Farnesiltransferaz - Farnesyltransferase

Farnesiltransferazı ( EC 2.5.1.58 ), üç biridir enzimler de preniltransferaz grubu. Farnesiltransferazı (FTaz) 15 karbon ekler isoprenoit denen bir farnesil grubu için proteinler , bir CAAX taşıyan bir motif , bir dört: amino asit sekansının , karboksil terminalinde bir protein elde edilir. Farnesiltransferazın hedefleri, hücre döngüsü ilerlemesi için kritik önem taşıyan küçük GTP bağlayıcı proteinlerden oluşan Ras süper ailesinin üyelerini içerir . Bu nedenle, birkaç FTase inhibitörü , kanser önleyici maddeler olarak test edilmektedir. FTase inhibitörleri, anti-parazitik maddeler olarak da etkinlik göstermiştir. FTize da gelişmesinde önemli bir rol oynadığına inanılmaktadır Progeria ve çeşitli formlarda kanserler .

Farnesiltransferaz kimyasal reaksiyonu katalize eder

farnesil difosfat + protein-sistein S-farnezil proteini + difosfat${\ displaystyle \ rightleftharpoons}$

Bu durumda, iki alt-tabakalar , bu enzimin olan farnesil difosfat ve proteinsiz sistein iki ise, ürün olarak S-farnesil protein ve difosfat .

Genel Bakış

Farnesiltransferaz posttranslasyonel olarak proteinleri, bir tiyoeter bağlantısı oluşturmak için hedef proteinlerin sonuna yakın sisteinin -SH'sine farnesil grubu olarak adlandırılan bir izoprenoid lipidi ekleyerek modifiye eder . Farnesilasyon (bir tür prenilasyon olan ) adı verilen bu işlem, farnezil grubunun hidrofobik doğası nedeniyle farnesile proteinlerin membranla ilişkili hale gelmesine neden olur . Farnezile edilmiş proteinlerin çoğu, hücresel sinyallemede yer alır, burada membran birleşmesi işlev için kritiktir.

Farnesiltransferaz yapısı ve işlevi

Farnesiltransferazın iki alt birimi vardır : bir 48kDa alfa alt birimi ve bir 46kDa beta alt birimi . Her iki alt birim de öncelikle alfa sarmallarından oluşur . A alt birimi, beta alt biriminin etrafını bir örtü gibi kısmen saran, paralel olarak istiflenmiş çift katmanlı bir çift alfa sarmalından yapılmıştır. Β alt biriminin alfa sarmalları bir namlu oluşturur. Aktif site, a alt biriminin bir kısmı tarafından çevrelenen p alt biriminin merkezi tarafından oluşturulur. Farnesiltransferaz , aktif bölgenin dudağındaki β alt biriminde bir çinko katyonu koordine eder . Farnesiltransferaz, lipit donör molekülü olan farnesil difosfat için hidrofobik bir bağlanma cebe sahiptir . Tüm farnesiltransferaz substratları , dördüncü ila son kalıntıları olarak bir sisteine sahiptir . Bu sistein , çinko ve farnesil difosfat üzerinde geçici stabilize edici bir magnezyum iyonu tarafından koordine edilen ve difosfatın yerini alan bir SN2 tipi saldırıya geçer . Ürün, yeni substratlar ile yer değiştirene kadar farnesiltransferaza bağlı kalır. CaaX motifinin son üç amino asidi daha sonra çıkarılır.

Özgüllük

FTase'de, bir proteinin karboksil terminalindeki son dört amino asidi barındıran dört bağlanma cebi vardır. Yalnızca uygun bir CaaX motifine sahip olanlar bağlanabilir ('C' Sisteindir, 'a' alifatik bir amino asittir ve 'X' değişkendir). Karboksil terminal amino asit (X), FTase'nin hedeflerini diğer preniltransferazların hedeflerinden ayırır ve sadece altı farklı amino asidin herhangi bir afinite ile bağlanmasına izin verir. Gösterilmiştir Geranylgeranyltransferase Farnesiltransferaz ve tersi substratların bir prenylate olabilir.

Yapısal çalışmalar

2007'nin sonlarından itibaren, PDB erişim kodları 1S63 , 1S64 , 1SA4 , 1SA5 , 1TN6 , 1TN7 , 1TN8 , 1X81 , 2BED , 2F0Y , 2H6F , 2H6G , 2H6H , 2H6I ve 2IEJ ile bu enzim sınıfı için 15 yapı çözülmüştür. .

Ayrıca bakınız

• Farnesiltransferaz inhibitörü
• Geranilgeraniltransferaz tip 1 - aynı zamanda geranilgeraniltranferaz 1 veya sadece geranilgeraniltranferaz olarak da anılır
• Prenilasyon
• Rab geranilgeraniltransferaz - Geranilgeraniltransferaz tip 2

Referanslar

Dış bağlantılar

• EurekAlert: NIH, UNC bilim adamları kanser önleyici ilaçların ölümcül yaşlanma hastalığının tedavisinde işe yarayabileceğini buldu
• ABD Ulusal Tıp Kütüphanesi Tıbbi Konu Başlıkları'nda (MeSH) Farnesyltranstransferase
• EC 2.5.1.29