çok karaciğerin periportal bölgesinde ve pankreasın ekzokrin dokusunda bol miktarda bulunur. Proksimal böbrek tübülleri, submaksiller bezler ve bağırsak mukozası gibi aktif olarak salgılanan dokularda bulunan GNMT proteinleri. GNMT ayrıca serebral korteks, hipokampus, substantia nigra ve serebellumda sunulan çeşitli nöronlarda da eksprese edilir. Bu hücrelerde GNMT'nin varlığı, bu enzimin salgılamada rol oynayabileceğini düşündürmektedir.

Yapı

Karaciğer/pankreastan saflaştırılmış veya Escherichia coli'de eksprese edilmiş tavşanlardan, sıçanlardan ve insanlardan alınan GNMT proteininin özellikleri iyi karakterize edilmiştir. Tüm GNMT'ler çok benzer moleküler ve kinetik özelliklere sahiptir. İnsan, tavşan, domuz ve sıçan GNMT'lerinin cDNA ve protein dizilerinin karşılaştırılması, nükleotid düzeyinde %84'ün üzerinde ve amino asit düzeyinde yaklaşık %90'lık benzerlikler göstermektedir. Tüm GNMT'ler, her biri 32 kDa Mr'a sahip dört özdeş alt birimden oluşan 130 kDa tetramerlerdir. Rekombinant sıçan, fare ve insan GNMT'lerinin yapısı çözüldü. Dört neredeyse küresel alt birim, merkezinde büyük bir delik bulunan düz ve kare bir tetramer oluşturacak şekilde düzenlenmiştir. Aktif siteler, her alt birimin yakın merkezinde bulunur.

İşlev

Glisin N-metiltransferaz , metil donörü olarak S-adenosilmetiyonin(SAM) (AdoMet) kullanılarak glisin'den N-metilglisin ( sarkozin ) sentezini katalize eder . GNMT, S-adenosilmetiyonin(SAM)'in S-adenosilhomosisteine (SAH) (AdoHcy) oranını düzenleyen bir enzim görevi görür ve karaciğer hücrelerinde detoksifikasyon yoluna katılır. GNMT, SAM için tRNA metiltransferazlarla rekabet eder ve ürün olan S-adenosilhomosistein (SAH), tRNA metiltransferazların güçlü bir inhibitörü ve nispeten zayıf bir GNMT inhibitörüdür. GNMT, SAM ve SAH'ın göreceli seviyelerini düzenler. SAM, hemen hemen tüm hücresel metilasyon reaksiyonları için metil donörü olduğundan. Bu nedenle GNMT'nin hücresel metilasyon kapasitesini düzenlemesi muhtemeldir. GNMT'nin endojen bir ligandı olan 5-metiltetrahidropteroylpentaglutamat (5-CH3-H4PteGIu5) bu enzimin güçlü bir inhibitörüdür. Bu nedenle, GNMT'nin metil gruplarının de novo sentezini SAM'ın SAH'a oranına bağlaması önerilmiştir, bu da metionin ve tek karbon metabolizması arasında bir köprü görevi görür.

Metiltransferaz aktivitesine ek olarak, 4S polisiklik aromatik hidrokarbon (PAH) bağlayıcı protein ve GNMT bir ve aynı proteindir. Katalitik bölge, diğer SAM'a bağlı metiltransferazların çoğundan farklı olarak moleküler bir sepete benzer, bu nedenle GNMT'nin bir detoksifikasyon işleminin bir parçası olarak tanımlanamayan kimyasalları yakalayabildiğini düşündürür. Bu nedenle, GNMT'nin çeşitli işlevselliğe sahip bir protein olduğu öne sürülmüştür.

Klinik önemi

GNMT'nin poliaromatik hidrokarbonlar ve aflatoksin gibi bazı çevresel kanserojenleri detoksifiye ettiği gösterilmiştir .

GNMT eksikliğinin karaciğer karsinogenezinde rol oynadığını destekleyen artan kanıtlar vardır.

indükleyici

Glikozit izole doğal ürün 1,2,3,4,6-penta-O-galloil-β-D-glukopiranosid (PGG) Paeonia lactiflora , Asya çiçek bitki, GNMT indükler mRNA ve protein ifadesi Huh7 insan hepatoma hücreleri.

