Endoglikozidaz H - Endoglycosidase H

Enzim Endoglikosidaz H ( EC 3.2.1.96 , Endo-β-N-asetilglukozaminidaz H , N, N'-diasetilkitobiosil beta-N-asetilglukosaminidaz , mannosil-glikoprotein endo-beta-N-asetilglukozamidaz , di-N-asetilbikoz -asetilglukozaminidaz , endo-beta-asetilglukozaminidaz , endo-beta- (1-> 4) -N-asetilglukosaminidaz , mannosil-glikoprotein 1,4-N-asetamidodeoksi-beta-D-glikohidrolaz , endoglikozidaz S , endo-N-asetil- beta-D-glukozaminidaz , endo-N-asetil-beta-glukozaminidaz , endo-beta-N-asetilglukozaminidaz D , endo-beta-N-asetilglukozaminidaz F , endo-beta-N-asetilglukozaminidaz H , endo-beta-N-asetilglukozaminidaz L , glikopeptit-D-mannozil-4-N- (N-asetil-D-glukosaminil) 2-asparagin 1,4-N-asetil-beta-glucosaminohydrolase , H, endoglikosidaz ) bir bir enzim ile sistematik ismi glikopeptid-D-mannozil -N4- (N-asetil-D-glukozaminil) 2-asparagin 1,4-N-asetil-beta-glukozaminohidrolaz . Asparagine bağlı mannoz bakımından zengin oligosakaritleri parçalayan , ancak glikoproteinlerden yüksek oranda işlenmiş kompleks oligosakaritleri olmayan oldukça spesifik bir endoglikosidazdır . Glikoproteinleri deglikosile etmek için araştırma amaçlı kullanılır.

Yapı ve Faaliyet

Endoglikosidaz H, Streptomyces plicatus veya Streptomyces griseus'tan izole edilir . Bu moleküler ağırlık 29 000 daltondur. Birincil yapı Robbins 1984 tarafından tanımlanmıştır.

Endoglikosidaz H , asparajin kalıntısına doğrudan proksimal olan iki N-asetilglukozamin (GlcNAc) alt birimi arasındaki oligosakaridin diasetilşitobiyoz çekirdeğindeki bağı keserek , asparajin üzerinde kalan bir N-asetilglukozamin kalıntısı ile kesilmiş bir şeker molekülü oluşturur.

Mannoz glikoproteinlerini deglikosilize eder, ancak deglikosilasyonun kapsamı ve hızı, glikoproteinlerin doğasına büyük ölçüde bağlıdır. Deglikosilasyon hızı, glikoproteinlerin denatürasyonu ile arttırılabilir (örneğin, karboksimetilasyon, sülfitoliz veya sodyum dodesil sülfat mevcudiyetinde ısıtma ile). 0.1 M 2-merkaptoetanol ilavesi, Triton X-100, n-Oktilglukosit veya zvitteriyonik deterjanlar gibi deterjanların aksine, moleküller arası veya moleküller arası disülfür köprüleri içeren glikoproteinlere karşı enzim aktivitesini oldukça artırır.

Biyokimyasal Uygulamalar

Endoglikosidaz H (Endo H) yaygın olarak izlemek için, hücre biyologlar tarafından kullanılan translasyon sonrası modifikasyonu olarak Golgi aygıtı . Hücre yüzeyi için tahsis Çoğu protein vardır tercüme ile ribozom kaba içine endoplazmik retikulum (ER) ve Golgi içerisine doğru. ER'ye girdikten sonra, 14 şeker alt birimi içeren bir molekül, enzim oligosakaril transferaz tarafından seçici bir şekilde bir asparagine en blok olarak bağlanır . Protein Golgi aygıtının farklı bölmelerinden geçerken bir dizi enzim tarafından modifiye edilen bu oligosakarit molekülüdür. Endoglikosidaz H, Golgi alfa-mannosidaz II enzimi iki mannoz alt birimini uzaklaştırana kadar işlenirken bu oligosakaridin her yapısını parçalayabilir . Daha sonraki tüm oligosakarit yapıları Endo H klevajına dirençli olduğundan, enzim, ilgili bir proteinin geçirdiği oligosakarit işleminin kapsamını bildirmek için yaygın olarak kullanılır.

Referanslar

Dış bağlantılar

• IUBMB Enzim İsimlendirme - EC 3.2.1.96

Yakın enzimler

Endoglikozidazlar F ve D, Glc- Nac'ı böler

PNGaz F (Peptid-N4- (N-asetil-beta-glukozaminil) asparagin_amidaz)