28S ribozomal RNA - 28S ribosomal RNA
28S ribozomal RNA , ökaryotik sitoplazmik ribozomların büyük alt birimi (LSU) için yapısal ribozomal RNA'dır (rRNA) ve dolayısıyla tüm ökaryotik hücrelerin temel bileşenlerinden biridir. Bitkilerde 25S ve memelilerde 28S boyutuna sahiptir, bu nedenle 25S–28S rRNA takma adıdır .
İle birlikte 5.8S rRNA 5' tarafına, bu ökaryotik nükleer homologudur prokaryotik 23S ve mitokondriyal 16S ribozomal RNA.
filogenide kullanın
28S rRNA'yı kodlayan genlere 28S rDNA denir. Bu genlerden gelen dizilerin karşılaştırılması, bazen , örneğin protistler , mantarlar , böcekler , tardigradlar ve omurgalılarda filogenetik ağaçları oluşturmak için moleküler analizde kullanılır .
Yapı
28S rRNA tipik olarak 4000-5000 nt uzunluğundadır.
Bazı ökaryotlar, 28S rRNA'yı her ikisini de ribozomda birleştirmeden önce iki parçaya böler, bu fenomene "gizli kırılma" denir.
veritabanları
Çeşitli veritabanı sağlayan hizalamalar ve açıklamaları boyunca LSU rRNA sıralarının karşılaştırma amacıyla:
- RDP, Ribozomal Veritabanı Projesi;
- SILVA, bir ribozomal RNA gen veritabanı projesi.