Referanslar

daha fazla okuma

Chen M, Huang YL, Huang YC, Shui IM, Giovannucci E, Chen YC, Chen YM (Mayıs 2014). "Sağlık profesyonellerinin takip çalışmasında glisin N-metiltransferazın genetik polimorfizmleri ve prostat kanseri riski" . PLOS BİR . 9 (5): e94683. Bibcode : 2014PLoSO...994683C . doi : 10.1371/journal.pone.0094683 . PMC 4011739 . PMID 24800880 .
Chou WY, Zhao JF, Chen YM, Lee KI, Su KH, Shyue SK, Lee TS (Mart 2014). "Deneysel ülseratif kolitte glisin N-metiltransferazın rolü". Gastroenteroloji ve Hepatoloji Dergisi . 29 (3): 494-501. doi : 10.1111/jgh.12434 . PMID 24219143 . S2CID 22074228 .
Wang YC, Lin WL, Lin YJ, Tang FY, Chen YM, Chiang EP (Şubat 2014). "DNA hasarına karşı hücresel savunmada tümör baskılayıcı GNMT'nin yeni bir rolü" . Uluslararası Kanser Dergisi . 134 (4): 799-810. doi : 10.1002/ijc.28420 . PMID 23922098 . S2CID 24507645 .
Chen YM, Liao YJ (Temmuz 2013). "Fare karaciğerinde GNMT'nin fosforillenmiş formları". Proteomik Dergisi . 87 : 132–3. doi : 10.1016/j.jprot.2013.01.007 . PMID 23340451 .
Chen CY, Ching LC, Liao YJ, Yu YB, Tsou CY, Shyue SK, Chen YM, Lee TS (Temmuz 2012). "Glisin N-metiltransferaz eksikliği, apolipoprotein E-boş farelerde aterosklerozu şiddetlendirir" . Moleküler Tıp . 18 (5): 744–52. doi : 10.2119/molmed.2011.00396 . PMC 3409278 . PMID 22415010 .
Liao YJ, Chen TL, Lee TS, Wang HA, Wang CK, Liao LY, Liu RS, Huang SF, Chen YM (Mayıs 2012). "Glisin N-metiltransferaz eksikliği, Niemann-Pick tip C2 protein stabilitesini etkiler ve hepatik kolesterol homeostazını düzenler" . Moleküler Tıp . 18 (3): 412–22. doi : 10.2119/molmed.2011.00258 . PMC 3356423 . PMID 22183894 .
Chen M, Ho CW, Huang YC, Wu KY, Wu MT, Jeng HA, Chen CJ, Shih TS, Lai CH, Pan CH, Chen YM (Temmuz 2011). "Glisin N-metiltransferaz, PAH maruziyetinden sonra idrar 1-hidroksipiren ve 8-hidroksi-2'-deoksiguanozin seviyelerini etkiler". Mesleki ve Çevre Tıbbı Dergisi . 53 (7): 812–9. doi : 10.1097/JOM.0b013e318222b79a . PMID 21691217 . S2CID 205722774 .
Wang YC, Tang FY, Chen SY, Chen YM, Chiang EP (Mayıs 2011). "HepG2 hücrelerinde glisin-N metiltransferaz ekspresyonu, transmetilasyon kinetiğini ve DNA metilasyonunu düzenleyerek metil grubu homeostazında yer alır" . Beslenme Dergisi . 141 (5): 777-82. doi : 10.3945/jn.110.135954 . PMID 21411609 .
Wang YC, Chen YM, Lin YJ, Liu SP, Chiang EP (Mayıs-Haziran 2011). "GNMT ekspresyonu hepatik folat içeriğini ve folata bağımlı metionin sentaz aracılı homosistein remetilasyonunu arttırır" . Moleküler Tıp . 17 (5–6): 486–94. doi : 10.2119/molmed.2010.0243 . PMC 3105148 . PMID 21210071 .
Liao YJ, Chen KH, Huang SF, Chen TL, Wang CK, Chien CH, Tsai TF, Liu SP, Chen YM (Nisan 2010). "Glisin N-metiltransferaz eksikliği, fare karaciğerinde hücresel savunmanın strese karşı bozulmasına neden olur". Proteomik: Klinik Uygulamalar . 4 (4): 394–406. doi : 10.1002/prca.200900074 . PMID 21137059 . S2CID 8638838 .
Tsai MJ, Chen YM, Weng CF, Liou DY, Yang HC, Chen CH, Liao RI, Kuo FS, Chiu CW, Kuo HS, Huang MC, Lin YL, Lee MJ, Kuo WC, Huang WC, Cheng H (Haziran 2010) ). "CNS kültüründe adenovirüs aracılı gen transferi ile glisin N-metiltransferazın geliştirilmiş ifadesi nöroprotektiftir". New York Bilimler Akademisi'nin Annals . 1199 (1): 194-203. Bibcode : 2010NYASA1199..194T . doi : 10.1111/j.1749-6632.2009.05169.x . PMID 20633125 . S2CID 20120622 .
