Alfakoronavirüs -Alphacoronavirus
| Alfakoronavirüs | |
|---|---|
|
|
| Domuz salgını ishal virüsü genomu ve virion yapısı | |
Virüs sınıflandırması 
|
|
| (rütbesiz): | Virüs |
| Bölge : | ribovirya |
| Krallık: | ortornavirler |
| filum: | Pisuviricota |
| Sınıf: | Pisoniviricetes |
| Emir: | Nidoviraller |
| Aile: | Coronavirüs |
| Alt aile: | ortokoronavirin |
| cins: | Alfakoronavirüs |
| Alt cinsler ve türler | |
Alphacoronaviruses ((Alfa-CoV), dört cinse ilk üyesi olan alfa -, Beta , Gamma- ve Delta- arasında) koronavirüsler . Bunlar pozitif anlamlı , tek sarmallı RNA virüsleri enfekte memeliler dahil insanlarda . Spike proteinin trimerleri tarafından oluşturulan kulüp şeklindeki yüzey çıkıntılarına ve viral bir zarfa sahip küresel viryonlara sahiptirler .
Alphacoronaviruses alt familyası olan Orthocoronavirinae ailesinin Koronavırıdae . Hem Alfa - ve Betacoronavirus soylar soyundan gelen bat viral gen havuzunda . Alfakoronavirüsler daha önce " filogrup 1 koronavirüsler" olarak biliniyordu .
etimoloji
Adı alphacoronavirus türetilmiştir Antik Yunanca ἄλφα ( alfa , "ilk harfi ait Yunan alfabesinin ") ve κορώνη (korṓnē, ‘çelenk, çelenk’), elektron mikroskobu altında görülen yüzey projeksiyonları görünümünü açıklar taç, anlam güneş koronasını andırıyor .
Yapı
Virion, 120-160 nm çapında ve yaklaşık 65 nm'lik bir çekirdek kabuğu olan zarflı ve küreseldir. Glikoproteinler ve trimerler, güneş korona görünümünü yaratan geniş yüzey çıkıntıları oluşturur. Bu cins, diğer koronavirüsler gibi, tip I füzyon makinesine (S2) ve bir reseptör bağlama alanına (S1) sahip bir başak proteinine sahiptir. Bir trimer halinde toplanır. Beta ve gammakoronavirüslerin aksine, bu protein ikiye bölünmez.
Genetik şifre
Genom, 27 ila 29 kilobaz uzunluğunda ve 3'-polyA kuyruğu olan pozitif anlamda , tek iplikli RNA'dır . İki büyük, üst üste binen ORF genomunun 5 'ucunda bir şekilde ifade edilen büyük yapısal olmayan proteinleri kodlayan füzyon proteini ile ribozomal çerçeve . Bunlar, proteaz , helikaz ve RNA polimeraz motifli bölgeleri içerir . Yapısal proteinleri kodlayan yedi gen daha var. Bunlar, 3'-koterminal iç içe geçmiş alt genomik mRNA'lardan ifade edilir .
rekombinasyon
Alphacoronavirus 1'in her iki tipi , kedi koronavirüsü (FCoV) ve köpek koronavirüsü (CCoV), iki serotipte var olduğu bilinmektedir. Serotip II , Aminopeptidaz N'yi hedeflerken , Serotip I için reseptör bilinmemektedir. Fark, farklı bir başak proteininden kaynaklanmaktadır. FCoV ve CCoV için ortak bir ata vardır. Bu ata, yavaş yavaş FCoV I ve CCoV I'e evrildi. Bilinmeyen bir virüsten gelen bir S proteini, ataya yeniden birleştirildi ve CCoV II'ye yol açtı. CCoV II, FCoV II'yi oluşturmak için bir kez daha FCoV ile yeniden birleştirildi. CCoV II yavaş yavaş TGEV'e evrildi. TGEV'deki bir ani silme, PRCV'yi oluşturur. Tüm bu virüsler Tegacovirus alt cinsine ayrılır .
sınıflandırma
Aşağıdaki alt türler ve türler tanınır:
| Koronavirüsler |
|---|
 |
Ayrıca bakınız
Referanslar
Dış bağlantılar