Chen YM, Liao YJ, Liu SP, Tsai TF (Haziran 2009). "Hepatoselüler karsinom için iki Gnmt-/- fare modeli arasındaki fenotipik farklılıklar" . Hepatoloji . 49 (6): 2130–1, yazar yanıtı 2131. doi : 10.1002/hep.22984 . PMID 19475685 . S2CID 205869970 .
Lee CM, Shih YP, Wu CH, Chen YM (Ağustos 2009). "İnsan Glisin N-metiltransferaz geninin 5' düzenleyici bölgesinin karakterizasyonu". gen . 443 (1–2): 151–7. doi : 10.1016/j.gene.2009.05.001 . PMID 19439180 .
Huang YC, Chen M, Shyr YM, Su CH, Chen CK, Li AF, Ho DM, Chen YM (Eylül 2008). "Glisin N-metiltransferaz, insan kolanjiokarsinomu için uygun bir prognostik belirteçtir". Gastroenteroloji ve Hepatoloji Dergisi . 23 (9): 1384–9. doi : 10.1111/j.1440-1746.2008.05488.x . PMID 18624901 . S2CID 24227544 .
Huang YC, Lee CM, Chen M, Chung MY, Chang YH, Huang WJ, Ho DM, Pan CC, Wu TT, Yang S, Lin MW, Hsieh JT, Chen YM (Mart 2007). "Prostat kanserinde haplotipler, heterozigotluk kaybı ve glisin N-metiltransferaz ekspresyon seviyeleri" . Klinik Kanser Araştırması . 13 (5): 1412–20. doi : 10.1158/1078-0432.CCR-06-1551 . PMID 17332283 .
Lee CM, Chen SY, Lee YC, Huang CY, Chen YM (Temmuz 2006). "Benzo[a]piren ve glisin N-metiltransfer etkileşimleri: karaciğer detoksifikasyon yolunun gen ekspresyon profilleri". Toksikoloji ve Uygulamalı Farmakoloji . 214 (2): 126–35. doi : 10.1016/j.taap.2005.12.020 . PMID 16545412 .
Chen SY, Lin JR, Darbha R, Lin P, Liu TY, Chen YM (Mayıs 2004). "Benzo(a)piren-detoksifikasyon yolundaki Glisin N-metiltransferaz tümör duyarlılığı geni" . Kanser Araştırması . 64 (10): 3617–23. doi : 10.1158/0008-5472.CAN-03-3726 . PMID 15150120 .
Liu HH, Chen KH, Shih YP, Lui WY, Wong FH, Chen YM (Ocak-Şubat 2003). "İki yeni geliştirilmiş monoklonal antikor kullanılarak kanserli karaciğer dokularında glisin N-metiltransferazın azaltılmış ekspresyonunun karakterizasyonu". Biyomedikal Bilim Dergisi . 10 (1): 87–97. doi : 10.1007/BF02256001 . PMID 12566990 .
Tseng TL, Shih YP, Huang YC, Wang CK, Chen PH, Chang JG, Yeh KT, Chen YM, Buetow KH (Şubat 2003). "Karaciğer kanserinde varsayılan bir tümör duyarlılık geni, GNMT'nin genotipik ve fenotipik karakterizasyonu". Kanser Araştırması . 63 (3): 647–54. PMID 12566309 .
Lee CM, Yen CH, Tzeng TY, Huang YZ, Chou KH, Chang TJ, Arthur Chen YM (Eylül 2013). "Glisin N-metiltransferaz geninin androjen yanıt elemanı, ilk eksonunun kodlama bölgesinde bulunur" . Biyobilim Raporları . 33 (5): 761–769. doi : 10.1042/BSR20130030 . PMC 3775523 . PMID 23883094 .
Li CH, Lin MH, Chu SH, Tu PH, Fang CC, Yen CH, Liang PI, Huang JC, Su YC, Sytwu HK, Chen YM (Mart 2015). "Deneysel otoimmün ensefalomiyelitte T-hücre yanıtlarının düzenlenmesinde glisin N-metiltransferazın rolü" . Moleküler Tıp . 20 : 684-96. doi : 10.2119/molmed.2014.00133 . PMC 4398670 . PMID 25535034 .
Yen CH, Hung JH, Ueng YF, Liu SP, Chen SY, Liu HH, Chou TY, Tsai TF, Darbha R, Hsieh LL, Chen YM (Mart 2009). "Glisin N-metiltransferaz, aflatoksin B1'in metabolizmasını etkiler ve kanserojen etkisini bloke eder". Toksikoloji ve Uygulamalı Farmakoloji . 235 (3): 296–304. doi : 10.1016/j.taap.2008.12.013 . PMID 19146867 .
Chen YM, Shiu JY, Tzeng SJ, Shih LS, Chen YJ, Lui WY, Chen PH (Mart 1998). "İnsan hepatoselüler karsinomunda glisin-N-metiltransferaz-gen ekspresyonunun karakterizasyonu". Uluslararası Kanser Dergisi . 75 (5): 787-93. doi : 10.1002/(sici)1097-0215(19980302)75:5<787::aid-ijc20>3.0.co;2-2 . PMID 9495250 .
Wagner C, Decha-Umphai W, Corbin J (Haziran 1989). "Fosforilasyon, bir folat bağlayıcı protein olan glisin N-metiltransferazın aktivitesini modüle eder. In vitro fosforilasyon, doğal folat ligandı tarafından inhibe edilir" . Biyolojik Kimya Dergisi . 264 (16): 9638-42. doi : 10.1016/S0021-9258(18)60578-2 . PMID 2722853 .
Wagner C, Decha-Umphai W, Corbin J (Haziran 1989). "Fosforilasyon, bir folat bağlayıcı protein olan glisin N-metiltransferazın aktivitesini modüle eder. In vitro fosforilasyon, doğal folat ligandı tarafından inhibe edilir" . Biyolojik Kimya Dergisi . 264 (16): 9638-42. doi : 10.1016/S0021-9258(18)60578-2 . PMID 2722853 .
Mudd SH, Ebert MH, Scriver CR (Ağustos 1980). "İnsanda kararsız metil grubu dengeleri: sarkozin rolü". Metabolizma . 29 (8): 707–20. doi : 10.1016/0026-0495(80)90192-4 . PMID 6157075 .
Mudd SH, Cerone R, Schiaffino MC, Fantasia AR, Minniti G, Caruso U, Lorini R, Watkins D, Matiaszuk N, Rosenblatt DS, Schwahn B, Rozen R, LeGros L, Kotb M, Capdevila A, Luka Z, Finkelstein JD , Tangerman A, Stabler SP, Allen RH, Wagner C (Ağustos 2001). "Glisin N-metiltransferaz eksikliği: kalıcı izole hipermetioninemiye neden olan yeni bir doğuştan hata". Kalıtsal Metabolik Hastalık Dergisi . 24 (4): 448-64. doi : 10.1023/A:1010577512912 . PMID 11596649 . S2CID 28155061 .
Luka Z, Cerone R, Phillips JA, Mudd HS, Wagner C (Ocak 2002). "İnsan glisin N-metiltransferazındaki mutasyonlar, metionin metabolizmasındaki rolüne dair fikir verir". İnsan Genetiği . 110 (1): 68-74. doi : 10.1007/s00439-001-0648-4 . PMID 11810299 . S2CID 9819456 .
Tseng TL, Shih YP, Huang YC, Wang CK, Chen PH, Chang JG, Yeh KT, Chen YM, Buetow KH (Şubat 2003). "Karaciğer kanserinde varsayılan bir tümör duyarlılık geni, GNMT'nin genotipik ve fenotipik karakterizasyonu". Kanser Araştırması . 63 (3): 647–54. PMID 12566309 .
Møller MT, Samari HR, Fengsrud M, Strømhaug PE, øStvold AC, Seglen PO (Temmuz 2003). "İzole sıçan hepatositlerinde glisin N-metiltransferazın okadaik asit kaynaklı, naringine duyarlı fosforilasyonu" . Biyokimya Dergisi . 373 (Pt 2): 505–13. doi : 10.1042/BJ20030502 . PMC 1223502 . PMID 12697024 .
Luka Z, Wagner C (Aralık 2003). "İnsan glisin N-metiltransferazında doğal olarak meydana gelen mutasyonların aktivite ve konformasyon üzerindeki etkisi". Biyokimyasal ve Biyofiziksel Araştırma İletişimi . 312 (4): 1067–72. doi : 10.1016/j.bbrc.2003.11.037 . PMID 14651980 .
Augoustides-Savvopoulou P, Luka Z, Karyda S, Stabler SP, Allen RH, Patsiaoura K, Wagner C, Mudd SH (2004). "Glisin N-metiltransferaz eksikliği: yeni bir mutasyona sahip yeni bir hasta" . Kalıtsal Metabolik Hastalık Dergisi . 26 (8): 745-59. doi : 10.1023/B:BOLI.0000009978.17777.33 . PMID 14739680 . S2CID 9179123 .
Beagle B, Yang TL, Hung J, Cogger EA, Moriarty DJ, Caudill MA (Aralık 2005). "Glisin N-metiltransferaz (GNMT) 1289 C->T varyantı, folat alımını kısıtladıktan sonra genç kadınlarda plazma toplam homosistein konsantrasyonlarını etkiler" . Beslenme Dergisi . 135 (12): 2780–5. doi : 10.1093/jn/135.12.2780 . PMID 16317120 .
Luka Z, Pakhomova S, Luka Y, Yeni Gelen ME, Wagner C (Eylül 2007). "H176N mutasyonu ile insan glisin N-metiltransferazın kararsızlaştırılması" . Protein Bilimi . 16 (9): 1957-64. doi : 10.1110/ps.072921507 . PMC 2206963 . PMID 17660255 .

Languages

In other projects